Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_033197.3
Sequence Length
1641 nt
GC Content
0.5545
GGGAGAGGAGAGGAGCGGGCCGAGGACUCCAGCGUGCCCAGGUCUGGCAUCCUGCACUUGCUGCCCUCUGACACCUGGGAAGAUGGCCGGCCCGUGGACCUUCACCCUUCUCUGUGGUUUGCUGGCAGCCACCUUGAUCCAAGCCACCCUCAGUCCCACUGCAGUUCUCAUCCUCGGCCCAAAAGUCAUCAAAGAAAAGCUGACACAGGAGCUGAAGGACCACAACGCCACCAGCAUCCUGCAGCAGCUGCCGCUGCUCAGUGCCAUGCGGGAAAAGCCAGCCGGAGGCAUCCCUGUGCUGGGCAGCCUGGUGAACACCGUCCUGAAGCACAUCAUCUGGCUGAAGGUCAUCACAGCUAACAUCCUCCAGCUGCAGGUGAAGCCCUCGGCCAAUGACCAGGAGCUGCUAGUCAAGAUCCCCCUGGACAUGGUGGCUGGAUUCAACACGCCCCUGGUCAAGACCAUCGUGGAGUUCCACAUGACGACUGAGGCCCAAGCCACCAUCCGCAUGGACACCAGUGCAAGUGGCCCCACCCGCCUGGUCCUCAGUGACUGUGCCACCAGCCAUGGGAGCCUGCGCAUCCAACUGCUGCAUAAGCUCUCCUUCCUGGUGAACGCCUUAGCUAAGCAGGUCAUGAACCUCCUAGUGCCAUCCCUGCCCAAUCUAGUGAAAAACCAGCUGUGUCCCGUGAUCGAGGCUUCCUUCAAUGGCAUGUAUGCAGACCUCCUGCAGCUGGUGAAGGUGCCCAUUUCCCUCAGCAUUGACCGUCUGGAGUUUGACCUUCUGUAUCCUGCCAUCAAGGGUGACACCAUUCAGCUCUACCUGGGGGCCAAGUUGUUGGACUCACAGGGAAAGGUGACCAAGUGGUUCAAUAACUCUGCAGCUUCCCUGACAAUGCCCACCCUGGACAACAUCCCGUUCAGCCUCAUCGUGAGUCAGGACGUGGUGAAAGCUGCAGUGGCUGCUGUGCUCUCUCCAGAAGAAUUCAUGGUCCUGUUGGACUCUGUGCUUCCUGAGAGUGCCCAUCGGCUGAAGUCAAGCAUCGGGCUGAUCAAUGAAAAGGCUGCAGAUAAGCUGGGAUCUACCCAGAUCGUGAAGAUCCUAACUCAGGACACUCCCGAGUUUUUUAUAGACCAAGGCCAUGCCAAGGUGGCCCAACUGAUCGUGCUGGAAGUGUUUCCCUCCAGUGAAGCCCUCCGCCCUUUGUUCACCCUGGGCAUCGAAGCCAGCUCGGAAGCUCAGUUUUACACCAAAGGUGACCAACUUAUACUCAACUUGAAUAACAUCAGCUCUGAUCGGAUCCAGCUGAUGAACUCUGGGAUUGGCUGGUUCCAACCUGAUGUUCUGAAAAACAUCAUCACUGAGAUCAUCCACUCCAUCCUGCUGCCGAACCAGAAUGGCAAAUUAAGAUCUGGGGUCCCAGUGUCAUUGGUGAAGGCCUUGGGAUUCGAGGCAGCUGAGUCCUCACUGACCAAGGAUGCCCUUGUGCUUACUCCAGCCUCCUUGUGGAAACCCAGCUCUCCUGUCUCCCAGUGAAGACUUGGAUGGCAGCCAUCAGGGAAGGCUGGGUCCCAGCUGGGAGUAUGGGUGUGAGCUCUAUAGACCAUCCCUCUCUGCAAUCAAUAAACACUUGCCUGUGA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-602.2 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -627.56
Frequency: 0.0000
Diversity: 283.46
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((((((.((((...((((((((((.(((((.(((..((((...((((....((....)))))).)))).))))))))(((.((((..(((.(((((((..((........)).))))))).))).)))).))).............((((((...)))).))......)))))))))).................(((((((((((..(((((.((((((....(((((..((((..((.((((((....))))))))(((((((((((......((((((((.((...))))).)))))(((((.((((....))))(((((.......((((.(((((((.(((((((.(((((..........)))))..))))..))).))))))))))).))))))))))..(((.((......)).)))(((((((((((.........(((.(.((((.....(((.((((....)))))))..))))).))))).))))))))))))))))).)))..))))..)))))..........)))))))))))..))))).((((((....((((((.((((((......))).)))...))))))....))))))......))))))..(((((..(((.((......))..))).)))))......((((((...(((((((((.((......(((((((((.(.((((((((...............((((((((((.((((.......))))))....(((((((.((((((.(((((((.(((((((((((.......))))).))).......(((((.....)))))..(((((((((((.(((..((........))..))))))))))))))((((((((((((((((.(((......((((((........))))))......)))..)))))).......).))))))))).(((((.((.((.(((((..((((....((.(((((....))))).))..))))..))))).)).)).))))))))))))))).)))))).).))))))....))))))))....((((((((...(((((((((((((((.....((((.(((...))).))))))))))).......((((((......))))))...........((.(((((((......((((((((........((((............)))).....((((((((((((.....((((...((((...))))...))))..................((((((((..(((...))).))))))))...)))))).))))))(((....)))(((((((......))))))))))))).)).....))))...))).))(((((........)))))......)))))))))))))))))))))))).).))))))))).....)).))))))).))..))))))..(((((....))))).((((((((((..(((((.((((..((((((((.((((((((((.(((....))).))).)))........)))).)))))))).))).).)))))..)))).))))))........)).)))))))))............(((......))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
.(((((((.((((...((((((((((.{((((.(((..((((...((((....{{....)))))).)))).))))))))(((.((((..(((.(((((((..{{........,}.))))))).))).)))).))).............((((((...)))).))......)))))))))).....,{......,...((((({(((((..((((,,((((((....(((((..((((.,((.((((((....))))))))|((((((((((......((((((((.((...})))).)))))(((((,{(((....}}},{{{{{.......{(({.(((((((.(((((((.(((((..........)))))..))))}.})).)))))))))))|)))},)))))..(((.{(......)).))){((((((((((.........(((.{.((((.....(((.((((....)))))))..))))).))))),,)))))))))))))))).))}..))))..)))))..........)))))))))))..))))).((((((....((((((.((((((......))).)))...))))))....))))))......})))))..(((((..(((.((......))..))).)))))......{(((((...(((((((((.((..,...(((((((((.{.(((((((({,...,{{{{.....||||(((((({,,,({{{{{{,...,||,...(((((({.((((((.(((((({,((({(((((((.......)))))}})},,..,,,((({{..,,,))))}..(((((((((((.(((..((........))..))))))))))))))((((((((((((((((.(((......((((((........))))))......)))..)))))).......),))))))))).(((((.((.((.(((((..((((....((.(((((....))))).))..))))..))))).)).)).))))))))))))))).)))))).).))))))...,))}}}}}}....|{((((((...{{((((((,{{,,||||..{((((.(((...))).))))}.............((((((......))))))...,,|,,|,.((,(({,({(,,,,.,,,,{|{||}||,.,,,||{{...........,)))),,}..,|||||||{(({.,,||((({...((((...))))...,},}.....{{,...,)}....((((((((..({{...}}}.))))))))...,}}}||,}|||}|(({,.,.,,,(((((((......))))))),,}})),)},,,.,))}}|||,,,.},(((({........)))))...,..)))))))))))))))))))))))).).))))))))).....)).))))))).))..))))))..(((((....))))).((((((((((..(((((.((((..((((((((.((((((((((.(((....))).))).)))),......)))).)))))))).))},).)))))..)))).))))))........)).))))))))).,..........(((......))).
Back