Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_153490.3
Sequence Length
1714 nt
GC Content
0.5823
ACAGUCCUCGGCCCAGGCCAAGCAAGCUUCUAUCUGCACCUGCUCUCAAUCCUGCUCUCACCAUGAGCCUCCGCCUGCAGAGCUCCUCUGCCAGCUAUGGAGGUGGUUUCGGGGGUGGCUCUUGCCAGCUGGGAGGAGGCCGUGGUGUCUCUACCUGUUCAACUCGGUUUGUGUCCGGGGGAUCAGCUGGGGGCUAUGGAGGCGGCGUGAGCUGUGGUUUUGGUGGAGGGGCUGGUAGUGGCUUUGGAGGUGGCUAUGGAGGUGGCCUUGGAGGUGGCUAUGGAGGUGGCCUUGGAGGUGGCUUUGGUGGGGGUUUUGCUGGUGGCUUUGUUGACUUUGGUGCUUGUGAUGGCGGCCUCCUCACUGGCAAUGAGAAGAUCACCAUGCAGAACCUCAACGACCGCCUGGCUUCCUACCUGGAGAAGGUGCGCGCCCUGGAGGAGGCCAACGCUGACCUGGAGGUGAAGAUCCGUGACUGGCACCUGAAGCAGAGCCCAGCUAGCCCUGAGCGGGACUACAGCCCCUACUACAAGACCAUUGAAGAGCUCCGGGACAAGAUCCUGACCGCCACCAUUGAAAACAACCGGGUCAUCCUGGAGAUUGACAAUGCCAGGCUGGCUGCGGACGACUUCAGGCUCAAGUAUGAGAAUGAGCUGGCCCUGCGCCAGAGCGUGGAGGCCGACAUCAACGGCCUGCGCCGGGUGCUGGAUGAGCUCACUCUGUCUAAGACUGACCUGGAGAUGCAGAUCGAGAGCCUGAAUGAAGAGCUAGCCUACAUGAAGAAGAACCAUGAAGAGGAGAUGAAGGAAUUUAGCAACCAGGUGGUCGGCCAGGUCAACGUGGAGAUGGAUGCCACCCCAGGCAUUGACCUGACCCGCGUGCUGGCAGAGAUGAGGGAGCAGUACGAGGCCAUGGCAGAGAGGAACCGCCGGGAUGCUGAGGAAUGGUUCCACACCAAGAGUGCAGAGCUGAACAAGGAGGUGUCUACCAACACUGCCAUGAUUCAGACCAGCAAGACAGAGAUCACGGAGCUCAGGCGCACGCUCCAAGGCCUGGAGAUUGAGCUGCAGUCCCAGCUGAGCAUGAAAGCGGGGCUGGAGAACACGGUGGCAGAGACGGAGUGCCGCUAUGCCCUGCAGCUGCAGCAGAUCCAGGGACUCAUCAGCAGCAUCGAGGCCCAGCUGAGCGAGCUCCGCAGUGAGAUGGAGUGCCAGAACCAAGAGUACAAGAUGCUGCUGGACAUCAAGACACGUCUGGAGCAGGAGAUCGCCACCUACCGCAGCCUGCUCGAGGGCCAGGACGCCAAGAUGAUUGGUUUCCCUUCCUCAGCAGGAAGCGUCAGCCCCCGUAGCACCUCUGUUACCACGACUUCUAGUGCCUCUGUUACCACCACCUCUAAUGCCUCUGGUCGCCGCACUUCUGAUGUCCGUAGGCCUUAAAUCUGCCUGGCGUCCCCUCCCUCUGUCUUCAGCACCCAGAGGAGGAGAGAGCCGGCAGUUCCCUGCAGGAGAGAGGAGGGGCUGCUGGACCCAAGGCUCAGUCCCUCUGCUCUCAGGACCCCCUGUCCUGACUCUCUCCUGAUGGUGGGCCCUCUGUGCUCUUCUCUUCCGGUCGGAUCUCUCUCCUCUCUGACCUGGAUACGCUUUGGUUUCUCAACUUCUCUACCCCAAAGAAAAGAUUAUUCAAUAAAGUUUCCUGCCUUUCUGCAAACAUA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-702.3 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -733.29
Frequency: 0.0000
Diversity: 323.56
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((.....(((..((((..(((...((((......((...((((((.(((.(((((((((((((.((((((.((((((((((((((((((((.((....)).))))...))))).))))).))).....))).))))))))))))(((((((.(((.((..(((((.......))))).)).))).))))))).((((.(((((...((((((((((((((.((((((((((((((((.((((...)))).))))).(((((.(((((.(((((.(((.....))).))))).))))).)))))(.(.((((((..(((((..((((((((......((((((.((.((((.(((((((((...(((..((((....((........))..))))..(..(((((...((((.....)))).)))))..))))...)))))))))..((((........)))).....)))).)).))))))...))))))))))))).)))))).).).......)))))))).)))))))))))).....)))))(((((.....))))).))))).))))..........(((((((.(((((((.(((.(...((((...))))....).))))))))))((((....))))..((((((.(.((.(((((.(.((((..((((((.......))))))))))).))))).)).).)))))).(((.....))).))))))))))).)))))).)))))).))...)))).))).)))).((((.........)))).(((((((.(((.((((((.(((.(((....)))...((((((((..(.(((((..((((((......))))))((.((((((...(((((((.(((.(.(((((((......((.((((.((((((((((..((..(((........((((...))))(((.((.((((((.(.((((((((.((.(((((......))))).)).)).))))((((((......((((.....(((((..((((((..((((((...((((((......((((((((.((((((..((......))..))))))......(((.((((.((.(((....))))).)))))))..))))))))...)))))).......((((((((((...(((...(((.((..((((((........)))))))))))......).))....))))))))))(((..........)))))))))(((((.(((........(((..((((((.(((((...(((.(((((.....))))).)))..)))))))))))..))).........((((((....))))))..)))))))).))))))..))).)).....)))).......))))))))))))))).)).))))))..))))))...)))))))))).))..)))))))).)))))))))).....(((((((((((((((.((..(((..(((((((((((((((((((..((.((...))))))))))))).....(((((((.....))))))))))))))))).....)))..))))).)))).)))))))))))))).))..))))).)..))))))))....)))..))))))))).))))))).......((.(((..((((...))))..))).)))))...)))........
Thermodynamic Ensemble Prediction
.,,{,,,,,(((....)))..((.((({{({.{{..{,...((((((.(({,(((((((((((((.((((((.((((((((((((((((((((.((....)).)))}..}))))).)))))},)).....))).))))))))))))(((((((.(((.((..(((((.......))))).)).))).))))))).((((.(((((...((((((((((((({,((((((((((((((((.((((..,,|||.|||||.{{(((.(((((.(((((.(((.....))).))))).))))).)))))(.(.((((((..(((({.{((((((((......((((((.((.((((.(((((((((...(((..((((..,.{{........}}..)))}..{..(((((..{((((.....)))).))))).},)))...)))))))))..,,{(.,{{....))),.....)))).)).)))))).,.))))))))))))).)))))).).)....,,,)))))))).)))))))))))).....)))))(((((.....))))).))))).)))).........((((((((.((((({{.{{{.,...{|||,,.)))),.,}).}}}}}}||||,(({.,,.,}||{.((((((.(.((.(((((.(.((((..((((((.......))))))))))).))))).)).).)))))).}}},,|...})}))))))))))).)))))).)))))).,)...)})))))).))...((((.........)))).{|{((((.{(,{(({,...,{.{((((((((.....((((((((..(.(((((.(((({((,,,.,,|}}},,,,,|||{{(.{.(((((((.(((.(.(((((((..,...((.((((.(((((({{((,,((.,({({...,,{,{{..||||}}}.,{,({.((((((.(.((((((((.((.(((((......))))).)).)).))))|{{{{{...,.,((((.....(((((..((((((..((((((,{.((((((..{{..(((((((({((((((..((......))..)))))).}....(((.((((.((.(((....))))).)))))))..))))))))...))))))..,,...((((((((((...((,...(((.((..((((((,.....,.)))))))))))......).))....)))))))))){{{..........}))))))))(((((.(((....,,..(((..((((((.(((((...(((.(((((.....))))).)))..)))))))))))..)))..,}.....((((({....))))))..)))))))).))))))..))).)).....))))..,},,,)))))}))})}}))),}).,})))}..)))}))...)))))))))).))..)))))))).)))))))))).,...(((((((((((((((.{(.,(((..(((((((((((((((((((..{(.({...)))}))))))))).....(((((((.....)))))))))))))))))..,,.)))..}}))).)))),,))))))))))})),))}.))))).)..))))))))...))))}}))))}))}).)))))))........|,...|,,...,,......,}},,,|||,...,,),,......
Back