Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_172167.3
Sequence Length
1541 nt
GC Content
0.6768
AGUCUUGCACGCCUCCAGGGCUGGAAAGCUCAUUCUUCUUCUUCCUCCCAGCAGCUCUGCCUGGAAGUCCCCCAAUCCCUGUGCUCCUGCCCCCAGAUCGUGGGCUUGGGGGACAGCAAGAAAGCUGCAAAGGACUCAGCUGGGGCGGCUCCACAAGGACCCCACAGGCUUGAGGUGUUGCCAGGAUUCUAUCCCAGGGGGUUUUCUGGGUCCCCCAGAGCCCUCUCAAGCACGGGGAGGCAGAAGGGUCCUCGCCCAUUUCAGGAAUCUGCAGCCUGGAAGCCACAGCCAUGGCAGGCCCCCGAUACCCAGUUUCAGUGCAAGGGGCAGCCCUGGUGCAGAUCAAGAGGCUCCAAACGUUUGCCUUCUCUGUGCGCUGGUCAGACGGCAGCGACACCUUCGUGCGCAGGAGUUGGGACGAAUUCAGGCAGCUCAAGAAGACCCUCAAGGAGACCUUCCCGGUGGAGGCGGGCCUGCUGCGGAGAUCUGACCGCGUUCUCCCAAAGCUUCUCGAUGCACCACUGUUGGGACGCGUGGGGCGCACGAGCCGCGGCCUGGCGCGCCUGCAGCUGUUGGAAACCUAUUCUCGGAGGCUGCUGGCGACUGCAGAGCGCGUGGCACGGAGCCCGACGAUCACUGGCUUCUUCGCACCGCAACCCCUGGACCUGGAGCCCGCGCUGCCACCCGGCAGCCGGGUGAUCCUGCCCACCCCAGAGGAGCAGCCUCUUUCUCGCGCUGCGGGCCGCCUCUCCAUCCACAGUCUGGAGGCUCAGAGCCUGCGCUGCCUGCAGCCCUUCUGUACCCAGGACACGCGGGAUAGGCCUUUUCAGGCGCAGGCCCAGGAGAGCCUGGACGUGCUGCUGCGGCACCCCUCAGGCUGGUGGCUGGUGGAGAACGAAGACCGGCAGACCGCCUGGUUUCCAGCGCCCUACCUGGAGGAGGCGGCCCCGGGCCAAGGCCGGGAGGGAGGCCCGUCCCUAGGGAGCAGCGGUCCCCAGUUCUGUGCUUCCCGCGCCUACGAGAGCAGCCGCGCAGAUGAGCUGUCCGUGCCCGCGGGGGCGCGCGUGCGCGUGUUGGAAACGUCAGACCGCGGCUGGUGGCUAUGCAGGUACGGCGACCGGGCGGGCCUACUCCCCGCGGUGCUGCUGCGGCCGGAAGGGCUGGGCGCUCUCCUGAGCGGGACGGGGUUCCGUGGAGGAGACGACCCGGCGGGUGAGGCCCGGGGCUUCCCUGAACCCUCCCAGGCCACCGCCCCUCCCCCCACCGUGCCCACCCGACCUUCGCCGGGCGCCAUCCAGAGCCGCUGCUGCACCGUCACACGCAGGGCCCUGGAGCGGCGCCCACGGCGCCAGGGCCGCCCUCGAGGGUGCGUGGACUCUGUGCCGCACCCCACGACGGAGCAGUGAGCGCGAGGAUCCCGAUGAGGGGAUGGACCGCGCCAUCCCAGGGCUGGGGAGGAGCGGGGAGGGCGGAUCUCCCUGGCCAGCAGGGAUGGGAGGGGGCCAUUUGCUGUUCCUCUGAGUAAAGCUUGUUCUGCAUGA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-752.9 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -778.6
Frequency: 0.0000
Diversity: 370.44
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((..(((.((((((.(((((....)))))................((((((((((((((((((.....((((((.(((((((((((.(((((((.((...)).))))))).((((......))))...))))...((((.(((.((.(((....))))))).).)))).((((((((((..((((...)))).(((((((..((((((...)))))))))))))...(((((((((((((((.((((....)))).(((((((.........)))))))((((......))))..(((((...(((.........)))...)))))(((((((((....))).)).)))).......))))))))).))))))((((......)))).))))))))))...))))))).)))))).....))))))))).........(((...((((...))))...)))(.(((((.(((.(((((((....((....((((...((((..((.(((((((........))))))).)).))))))))...)))))))))..))).))))).))))))))))............))))))))).)))...(((((((((((..((..((((((.(.......).))))))...))..)))......(((.(..((((((((.((((((....)))))))))))..))).).)))...(((((((((((((((((((((((.(((.((((((((((((((......((((((((((.....((((((((((((((...((((((((....))))).....))).))))).......)))))))))(((((....)))))..((((((...))))))....(((((.(((.((((((...........))))))..)))))))))))))))).))......)))).)))))))))))))))...(((((((((((((((((((((...(((((((.(((.........))))))))))((((.(((((....((((((((((...........(((((((....)))))))..)))))).))))....))).))..))))...(((.(((..........))).)))))))))))))..((((((((((...)))))))..)))...((((((((.((((((..(((((((...)))))))..)))))))).))))))(((.((((((...)))))))))...))))))).)))).((((((.(((((.(.((.(.(((((((..(((.(((((((((((.(((((.(((.((((((........)).))))))).)))))..)))))))..))))..)))...(((((((.(((((((.(.((...)).))))))))..))).)).)).(((.(((((...(((((......)))))....))))))))....))).)))).))).).)))))))))))...((((((.....)))))).)))))))))......))))))))))))..........))))))))...
Thermodynamic Ensemble Prediction
.(((..(((.((((((.(((((....)))))................((((((((((((((((((.,{{.((((((.((((((({(((.(((((((..,...,}.))))))).((((......))))...}}}}..,(((({,((.((.(((....))))))).}.)))).{(((((((((..((((...}))).(((((((..((((((...)))))))))))))...(((((((((((((((.(((,{{{{,}||..,,,,||.,{{{{{,.|||||,.{{{,..,,,,,|||..(((((...(((.........)))...))))).}}),|)))}}}})),..)})),}}}.....))))))))))))))))((((......)))).)))))))))}...))))))).)))))),,...))))))))),,,..,..,,,{,,,.,{|,,,||}}...)))(.(((((.(((.(((((((....{,....((((..,((((..((.(((((((,......,))))))).)).)))))))).}}},)))))))..))).))))).))))))))))............))))))))).))},,}{((((((((((,{({..((((((.(.......,.)))))).,.)).,)))......{((.,..((((((((.((((((....)))))))))))..))).}.))}...((((((((((((,,{{,{{{(((.{,|}|(((({(((({((({{{...((((((((((,,..,{(((({(,(((({({{{(....{(({.,,|}}}.,,},,))),}})||||....})))||||||(((((.,.,|||||.,{|||{|,,,)))))}..,.}})}||((({(((({(({,.......,||||||...}}))),))))))))},}},,,.{{|||||||||}||||||||||{..({((((((({{((((((((((,..((((((,,{((,,,...,..}|||||||||{(((,{((({.{.,(((((({,,,,.,}.})})}}||||{,|}}},))))))),,.,|{|{.{{{,{,..,.)}.))))))}}}}{||,|||.,,...})}.))),})})))))))))).}||||((((((...))))))}{{,,..)}((((((((.((((((..(((((((...)))))))..)))))))).))))))||{},,||||}}})))),})))...})))))),))}}.(((({(((((((.{.((.{.(((((((,.(((,(((((((((((.(((((.(((.((((((........)).))))))).)))))..)))))))..))))..}))}..(((((((.(((((((.(.((...)).))))))))..))).)).)).(((.(((((...(((((......)))))....))))))))....))).)))).))).).))))))))))).,,||||||}}}.,))))))}))))))}))},....)))))))))))).|,...,,..)))))))}...
Back