Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_178352.3
Sequence Length
460 nt
GC Content
0.6435
AUCCACUCACCUCCUGAGGUGCUAAAGAACCCUGUGCUGCCUGUGACUCCGCUCCUGAACACCCACCACCGAGAUGUCCUGCCAGCAGAGCCAGCAGCAGUGCCAGCCCCCUCCCAAGUGCACUCCCAAGUGCACUCCCAAGUGCCCCGCCCCUAAAUGUCCCCCUAAGUGCCCUCCAGUCUCUUCCUGCUGCAGUGUCAGCUCCGGAGGCUGCUGUGGCUCCAGCUCUGGGGGCGGCUGUGGCUCCAACUCUGGGGGCUGCUGCAGCUCUGGGGGUGGUGGCUGCUGCCUGAGCCACCACAGGCGCCACAGGUCCCACCGUCGCAGACCCCAGAGCUCUGACUGCUGCAGCCAGCCCUCGGGGGGCUCCAGCUGCUGCGGUGGGGGCAGCAGCCAGCACUCUGGAGGCUGCUGCUGAAGUGGACCUUGACUUCCUCUUCCUUCUGAUUCUGCCUGAAUA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-201.9 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -208.75
Frequency: 0.0000
Diversity: 70.49
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.....((((((......(((........)))((.(((((.(.(.(((((((....((......))....)).)).)))).).))))).))...((((((((...((((((((....((((((((....)))))))).......((((.(((.......(.(((((..(((((((..((((((((....((((......))))...))))))))..).)))....)))..))))))))).).))).........(((((((((((((((((((((((((((((((........)))))))))..(((..((.(((...))))))))...))))))).........))))))).))))))))))))))))...))))))))))))))((((((((((..((...))..))))))))))((((.(((........))).))))......((((.....)))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
..,,,((((((,....}|||}.......,,}((.(((((.{.(.(((((((.,..((......}}....)).)}.)))).).))))).))...((((((((...((((((({....((((((((....)))))))).....{.((((,(((.......(.(((((..(((((((..((((((((....((((......))))...))))))))..).)))....)))..))))))))}.).)))........,(((((((((((((((((((((((((((((((........)))))))))..({(,.{{.(({...}))}}}))...)))))))}}.......,,})))),})))))))))))))))...))))))))))))))((((((((((..({...})..))))))))))((((.(((........))).))))......((((.....)))).
Back