Basic Information

Symbol
SNORD3C
RNA Class
snoRNA
Alias
Small Nucleolar RNA, C/D Box 3C RNU3-3 U3-3 U3 Small Nucleolar RNA C U3 SnoRNA C NONHSAG021095.2 HSALNG0115091 Lnc-GRAP-7 SnoDB0847 SNORD3@
Location (GRCh38)
17:19189665-19190245
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Forensic psychiatry evaluation
External database
HGNC NCBI Ensembl RNAcentral

Sequence & Structure

Transcript
SNORD3C
Sequence length
581 nt
GC content
0.5491

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-224.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -232.40 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 72.12
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Summary

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Forensic Context

A review of human postmortem brain studies found that the SNORD3C was upregulated in the anterior cingulate cortex of subjects with major depressive disorder who died by suicide [Yoshino & Dwivedi DOI:10.3389/fpsyt.2020.543893].