Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_ABCA1_0001800

Sequence Length

2026 nt

GC Content

0.4896

AAUCCAGAGAGACAGACUUGCUCAGUGGGAUGGAUGGCAAAGGGUCCUACCAGGUGAAAGGCUGGAAACUUACACAGCAACAGUUUGUGGCCCUUUUGUGGAAGAGACUGCUAAUUGCCAGACGGAGUCGGAAAGGAUUUUUUGCUCAGAUUGUCUUGCCAGCUGUGUUUGUCUGCAUUGCCCUUGUGUUCAGCCUGAUCGUGCCACCCUUUGGCAAGUACCCCAGCCUGGAACUUCAGCCCUGGAUGUACAACGAACAGUACACAUUUGUCAGCAAUGAUGCUCCUGAGGACACGGGAACCCUGGAACUCUUAAACGCCCUCACCAAAGACCCUGGCUUCGGGACCCGCUGUAUGGAAGGAAACCCAAUCCCAGACACGCCCUGCCAGGCAGGGGAGGAAGAGUGGACCACUGCCCCAGUUCCCCAGACCAUCAUGGACCUCUUCCAGAAUGGGAACUGGACAAUGCAGAACCCUUCACCUGCAUGCCAGUGUAGCAGCGACAAAAUCAAGAAGAUGCUGCCUGUGUGUCCCCCAGGGGCAGGGGGGCUGCCUCCUCCACAAAGAAAACAAAACACUGCAGAUAUCCUUCAGGACCUGACAGGAAGAAACAUUUCGGAUUAUCUGGUGAAGACGUAUGUGCAGAUCAUAGCCAAAAGCUUAAAGAACAAGAUCUGGGUGAAUGAGUUUAGGUAUGGCGGCUUUUCCCUGGGUGUCAGUAAUACUCAAGCACUUCCUCCGAGUCAAGAAGUUAAUGAUGCCAUCAAACAAAUGAAGAAACACCUAAAGCUGGCCAAGGACAGUUCUGCAGAUCGAUUUCUCAACAGCUUGGGAAGAUUUAUGACAGGACUGGACACCAAAAAUAAUGUCAAGGUGUGGUUCAAUAACAAGGGCUGGCAUGCAAUCAGCUCUUUCCUGAAUGUCAUCAACAAUGCCAUUCUCCGGGCCAACCUGCAAAAGGGAGAGAACCCUAGCCAUUAUGGAAUUACUGCUUUCAAUCAUCCCCUGAAUCUCACCAAGCAGCAGCUCUCAGAGGUGGCUCUGAUGACCACAUCAGUGGAUGUCCUUGUGUCCAUCUGUGUCAUCUUUGCAAUGUCCUUCGUCCCAGCCAGCUUUGUCGUAUUCCUGAUCCAGGAGCGGGUCAGCAAAGCAAAACACCUGCAGUUCAUCAGUGGAGUGAAGCCUGUCAUCUACUGGCUCUCUAAUUUUGUCUGGGAUAUGUGCAAUUACGUUGUCCCUGCCACACUGGUCAUUAUCAUCUUCAUCUGCUUCCAGCAGAAGUCCUAUGUGUCCUCCACCAAUCUGCCUGUGCUAGCCCUUCUACUUUUGCUGUAUGGGUGGUCAAUCACACCUCUCAUGUACCCAGCCUCCUUUGUGUUCAAGAUCCCCAGCACAGCCUAUGUGGUGCUCACCAGCGUGAACCUCUUCAUUGGCAUUAAUGGCAGCGUGGCCACCUUUGUGCUGGAGCUGUUCACCGACAAUAAGCUGAAUAAUAUCAAUGAUAUCCUGAAGUCCGUGUUCUUGAUCUUCCCACAUUUUUGCCUGGGACGAGGGCUCAUCGACAUGGUGAAAAACCAGGCAAUGGCUGAUGCCCUGGAAAGGUUUGGGGAGAAUCGCUUUGUGUCACCAUUAUCUUGGGACUUGGUGGGACGAAACCUCUUCGCCAUGGCCGUGGAAGGGGUGGUGUUCUUCCUCAUUACUGUUCUGAUCCAGUACAGAUUCUUCAUCAGGCCCAGACCUGUAAAUGCAAAGCUAUCUCCUCUGAAUGAUGAAGAUGAAGAUGUGAGGCGGGAAAGACAGAGAAUUCUUGAUGGUGGAGGCCAGAAUGACAUCUUAGAAAUCAAGGAGUUGACGAAGAUAUAUAGAAGGAAGCGGAAGCCUGCUGUUGACAGGAUUUGCGUGGGCAUUCCUCCUGGUGAGUGCUUUGGGCUCCUGGGAGUUAAUGGGGCUGGAAAAUCAUCAACUUUCAAGAUGUUAACAGGAGAUACCACUGUUACCAGAGGAGAUGCUUUCCUUAACAAAAAUAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-631.70 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -671.48

Frequency: 0.0000

Diversity: 409.81

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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