Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_ABCA1_0004600
Sequence Length
285 nt
GC Content
0.5333
AGACACGCCCUGCCAGGCAGGGGAGGAAGAGUGGACCACUGCCCCAGUUCCCCAGACCAUCAUGGACCUCUUCCAGAAUGGGAACUGGACAAUGCAGAACCCUUCACCUGCAUGCCAGUGUAGCAGCGACAAAAUCAAGAAGAUGCUGCCUGUGUGUCCCCCAGGGGCAGGGGGGCUGCCUCCUCCACAAAGAAAACAAAACACUGCAGAUAUCCUUCAGGACCUGACAGGAAGAAACAUUUCGGAUUAUCUGGUGAAGACGUAUGUGCAGAUCAUAGCCAAAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-83.20 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -88.86
Frequency: 0.0001
Diversity: 56.25
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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