Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_ABCA1_0005600
Sequence Length
389 nt
GC Content
0.5167
UGUUGGCUUCUUGCAGAAUCCAGAGAGACAGACUUGCUCAGUGGGAUGGAUGGCAAAGGGUCCUACCAGGUGAAAGGCUGGAAACUUACACAGCAACAGUUUGUGGCCCUUUUGUGGAAGAGACUGCUAAUUGCCAGACGGAGUCGGAAAGGAUUUUUUGCUCAGAUUGUCUUGCCAGCUGUGUUUGUCUGCAUUGCCCUUGUGUUCAGCCUGAUCGUGCCACCCUUUGGCAAGUACCCCAGCCUGGAACUUCAGCCCUGGAUGUACAACGAACAGUACACAUUUGUCAGCAAUGAUGCUCCUGAGGACACGGGAACCCUGGAACUCUUAAACGCCCUCACCAAAGACCCUGGCUUCGGGACCCGCUGUAUGGAAGGAAACCCAAUCCC

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-105.20 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -112.58
Frequency: 0.0000
Diversity: 131.17
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((.((((...)))).))).....)))(.......(((((((.(.((.(((..((((((......(((((..(((((.(.((..(((((((..((((((.(..(((....).)).).))))))......((.((((((((.((((((....)))))))))....))))).))..)))))))..)).).))...(((.(((.(((((.(((.((((((((.....))))..((((.((((.((((....))))..))))..)))).)))).)))............((((....)))).))))).))).)))...................))).)))))...)))))).))))).)..)))))))...(((.((....))..))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
,{((((.((((,.,||,,.|||,.{{{,{|,.,.,||,{((((((.(.({.(((..((((((.,....(((((..((({(.(.((..(((((((..((((((.{..{((....}.)).}.))))))......((.((((((((,((((({....)))))))))....))))).))..)))))))..)).},||,,,{,{.{(({(|||{,{{{.((((((((.....)))),.((((.((((.((({....})))..))))..)))).,}}}.}}),}}},,...},.{|||,}}.}},|.|||||.,|,{|||...,,}||...,,......}}}.})}))...)))))),))))),),.)))))))...||}}||....))},),.,
Back