Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_ABCA1_0005900
Sequence Length
263 nt
GC Content
0.5095
AUGGUACCUUGCCAGCAAGACGAAACAGGCGGGCCUUCGGGGACAAGCAGAGCUGUCUUCGCCCGUUCACUGAAGAUGAUGCUGCUGAUCCAAAUGAUUCUGACAUAGACCCAGAAUCCAGAGAGACAGACUUGCUCAGUGGGAUGGAUGGCAAAGGGUCCUACCAGGUGAAAGGCUGGAAACUUACACAGCAACAGUUUGUGGCCCUUUUGUGGAAGAGACUGCUAAUUGCCAGACGGAGUCGGAAAGGAUUUUUUGCUCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-72.10 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -78.19
Frequency: 0.0001
Diversity: 54.91
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((((...))))).(.........(((((((((....(((((((.((...)))))))))))))))...)))....(((.((....(((((...((((((((........(((...((((..(((.((....)))))..)))).))).((((((((((((((.(((.(.(((.(((((.(((((...........))))).))))).)))).))).)).)))).))..))))))..))))))))....)))))....))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
.(((({...})))},{,{{........{((((((....(((((({,((...)))))))))))))))|((((({.,.,,,.,({{{(,.((,....(((((((.........))))))),,,,,|}.)))...}})))))))}..|(..(((((({(((((((.(((.,.(((,(((((.(((((...........))))).))))).)))).))).)).)))).)}..))))))..)}{(({(,.....))))))))))),..
Back