Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_ABCA1_0006600
Sequence Length
2925 nt
GC Content
0.5251
CUGUUCAGCAUGAGAAGCUGGAGUGACAUGCGACAGGAGGUGAUGUUUCUGACCAAUGUGAACAGCUCCAGCUCCUCCACCCAAAUCUACCAGGCUGUGUCUCGUAUUGUCUGCGGGCAUCCCGAGGGAGGGGGGCUGAAGAUCAAGUCUCUCAACUGGUAUGAGGACAACAACUACAAAGCCCUCUUUGGAGGCAAUGGCACUGAGGAAGAUGCUGAAACCUUCUAUGACAACUCUACAACUCCUUACUGCAAUGAUUUGAUGAAGAAUUUGGAGUCUAGUCCUCUUUCCCGCAUUAUCUGGAAAGCUCUGAAGCCGCUGCUCGUUGGGAAGAUCCUGUAUACACCUGACACUCCAGCCACAAGGCAGGUCAUGGCUGAGGUGAACAAGACCUUCCAGGAACUGGCUGUGUUCCAUGAUCUGGAAGGCAUGUGGGAGGAACUCAGCCCCAAGAUCUGGACCUUCAUGGAGAACAGCCAAGAAAUGGACCUUGUCCGGAUGCUGUUGGACAGCAGGGACAAUGACCACUUUUGGGAACAGCAGUUGGAUGGCUUAGAUUGGACAGCCCAAGACAUCGUGGCGUUUUUGGCCAAGCACCCAGAGGAUGUCCAGUCCAGUAAUGGUUCUGUGUACACCUGGAGAGAAGCUUUCAACGAGACUAACCAGGCAAUCCGGACCAUAUCUCGCUUCAUGGAGUGUGUCAACCUGAACAAGCUAGAACCCAUAGCAACAGAAGUCUGGCUCAUCAACAAGUCCAUGGAGCUGCUGGAUGAGAGGAAGUUCUGGGCUGGUAUUGUGUUCACUGGAAUUACUCCAGGCAGCAUUGAGCUGCCCCAUCAUGUCAAGUACAAGAUCCGAAUGGACAUUGACAAUGUGGAGAGGACAAAUAAAAUCAAGGAUGGGUACUGGGACCCUGGUCCUCGAGCUGACCCCUUUGAGGACAUGCGGUACGUCUGGGGGGGCUUCGCCUACUUGCAGGAUGUGGUGGAGCAGGCAAUCAUCAGGGUGCUGACGGGCACCGAGAAGAAAACUGGUGUCUAUAUGCAACAGAUGCCCUAUCCCUGUUACGUUGAUGACAUCUUUCUGCGGGUGAUGAGCCGGUCAAUGCCCCUCUUCAUGACGCUGGCCUGGAUUUACUCAGUGGCUGUGAUCAUCAAGGGCAUCGUGUAUGAGAAGGAGGCACGGCUGAAAGAGACCAUGCGGAUCAUGGGCCUGGACAACAGCAUCCUCUGGUUUAGCUGGUUCAUUAGUAGCCUCAUUCCUCUUCUUGUGAGCGCUGGCCUGCUAGUGGUCAUCCUGAAGUUAGGAAACCUGCUGCCCUACAGUGAUCCCAGCGUGGUGUUUGUCUUCCUGUCCGUGUUUGCUGUGGUGACAAUCCUGCAGUGCUUCCUGAUUAGCACACUCUUCUCCAGAGCCAACCUGGCAGCAGCCUGUGGGGGCAUCAUCUACUUCACGCUGUACCUGCCCUACGUCCUGUGUGUGGCAUGGCAGGACUACGUGGGCUUCACACUCAAGAUCUUCGCUAGCCUGCUGUCUCCUGUGGCUUUUGGGUUUGGCUGUGAGUACUUUGCCCUUUUUGAGGAGCAGGGCAUUGGAGUGCAGUGGGACAACCUGUUUGAGAGUCCUGUGGAGGAAGAUGGCUUCAAUCUCACCACUUCGGUCUCCAUGAUGCUGUUUGACACCUUCCUCUAUGGGGUGAUGACCUGGUACAUUGAGGCUGUCUUUCCAGGCCAGUACGGAAUUCCCAGGCCCUGGUAUUUUCCUUGCACCAAGUCCUACUGGUUUGGCGAGGAAAGUGAUGAGAAGAGCCACCCUGGUUCCAACCAGAAGAGAAUAUCAGAAAUCUGCAUGGAGGAGGAACCCACCCACUUGAAGCUGGGCGUGUCCAUUCAGAACCUGGUAAAAGUCUACCGAGAUGGGAUGAAGGUGGCUGUCGAUGGCCUGGCACUGAAUUUUUAUGAGGGCCAGAUCACCUCCUUCCUGGGCCACAAUGGAGCGGGGAAGACGACCACCAUGUCAAUCCUGACCGGGUUGUUCCCCCCGACCUCGGGCACCGCCUACAUCCUGGGAAAAGACAUUCGCUCUGAGAUGAGCACCAUCCGGCAGAACCUGGGGGUCUGUCCCCAGCAUAACGUGCUGUUUGACAUGCUGACUGUCGAAGAACACAUCUGGUUCUAUGCCCGCUUGAAAGGGCUCUCUGAGAAGCACGUGAAGGCGGAGAUGGAGCAGAUGGCCCUGGAUGUUGGUUUGCCAUCAAGCAAGCUGAAAAGCAAAACAAGCCAGCUGUCAGGUGGAAUGCAGAGAAAGCUAUCUGUGGCCUUGGCCUUUGUCGGGGGAUCUAAGGUUGUCAUUCUGGAUGAACCCACAGCUGGUGUGGACCCUUACUCCCGCAGGGGAAUAUGGGAGCUGCUGCUGAAAUACCGACAAGGCCGCACCAUUAUUCUCUCUACACACCACAUGGAUGAAGCGGACGUCCUGGGGGACAGGAUUGCCAUCAUCUCCCAUGGGAAGCUGUGCUGUGUGGGCUCCUCCCUGUUUCUGAAGAACCAGCUGGGAACAGGCUACUACCUGACCUUGGUCAAGAAAGAUGUGGAAUCCUCCCUCAGUUCCUGCAGAAACAGUAGUAGCACUGUGUCAUACCUGAAAAAGGAGGACAGUGUUUCUCAGAGCAGUUCUGAUGCUGGCCUGGGCAGCGACCAUGAGAGUGACACGCUGACCAUCGAUGUCUCUGCUAUCUCCAACCUCAUCAGGAAGCAUGUGUCUGAAGCCCGGCUGGUGGAAGACAUAGGGCAUGAGCUGACCUAUGUGCUGCCAUAUGAAGCUGCUAAGGAGGGAGCCUUUGUGGAACUCUUUCAUGAGAUUGAUGACCGGCUCUCAGACCUGGGCAUUUCUAGUUAUGGCAUCUCAGAGACGACCCUGGAAGAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1055.80 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1107.57
Frequency: 0.0000
Diversity: 1050.52
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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