Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_ABCA1_0006700
Sequence Length
276 nt
GC Content
0.5254
GAGGACAGUGUUUCUCAGAGCAGUUCUGAUGCUGGCCUGGGCAGCGACCAUGAGAGUGACACGCUGACCAUCGAUGUCUCUGCUAUCUCCAACCUCAUCAGGAAGCAUGUGUCUGAAGCCCGGCUGGUGGAAGACAUAGGGCAUGAGCUGACCUAUGUGCUGCCAUAUGAAGCUGCUAAGGAGGGAGCCUUUGUGGAACUCUUUCAUGAGAUUGAUGACCGGCUCUCAGACCUGGGCAUUUCUAGUUAUGGCAUCUCAGAGACGACCCUGGAAGAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-83.40 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -88.49
Frequency: 0.0003
Diversity: 57.71
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((....(((((((.(((......((..((((((((.((((..((((((((((((.((((((........)).)))).)).))...(((..........)))..)))).))).)..))))))))))))..))(((((((.((.....)).)))))))..(((((((.((((.((((.(((.(((((((.((((.((.(((......))).)).))))..)))))))...))).))))))))....)))))))))).)))))))..))).......
Thermodynamic Ensemble Prediction
,(((,...,{{|||||{({,...,|{{,.,(((((((.((((..(((((((({{((.((((((........)).)))).)).}}...,{{..,,.....,))}..)))).))).)..)))))))))))}..}|(((((((,(,...,.,,.))))))).,{((((((.((((.((((.(((.(((((((.((((.((.(((......))).)).))))..)))))))...))).))))))))....))))))},}}|}))})},..})),......
Back