Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_ABCA1_0006800
Sequence Length
432 nt
GC Content
0.5347
GUGGAAUGCAGAGAAAGCUAUCUGUGGCCUUGGCCUUUGUCGGGGGAUCUAAGGUUGUCAUUCUGGAUGAACCCACAGCUGGUGUGGACCCUUACUCCCGCAGGGGAAUAUGGGAGCUGCUGCUGAAAUACCGACAAGGCCGCACCAUUAUUCUCUCUACACACCACAUGGAUGAAGCGGACGUCCUGGGGGACAGGAUUGCCAUCAUCUCCCAUGGGAAGCUGUGCUGUGUGGGCUCCUCCCUGUUUCUGAAGAACCAGCUGGGAACAGGCUACUACCUGACCUUGGUCAAGAAAGAUGUGGAAUCCUCCCUCAGUUCCUGCAGAAACAGUAGUAGCACUGUGUCAUACCUGAAAAAGGAGGACAGUGUUUCUCAGAGCAGUUCUGAUGCUGGCCUGGGCAGCGACCAUGAGAGUGACACGCUGACCAUCG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-143.20 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -152.28
Frequency: 0.0000
Diversity: 133.85
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((....(.((((((.......(((((((((((((((.(((....)))..)))))..(((((...)))))..(((((.....))))).(((.((.((((....)))).)).)))(((....)))..........))))))))))......)))))))....)))(..((((....(((((..((((((.....))))))..)).(((.(((.(((((...(((((.(.(.((.(((((....(((((.((((.((((..((((((.((((((((((((.((((....)))).......((((((((.........))))).)))......)))))))).)))).))...(((........))).)))))))).)))))))))....)).))).))).).)))))..))))).))))))...)))..)))).)
Thermodynamic Ensemble Prediction
((({..((.(((((,.......{(((({{{(({(((({((((({{|||,{||{|,..{{{{|,,,}))},.,||{((,,.,,|}}}}.(((.{{.((((....)))).}}.))){{{..,.))),.....,},,)))))))))}..,,..}},))))}.)}..)}}}{(((,,,.(((((..((((((.....))))))..)).(((.(((.(((((...(((((.(.(.((.(((,,....(((((((((,,(((,..{{{({(,{((((((((({{{(({{....}}}}.|......|,(({....)})}.,.}))},},))},,,)))}}}}}||,||||.||...(((.....))),}}})))))})}}}||||}}}}.,,,)).))).))).).)))))..))))).))))))..,)))..}))),,
Back