Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_ABCA1_0007100

Sequence Length

2151 nt

GC Content

0.5286

AUGCUGUUGGACAGCAGGGACAAUGACCACUUUUGGGAACAGCAGUUGGAUGGCUUAGAUUGGACAGCCCAAGACAUCGUGGCGUUUUUGGCCAAGCACCCAGAGGAUGUCCAGUCCAGUAAUGGUUCUGUGUACACCUGGAGAGAAGCUUUCAACGAGACUAACCAGGCAAUCCGGACCAUAUCUCGCUUCAUGGAGUGUGUCAACCUGAACAAGCUAGAACCCAUAGCAACAGAAGUCUGGCUCAUCAACAAGUCCAUGGAGCUGCUGGAUGAGAGGAAGUUCUGGGCUGGUAUUGUGUUCACUGGAAUUACUCCAGGCAGCAUUGAGCUGCCCCAUCAUGUCAAGUACAAGAUCCGAAUGGACAUUGACAAUGUGGAGAGGACAAAUAAAAUCAAGGAUGGGUACUGGGACCCUGGUCCUCGAGCUGACCCCUUUGAGGACAUGCGGUACGUCUGGGGGGGCUUCGCCUACUUGCAGGAUGUGGUGGAGCAGGCAAUCAUCAGGGUGCUGACGGGCACCGAGAAGAAAACUGGUGUCUAUAUGCAACAGAUGCCCUAUCCCUGUUACGUUGAUGACAUCUUUCUGCGGGUGAUGAGCCGGUCAAUGCCCCUCUUCAUGACGCUGGCCUGGAUUUACUCAGUGGCUGUGAUCAUCAAGGGCAUCGUGUAUGAGAAGGAGGCACGGCUGAAAGAGACCAUGCGGAUCAUGGGCCUGGACAACAGCAUCCUCUGGUUUAGCUGGUUCAUUAGUAGCCUCAUUCCUCUUCUUGUGAGCGCUGGCCUGCUAGUGGUCAUCCUGAAGUUAGGAAACCUGCUGCCCUACAGUGAUCCCAGCGUGGUGUUUGUCUUCCUGUCCGUGUUUGCUGUGGUGACAAUCCUGCAGUGCUUCCUGAUUAGCACACUCUUCUCCAGAGCCAACCUGGCAGCAGCCUGUGGGGGCAUCAUCUACUUCACGCUGUACCUGCCCUACGUCCUGUGUGUGGCAUGGCAGGACUACGUGGGCUUCACACUCAAGAUCUUCGCUAGCCUGCUGUCUCCUGUGGCUUUUGGGUUUGGCUGUGAGUACUUUGCCCUUUUUGAGGAGCAGGGCAUUGGAGUGCAGUGGGACAACCUGUUUGAGAGUCCUGUGGAGGAAGAUGGCUUCAAUCUCACCACUUCGGUCUCCAUGAUGCUGUUUGACACCUUCCUCUAUGGGGUGAUGACCUGGUACAUUGAGGCUGUCUUUCCAGGCCAGUACGGAAUUCCCAGGCCCUGGUAUUUUCCUUGCACCAAGUCCUACUGGUUUGGCGAGGAAAGUGAUGAGAAGAGCCACCCUGGUUCCAACCAGAAGAGAAUAUCAGAAAUCUGCAUGGAGGAGGAACCCACCCACUUGAAGCUGGGCGUGUCCAUUCAGAACCUGGUAAAAGUCUACCGAGAUGGGAUGAAGGUGGCUGUCGAUGGCCUGGCACUGAAUUUUUAUGAGGGCCAGAUCACCUCCUUCCUGGGCCACAAUGGAGCGGGGAAGACGACCACCAUGUCAAUCCUGACCGGGUUGUUCCCCCCGACCUCGGGCACCGCCUACAUCCUGGGAAAAGACAUUCGCUCUGAGAUGAGCACCAUCCGGCAGAACCUGGGGGUCUGUCCCCAGCAUAACGUGCUGUUUGACAUGCUGACUGUCGAAGAACACAUCUGGUUCUAUGCCCGCUUGAAAGGGCUCUCUGAGAAGCACGUGAAGGCGGAGAUGGAGCAGAUGGCCCUGGAUGUUGGUUUGCCAUCAAGCAAGCUGAAAAGCAAAACAAGCCAGCUGUCAGGUGGAAUGCAGAGAAAGCUAUCUGUGGCCUUGGCCUUUGUCGGGGGAUCUAAGGUUGUCAUUCUGGAUGAACCCACAGCUGGUGUGGACCCUUACUCCCGCAGGGGAAUAUGGGAGCUGCUGCUGAAAUACCGACAAGGCCGCACCAUUAUUCUCUCUACACACCACAUGGAUGAAGCGGACGUCCUGGGGGACAGGAUUGCCAUCAUCUCCCAUGGGAAGCUGUGCUGUGUGGGCUCCUCCCUGUUUCUGAAGAACCAGCUGGGAACAGGCUACUACCUGACCUUGGUCAAGAAAGAUGUGGAAUCCUCCCUCAGUUCCUGCAGAAACAGUAGUAGCACUGUGUCAUACCUGAAAAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-778.40 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -817.99

Frequency: 0.0000

Diversity: 602.37

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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