Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_ABCA1_0008200
Sequence Length
1143 nt
GC Content
0.5249
GUGAACAAGACCUUCCAGGAACUGGCUGUGUUCCAUGAUCUGGAAGGCAUGUGGGAGGAACUCAGCCCCAAGAUCUGGACCUUCAUGGAGAACAGCCAAGAAAUGGACCUUGUCCGGAUGCUGUUGGACAGCAGGGACAAUGACCACUUUUGGGAACAGCAGUUGGAUGGCUUAGAUUGGACAGCCCAAGACAUCGUGGCGUUUUUGGCCAAGCACCCAGAGGAUGUCCAGUCCAGUAAUGGUUCUGUGUACACCUGGAGAGAAGCUUUCAACGAGACUAACCAGGCAAUCCGGACCAUAUCUCGCUUCAUGGAGUGUGUCAACCUGAACAAGCUAGAACCCAUAGCAACAGAAGUCUGGCUCAUCAACAAGUCCAUGGAGCUGCUGGAUGAGAGGAAGUUCUGGGCUGGUAUUGUGUUCACUGGAAUUACUCCAGGCAGCAUUGAGCUGCCCCAUCAUGUCAAGUACAAGAUCCGAAUGGACAUUGACAAUGUGGAGAGGACAAAUAAAAUCAAGGAUGGGUACUGGGACCCUGGUCCUCGAGCUGACCCCUUUGAGGACAUGCGGUACGUCUGGGGGGGCUUCGCCUACUUGCAGGAUGUGGUGGAGCAGGCAAUCAUCAGGGUGCUGACGGGCACCGAGAAGAAAACUGGUGUCUAUAUGCAACAGAUGCCCUAUCCCUGUUACGUUGAUGACAUCUUUCUGCGGGUGAUGAGCCGGUCAAUGCCCCUCUUCAUGACGCUGGCCUGGAUUUACUCAGUGGCUGUGAUCAUCAAGGGCAUCGUGUAUGAGAAGGAGGCACGGCUGAAAGAGACCAUGCGGAUCAUGGGCCUGGACAACAGCAUCCUCUGGUUUAGCUGGUUCAUUAGUAGCCUCAUUCCUCUUCUUGUGAGCGCUGGCCUGCUAGUGGUCAUCCUGAAGUUAGGAAACCUGCUGCCCUACAGUGAUCCCAGCGUGGUGUUUGUCUUCCUGUCCGUGUUUGCUGUGGUGACAAUCCUGCAGUGCUUCCUGAUUAGCACACUCUUCUCCAGAGCCAACCUGGCAGCAGCCUGUGGGGGCAUCAUCUACUUCACGCUGUACCUGCCCUACGUCCUGUGUGUGGCAUGGCAGGACUACGUGGGCUUCACACUCAAGAUCUUCGCU

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-403.90 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -423.12
Frequency: 0.0000
Diversity: 254.00
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((..(((..((.((((((((((((.((((((((((((((...(.((.(((..(....)..))))).).))))))...)))))))).))))))......(((.(.((((((...((((((...)))))).)))))).).)))((((((((.........((..(((((......((((.((((........).)))))))..)))))..)))))))))).(.((..(((((((((((((.(((.(....(((((..((...(((.....))).))..)))))....))))))))).....(((((((((((((.((((..((......((((.......))))......))..)))).))).......))))))))))))))))))..)).).)))))).))..)))....)))))))((((.....))))((((((.....))))))((((..((((((........(((....)))..))))))..)))).((((((................((((......))))..))))))(((((..(((((..((.(((.....)).).)).)))))))))).(((.((..((((((((((..((.(((((..........((((((....))))))(((((((....((.(((......))).))((((((((.............(((((((((....((((((((((....(((((((..((...((.....)).))))))).))..)))))).))))..))).))))))))))))))((((.(((..(((((((((.((.((..(..((((((((((.(((((((..(((..(((((((((.((((....((((........(((((....(((((((((..((((.((((((....)))))).))))...))))..)))))....)))))....))))....)))).).)))).))))..))).)))))))))))).)))))..)..))..)).)))))))))..)))..)))))))))))....((((...)))).(((((..((((((..........))))))))))).)))))))))))))))))..)))))..(((((((((..(((.......)))...)).)))).)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((((..({{.,(({{{,.,(((((((.{(((((((((((((...{.((.(((..(....)..))))).}.))))))...)))))))}.))))))}.....|({.{.((((((...((((((...)))))).)))))).}.}}},|||||{{.,},,{,{,{{{,{,,{{,.{|,|{{{,,{{|||,,....,,{{||,,,,...}}}}.,|.{{{{{{|,.,.((..((((((((((((((({(.(....(((((..((...(((.....))).))..)))))....})))))))).....((((((((((.(,(((.....(({...{((((({.....,..........,)))))))..)}}))}}.))))))))))))))))))..)).,...))))))),,)))....}}}})}}((((.....))))((((((.....))))))((({,,(((((({..,,...,{{...,)})}.)))))).,)))).((((((.........,...,,,((((......))))..))))))(((({..(((((..((.(((.....)).).)).)))))))))).(((.((.,((((((((((,.((.(((((..........((((((....))))))(((((((.....((((((...{{{,{{{{({{{,,,,....}}}},.}}},,{,||}}}}...,,{({((({,..,|||{||,,,{({{,,,,,,.{{{{{||,||{({||......))}}.))),))).)))),}))))))),((((.(((..(((((((((.((.((..{..((((((((((.(((((((..(((..(((((((((.((((....((((........(((((....(((((((((..((((.((((((....)))))).)))}...))))..)))))....)))))....)))).,..)))).).)))))))))..))).)))))))))))).)))))..}..))..)).)))))))))..))),,)),})))))))....((({...}))).(((((..((((((..........))))))))))).))))))))))))))))),.)))))..|{|{{|{{{..{||||,..,.))},,,)).)))).)))
Back