Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_ABCA1_0011500
Sequence Length
299 nt
GC Content
0.4582
ACUUGAAGCUUCAAGAUUUCCUGGUGGACAAUGAAACCUUCUCUGGGUUCCUGUAUCACAACCUCUCUCUCCCAAAGUCUACUGUGGACAAGAUGCUGAGGGCUGAUGUCAUUCUCCACAAGGUAUUUUUGCAAGGCUACCAGUUACAUUUGACAAGUCUGUGCAAUGGAUCAAAAUCAGAAGAGAUGAUUCAACUUGGUGACCAAGAAGUUUCUGAGCUUUGUGGCCUACCAAGGGAGAAACUGGCUGCAGCAGAGCGAGUACUUCGUUCCAACAUGGACAUCCUGAAGCCAAUCCUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-79.70 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -85.85
Frequency: 0.0000
Diversity: 44.83
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..(((..((((((.(((.((((((((((((..((..((......))..)).))).))))..((((.((((.(((.((....)).)))...))).)..))))((((..((((((((((...........((((((((((..(((......)))...))))).)))))(((((((...((....))..))))))).(((((((.(((.((((((....)))))).)))..)))))))))))))..))))..)))).((((((.....))))))...)).))).))).))))))))).....
Thermodynamic Ensemble Prediction
..,{(..((((((.(((.((((((((((((..({{{(((.....)))))}.))).))))..((((.{({(.(((.{(....}).))),..))).,..))))((((..((((((((((...........((((((((((..{{(,,....})),,.))))).)))))(((((((...((....))..))))))).(((((((.(((.((((({....}))))).))).,}))))))))))))..))))..)))).((((((,...,))))))...)).))).))).)))))),,,.....
Back