Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_ABCA1_0011700

Sequence Length

812 nt

GC Content

0.4975

UUAAUGACCAGCCACGGCGUCCCUGCUGUGAGCUCUGGCCGCUGCCUUCCAGGGCUCCCGAGCCACACGCUGGGGGUGCUGGCUGAGGGAACAUGGCUUGUUGGCCUCAGCUGAGGUUGCUGCUGUGGAAGAACCUCACUUUCAGAAGAAGACAAACAUGUCAGCUGCUGCUGGAAGUGGCCUGGCCUCUAUUUAUCUUCCUGAUCCUGAUCUCUGUUCGGCUGAGCUACCCACCCUAUGAACAACAUGAAUGCCAUUUUCCAAAUAAAGCCAUGCCCUCUGCAGGAACACUUCCUUGGGUUCAGGGGAUUAUCUGUAAUGCCAACAACCCCUGUUUCCGUUACCCGACUCCUGGGGAGGCUCCCGGAGUUGUUGGAAACUUUAACAAAUCCAUUGUGGCUCGCCUGUUCUCAGAUGCUCGGAGGCUUCUUUUAUACAGCCAGAAAGACACCAGCAUGAAGGACAUGCGCAAAGUUCUGAGAACAUUACAGCAGAUCAAGAAAUCCAGCUCAAACUUGAAGCUUCAAGAUUUCCUGGUGGACAAUGAAACCUUCUCUGGGUUCCUGUAUCACAACCUCUCUCUCCCAAAGUCUACUGUGGACAAGAUGCUGAGGGCUGAUGUCAUUCUCCACAAGGUAUUUUUGCAAGGCUACCAGUUACAUUUGACAAGUCUGUGCAAUGGAUCAAAAUCAGAAGAGAUGAUUCAACUUGGUGACCAAGAAGUUUCUGAGCUUUGUGGCCUACCAAGGGAGAAACUGGCUGCAGCAGAGCGAGUACUUCGUUCCAACAUGGACAUCCUGAAGCCAAUCCUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-259.50 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -274.68

Frequency: 0.0000

Diversity: 145.38

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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