Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_ABCA1_0013700
Sequence Length
252 nt
GC Content
0.5595
UUAAUGACCAGCCACGGCGUCCCUGCUGUGAGCUCUGGCCGCUGCCUUCCAGGGCUCCCGAGCCACACGCUGGGGGUGCUGGCUGAGGGAACAUGGCUUGUUGGCCUCAGCUGAGGUUGCUGCUGUGGAAGAACCUCACUUUCAGAAGAAGACAAACAUGUCAGCUGCUGCUGGAAGUGGCCUGGCCUCUAUUUAUCUUCCUGAUCCUGAUCUCUGUUCGGCUGAGCUACCCACCCUAUGAACAACAUGAAU

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-83.00 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -86.63
Frequency: 0.0028
Diversity: 53.57
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.....(..(((((.((((((((((((((((.((((.((((.(((.....)))))))...)))))))).)).))))))))))(((((((.((((.....))))..)))))))(((((((.((........)))))))))...((((..(((((.(((...((((((((((......))))).))))).....))).)))))))))...............)))))..).........((((.....))))...
Thermodynamic Ensemble Prediction
.....(..(((((.((((((((((((((((.((((.((((.(((.....)))))))...)))))))).)).))))))))))(((((((.((((.....))))..)))))))(((((((.((........))))))))}...((((..(((((.{{,...((((((((((......)))))},)))).....}}}.)))))))))....{{.......}}))))).,).........{(((.....)))}...
Back