Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_ABCA1_0015200
Sequence Length
839 nt
GC Content
0.5018
GUAGAGCUGAAAAGAUGGAGGAAUUAUAAGGCUCAGAUUUCUCUCUUUUUUUUUUUUUUUAAGAUGGAGUUUCACUCUUGUUGUCCAGGCUGGAAUUCAAUGGCAUGAUCUCGGCUCACUGCAACCUCUGCCUCCCGGGUUCAAGUGAGACUUGAUGGUCUCACUUGAUGGUUUCCUGGCUCAGCCUCCUGAGUAGCUGAGAUUACAGGCACCCACUACCAUGCCCAGCUACUUUUUUGUAUUUUUAGUGGAGAUGGGGUUUUAUCAUGUUGACCAGGCUGGUCUCGAACUUCUGACCUCAGGUGAUCACCUGCCUCAGCCUCCCAAAGUGCAGGGAUUACAGGCAUGAGCCACUGCGUCUGGCCAAGGCUCAGAUUUCUAAUAGAGAUUUCUAAUGGACAUAGAGGCUGGAGGAAAUGGGAUGGACAGGAAAACUGAGUCAGGUGCCAAAAACUUGUAGGGGGCCGGGUGCGGUGGCUCACGCCUGUAAUCCCAGCACUUUGGGAGGCUGAGGCGGGUGGAUCACGAGGUCAGGAGAUCGAGACCAUCCUGGCUAACACGGCGAAACCCCGUCUCUACUAAAAAUACAAAAAAUUAGCCGGGCGUGUUGGCAGGCGGCUGUCGGUAGUCCCAGCUACUCGGGAGGCUGAGGCAGGAGAAUGGCGUGAAGCCGGGAGGCGGAGCUUGCAGUGAGCCGAGAUCGCGCCACUGCACUCCAGCCUGGGCGACAGAGCCAGACUCCAUCUAAAUAAAUAAAUAGAUAAAUAAAUAAAAUAAAAUAAAAACUUGUAGGGAGGUGGCAGUGUGCUAUGGAGGAUAGGUGCAACCUCUGUGAGAAU

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-499.70 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -510.25
Frequency: 0.0000
Diversity: 76.07
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
...(((((.....(((......)))....)))))....((((((((.(((.(((.(((...(((((((((((..((((.(((((((((((((((...((.((((.(((((((((((((((((((.(((((((((((((.(((((((((((((....)))))))))).....(((((((.((((((((((((((((((((.((((((.(((((((.(((.(((((((.((((.(((((((((((((((((((((((((((((((.((.(((((.(((((.(((((((((.(((((((((((..((((((((((((((((((((((((((((((.((((((((((((.(((((((((((((((((((.((.(((..((.((((.((((....)))).)))).)).))).)).(((....(((.((.(((.((....))..)))..)).)))....)))......))))))))))))))))))).)))))))))))).)))))))))))))))))))))))).))))))))))))))))).))))))))).))))).))))).)).))))))))))))))))))))))))))))))).)))).))))))).)))...).)).)))).)))))).)))))))))))))))))))).))))))).......))).))))))))))))).))))))))))))))))))).)))).))...)))))))))))))))))))..)))))))))))))).))).))).))).............................(.((((((.(((.(((.((....)).)))..))).)))))).)))))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
.,.(((((.....(((......)))....)))))..,,((((({{{,{{{{{,{{{,(((,(((((((((((..((({{(((((((((((((((...((.((((.(((((((((((((((((((.(((((((((((((.(((((((((((((....)))))))))}|,...(((((((.((((((((((((((((((((.((((((.(((((({.(({.(((((((.((((.(((((((((((((((((((((((((((((((.((.(((((.(((((.(((((((((.(((((((((((..((((((((((((((((((((((((((((((.((((((((((((.(((((((((((((((((((.{(.(((..((.((((.((((....)))).)))).}).))).)).,((,...(((.((.((({(,....)),.)))..)).)))....)))......))))))))))))))))))).)))))))))))).))))))))))))))))))))))))}})))))))))))))))).))))))))).))))).))))).)).))))))))))))))))))))))))))))))).)))).))))))).)))..}).)).)))).)))))).)))))))))))))))))))).)))))))....,.,})).))))))))))))).))))))))))))))))))).)))).)).,.)))))))))))))))))))..)))))))))))})).})).})}.}}}.........................,,,,(.((((((.(((.(((.((....)).)))..))).)))))).)))))).
Back