Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_ABCC1_0008200

Sequence Length

446 nt

GC Content

0.5426

AAUCCCUGCCCAGAGUCCAGCGCUUCCUUCCUGUCGAGGAUCACCUUCUGGUGGAUCACAGGGUUGAUUGUCCGGGGCUACCGCCAGCCCCUGGAGGGCAGUGACCUCUGGUCCUUAAACAAGGAGGACACGUCGGAACAAGUCGUGCCUGUUUUGGUAAAGAACUGGAAGAAGGAAUGCGCCAAGACUAGGAAGCAGCCGGUGAAGGUUGUGUACUCCUCCAAGGAUCCUGCCCAGCCGAAAGAGAGUUCCAAGGUGGAUGCGAAUGAGGAGGUGGAGGCUUUGAUCGUCAAGUCCCCACAGAAGGAGUGGAACCCCUCUCUGUUUAAGGUGUUAUACAAGACCUUUGGGCCCUACUUCCUCAUGAGCUUCUUCUUCAAGGCCAUCCACGACCUGAUGAUGUUUUCCGGGCCGCAGAUCUUAAAGUAAGACCCCUUCCCUCCCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-144.60 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -154.17

Frequency: 0.0000

Diversity: 154.26

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

(.((.((((((.((((.....))))...((((((.((...(((((....))))).)))))))).......(((((((((......)))))).))))))))).))..)((((...........((((((((((((((.....(((((((((((((((((..(...((......))...)..)))))))).)))..((((((......))))))(((.((((...))))...)))...((((((.(((((.((((...)))).((..((((((((((((.((((((((...))))......(((((..(((.((...))))))))))..(((((.((....)).)))))..))))))))))))))))..))))))).)))..)))....)))))))))))).))))))))(((..(..(.(((((...))))))..)..)))..))))

Thermodynamic Ensemble Prediction

{.,,.((((((..((({..{{{{|{{{{(((({(.,{,{{(((((....))))}}))}|}}||,{.{{{{(((((((((......)))))).}},)))))),)),,}((((,,{{,.....,(|((({(((({({{.....|{|||||||{{{{{|{{..|,..||.,,.,,))},,.},))},,))),,))..||||{{,,.,,,||}}|}.{{,({{,...||||{,,{{{...{(({,{{{{{,{.{{,..,{||||,((..((((((((((((.((((({((...}}},,,....(((((,(({(.{{...,)))})))))..{((((.({....}).))))).}))))))))))))))))..)},|}},,,,..,))),,},)))}}))))))).)})))))}{||,.},,|,||||,.,,))}}),.,),,)))..}}})