Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_ABCC1_0009800

Sequence Length

2058 nt

GC Content

0.5612

GUUGAUUGUCCGGGGCUACCGCCAGCCCCUGGAGGGCAGUGACCUCUGGUCCUUAAACAAGGAGGACACGUCGGAACAAGUCGUGCCUGUUUUGGUAAAGAACUGGAAGAAGGAAUGCGCCAAGACUAGGAAGCAGCCGGUGAAGGUUGUGUACUCCUCCAAGGAUCCUGCCCAGCCGAAAGAGAGUUCCAAGGUGGAUGCGAAUGAGGAGGUGGAGGCUUUGAUCGUCAAGUCCCCACAGAAGGAGUGGAACCCCUCUCUGUUUAAGGUGUUAUACAAGACCUUUGGGCCCUACUUCCUCAUGAGCUUCUUCUUCAAGGCCAUCCACGACCUGAUGAUGUUUUCCGGGCCGCAGAUCUUAAAGUUGCUCAUCAAGUUCGUGAAUGACACGAAGGCCCCAGACUGGCAGGGCUACUUCUACACCGUGCUGCUGUUUGUCACUGCCUGCCUGCAGACCCUCGUGCUGCACCAGUACUUCCACAUCUGCUUCGUCAGUGGCAUGAGGAUCAAGACCGCUGUCAUUGGGGCUGUCUAUCGGAAGGCCCUGGUGAUCACCAAUUCAGCCAGAAAAUCCUCCACGGUCGGGGAGAUUGUCAACCUCAUGUCUGUGGACGCUCAGAGGUUCAUGGACUUGGCCACGUACAUUAACAUGAUCUGGUCAGCCCCCCUGCAAGUCAUCCUUGCUCUCUACCUCCUGUGGCUGAAUCUGGGCCCUUCCGUCCUGGCUGGAGUGGCGGUGAUGGUCCUCAUGGUGCCCGUCAAUGCUGUGAUGGCGAUGAAGACCAAGACGUAUCAGGUGGCCCACAUGAAGAGCAAAGACAAUCGGAUCAAGCUGAUGAACGAAAUUCUCAAUGGGAUCAAAGUGCUAAAGCUUUAUGCCUGGGAGCUGGCAUUCAAGGACAAGGUGCUGGCCAUCAGGCAGGAGGAGCUGAAGGUGCUGAAGAAGUCUGCCUACCUGUCAGCCGUGGGCACCUUCACCUGGGUCUGCACGCCCUUUCUGGUGGCCUUGUGCACAUUUGCCGUCUACGUGACCAUUGACGAGAACAACAUCCUGGAUGCCCAGACAGCCUUCGUGUCUUUGGCCUUGUUCAACAUCCUCCGGUUUCCCCUGAACAUUCUCCCCAUGGUCAUCAGCAGCAUCGUGCAGGCGAGUGUCUCCCUCAAACGCCUGAGGAUCUUUCUCUCCCAUGAGGAGCUGGAACCUGACAGCAUCGAGCGACGGCCUGUCAAAGACGGCGGGGGCACGAACAGCAUCACCGUGAGGAAUGCCACAUUCACCUGGGCCAGGAGCGACCCUCCCACACUGAAUGGCAUCACCUUCUCCAUCCCCGAAGGUGCUUUGGUGGCCGUGGUGGGCCAGGUGGGCUGCGGAAAGUCGUCCCUGCUCUCAGCCCUCUUGGCUGAGAUGGACAAAGUGGAGGGGCACGUGGCUAUCAAGGGCUCCGUGGCCUAUGUGCCACAGCAGGCCUGGAUUCAGAAUGAUUCUCUCCGAGAAAACAUCCUUUUUGGAUGUCAGCUGGAGGAACCAUAUUACAGGUCCGUGAUACAGGCCUGUGCCCUCCUCCCAGACCUGGAAAUCCUGCCCAGUGGGGAUCGGACAGAGAUUGGCGAGAAGGGCGUGAACCUGUCUGGGGGCCAGAAGCAGCGCGUGAGCCUGGCCCGGGCCGUGUACUCCAACGCUGACAUUUACCUCUUCGAUGAUCCCCUCUCAGCAGUGGAUGCCCAUGUGGGAAAACACAUCUUUGAAAAUGUGAUUGGCCCCAAGGGGAUGCUGAAGAACAAGACGCGGAUCUUGGUCACGCACAGCAUGAGCUACUUGCCGCAGGUGGACGUCAUCAUCGUCAUGAGUGGCGGCAAGAUCUCUGAGAUGGGCUCCUACCAGGAGCUGCUGGCUCGAGACGGCGCCUUCGCUGAGUUCCUGCGUACCUAUGCCAGCACAGAGCAGGAGCAGGAUGCAGAGGAGAACGGGGUCACGGGCGUCAGCGGUCCAGGGAAGGAAGCAAAGCAAAUGGAGAAUGGCAUGCUGGUGACGGACAGUGCAGGGAAGCAACUGCAGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-791.50 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -827.07

Frequency: 0.0000

Diversity: 448.75

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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