Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_ABCC1_0010000
Sequence Length
1796 nt
GC Content
0.4922
GUGUGAGCCACCACACCCAGCUGAGUUCUGGUUCAUAACAACCCAGGCUGUCCUGGGGAAGGUGGAUAUUUAGGGACAAGAGUGAAGGCAGGGAGACCAGGGUGGGAACCUCAAGGGCUGUCCAUGAAGUCCCUUCAUGCCUCACCGGGAGCCGCCAUUGUAUUUAUUUAUUUAUUUUUUGAGACAGGGUGUCACUCUUUUGUCCAGGCUGGAGUGCAGUGGCACGAUCUCGGCUCACUGCAACCUCCAUCUCCUAGGCUGGAGUGAUCCUCCCACCUCAGCUUCCCUAGUAGCUGGGACUACAGGCACGUGCCACCACACCUGGCUAAUUUUUUUUUUUUUUUUUUGUAGAGAUGAUAUCUCGCCAUGUUGCCCAGGCUGUUCUCAAGCUCCUGAGCUCAAGCAGUCCACCUACCUUGGUCUCCCAAAGUGCUGGUAUUACAGGCGUGAGCCACUGUGCCUGACUGGAGCCUCCAUUUUUCACCCAGAGCAUUUUCUGAGAAUUCAGUGAGAUAUAUGAUAUGAUAAGCUGUGCCCUAGCCCUGAGUACAUGCUGGGCAGGUUUUAAUUGUACAAGUUUUAUUUAUUCAUCUGUACACUUUGAUCUUGCCAGGGAGGAUGUGGUGAGAACUGGGUCUUGGGGCUUGAAAGCGGGCCACCUGAGAAGGGUCUGGCUCUGUGAGUACCUUGGUGUUUAGAGAUCCUCAGCGUGGAGCCAGGGGAUCAUUUACUUGGGACAUUGGUAGACGGAUCGCUUGCUUUAUUCCCAGAGGCAUAAGCCAGAUCUGGCACCUGUAACCCCUGUGAACCUGGAGAGAGUGAGAAGGAAAACCCUGUCCUAGGCUGGAAUUUCCUGGUGUGGCCCCUUACACUCAGAUCCCUUUUGUUAACCAGAGAAAGGAAUGCAGCUCGUGCAGCUCUGGGCUGCUGGGUAUCCUAGGCUCGGGGAUCAGGUGAUGGACGCCAGGGCUGGGGGCUCUGCAUGGCUUCCUGGAUCCUUUUACCACCUCUCUUCACCCAUGAGUGACUCCUUCUCAAAAGUCAGGUGUGGCUGGGCAUGGUGGCUCAUGCCUGUAAUUGCAGUACGUUGGGAGGCUGAGGCGGGAGGCUCACCUGAGUUCAUGAGUUCGAGACCAGCCUGGCCAACAUGGUGAAUCCCUGUCUCUGCUAAAAAUACAAAAAUUAGCCGGGUGUGGUGGCGCUCACCUGUAAUCCAGCUACAGGGGGGCUGAAGCAUGAGAAUUGCUUGAAUUGUUUGGAUUUAAAAACCCAGUGCUUCAUUGGUUUGUGUGUAGUGGUUUUAUGUUCUCUUUUGUGUAUGGCCACUCAGAGCUUAGGGCCAUUUUGGACUGUGGUUUCUGCUGGCAUGAAUGUGAAAUGCUUCUGUGACUCUGGAAGAGUUUGGCAGUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUAAGUUAGACACAGUGAACAUACCACCAGUCACCCCCUUCCCAGGCAUCCAGCCAACAGAGCUGAGAACAUAUGUUCAUAAAAGGCUGGUACAGGAAUGUUCUUAGCUACUUUGUGAUAACCCAAACUGGAGGUAAGCCAGACAUCUAUUAGCAAGUGAACAGACAGAUGCACCAGUUAUGUACAUCUGCACAACUGAAUACUAAGUGAUGUACAAGAACGAACUAUUGGCCGGGCACAGUGGCUCAUGCCCAUAAUCUCAGCACUUUGGGGGCCCAAGGCAGGCAGAUCACUUGAGGUCAGGAGUUCAAGACCAGCUUGGCUAACAUGGUGAAACCCUGUCUCUACUAAAAACAUAAAAAUUAGCUGG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-716.70 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -749.37
Frequency: 0.0000
Diversity: 425.38
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((......)))))((((((((......(((........((((((....))))))(((((((((((..((((.((((..((((.((((.((((....((((....))))...(((((........))))))))).)))))))).((......)).)))).))))..))))))))))).((((((((((.(((((...(((.(((((((((..(((((((((.((....)))).)))))))..((....(((((.(.((.((((((((..((....(((((((((((.(((((((((..((((((...(((((((((((((((((((((((((.......(((((.((((((((......(((((((((((.((((((((.((((.(((((.((((((((...((.((.(((.((((((((((((((.((((((..(((((((((((((((((((((((((.....(((.(.(((.((((((((....(((((((((((((....((((..(((.((((...(((((((((((((((.((((..(((....))))))))))........)))).)).))))))...)))).))).))))....)))).....))))))))))))))))).)))).)))((((((((....)))))).))(((((((((((..((((.(((((..((((((((((((..((((((((((.(((.((((((((((..(((((((((((((..(((...(...((((((.((((((((.(((.((.(((.((((....))))...)))..)).))).)))..))))).))))))...)....))).))))))))).))))))))))))))(((........))).......((((((..........))))))......(((((.((((((...)))))))))))...))).))).)))))))......))))))))))))..(((((((......)))))))(((.........)))......)))))....))))))).))))))))..(((((....))))))))))))))))))))))))))))))..)))))).)))))))))))))).))).))))....)))))))).))))).)))).)))))))).)))))))))))......)))))))).)))))...)))))))))))))))))))))))))...)))))).))))))))))))))))))))((((.......))))((((((.....)))))).....((((((...))))))....(.((.(((((((.(((((........))))).))))))))).)((((.(((((.....(..(((.((((..((..(((((((.........(((.(((((.(.((((.((((((((((.((((......................))))..........((((.(((((.............(((.....))).((((((((((((((((.((((((........))).)))...))))))))))))...))))..........))))).)))).))))))).)))....(((..((......))..))).(((((..((((((((......(((........)))))))))))..........))))))))))))))).)))))))))))).)))).)))..)......))))).)))).))..)))))))).)).).)))))....)).))))))))).)))...))))).)))))))))).......))).......))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((......)))))((((((((.,,.{,{{{.....,..((((((....)))))){((((((((((..((({.((({,.(((,,(((({((,(.{,.,(((,{,.}|||...{({{{..,,.,..}))))))),.))))))))}{(...,,.)).}))).})))..))))))))))}.((((((((((.(((((...(((.(((((((((.,(((((((((.((....)))).)))))))..{{....(((((.(,((.((((((((..((....(((((((((((.(((((((((..((((((...(((((((((((((((((((((((((.....,,((({,.(((((((({.....(((((((((((.((((((((.((((.(((((.((((((((.(.((,({.(((.((((((((((((((.((((((..(((((((((((((((((((((((((.....{((,{,(((.((((((((....(((((((((((((..{,((((..(((.((((...(((((((((((((((.((((..{{{....})})))))))........))))},))))})))...)))).))).))))..}})))).....))))))))))))))))).)))).}},((((((((....)))))).))(((((((((((..((((,(((({..{{{{{{{,.,.,|,{{{{|||,{{.,|||))}|}|||||}.{((((..(((..{..(((.,.(((((((((((((((.......)))))}..)))..)))))).}))),}}..)))..))))}..{(((((({((({((((((...,{{.{(({..}},.)),...|{(((((((...,{.{|||||{..{((((((,,,........{{|,,|||,.,,,,(((((.{(({({..,))))))))})).}))),,,)))))))))),))))}.))))))))))}{,(((((({,.....))))))).)}.))))))}..)),}))))))))}.,,.))))))).))))))))..{((((....))))))))))))))))))))))))))))))..)))))).)))))))))))))).))).))))....)))))))).))))).)))).)))))))).)))))))))))......)))))))).)))))...)))))))))))))))))))))))))...)))))).)))))))))))))))))))){(((.......)))|{({{{(,..,.|}}}}}.{{{,((((((...))))))}}}.{,((.({((((,.(((({,{......||||}.}||||}}||,|((((.(((((.....||.|{{.||{|,,||.,{{{({((.....,,,,{((,(((({.{,({{{.||{{||{{||.{{{,.................,,,..},)},,,,.}))),||{{,|||{|,,,..........(((.....))).,,{(((((((((((((.((((((........))).)))...)))))))))))).,}|}}}|......,..})))).)))}.))))))).}}}...,({{.,({......))..))).|{{(({.((((((((.,,...{{{........}}}))))))))..,}}...,,,,}||}}}}})}))).})))))))))}}.}})),)))..}..,},.))))).)))).))..)))))))).)),),)))))....}}.))))))))).}))...))))).)))))))))).......,,,.......))))))))
Back