Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_ABCC1_0010100
Sequence Length
601 nt
GC Content
0.5125
GCGUGAGCCACUGUGCCUGACUGGAGCCUCCAUUUUUCACCCAGAGCAUUUUCUGAGAAUUCAGUGAGAUAUAUGAUAUGAUAAGCUGUGCCCUAGCCCUGAGUACAUGCUGGGCAGGUUUUAAUUGUACAAGUUUUAUUUAUUCAUCUGUACACUUUGAUCUUGCCAGGGAGGAUGUGGUGAGAACUGGGUCUUGGGGCUUGAAAGCGGGCCACCUGAGAAGGGUCUGGCUCUGUGAGUACCUUGGUGUUUAGAGAUCCUCAGCGUGGAGCCAGGGGAUCAUUUACUUGGGACAUUGGUAGACGGAUCGCUUGCUUUAUUCCCAGAGGCAUAAGCCAGAUCUGGCACCUGUAACCCCUGUGAACCUGGAGAGAGUGAGAAGGAAAACCCUGUCCUAGGCUGGAAUUUCCUGGUGUGGCCCCUUACACUCAGAUCCCUUUUGUUAACCAGAGAAAGGAAUGCAGCUCGUGCAGCUCUGGGCUGCUGGGUAUCCUAGGCUCGGGGAUCAGGUGAUGGACGCCAGGGCUGGGGGCUCUGCAUGGCUUCCUGGAUCCUUUUACCACCUCUCUUCACCCAUGAGUGACUCCUUCUCAAAAGUCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-202.60 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -214.72
Frequency: 0.0000
Diversity: 171.20
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((...)))...))((((((.(((.(.(((.((((((((....(((((((((((((....((((..(((.((((...(((((((((((((((.((((..(((....))))))))))........)))).)).))))))...)))).))).))))....)))).....))))))))))))))))).)))).)))((((((((....)))))).))(((((((((((..((((.(((((..((((((((((((..((((((((((.(((.((((((((((..(((((((((((((..(((...(...((((((.((((((((.(((.((.(((.((((....))))...)))..)).))).)))..))))).))))))...)....))).))))))))).))))))))))))))(((........))).......((((((..........))))))......(((((.((((((...)))))))))))...))).))).)))))))......))))))))))))..(((((((......)))))))(((.........)))......)))))....))))))).))))))))..))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((,,.....},.}))((((((.(({.{,(((.((((((((....(((((((((((((..{,((((..(((.((((...(((((((((((((((.((((..{{{....})})))))))........))))},))))})))...)))).))).))))..}})))).....))))))))))))))))).)))).))}((((((((....)))))).))(((((((((((..((((,(((({..{{{{{{{,...,|,{{{{|||,{{.,|||))}|}|||||}.{((((..(((..{..(((.,.(((((((((((((((.......)))))}..)))..)))))).}))),}}..)))..))))}..{(((((({((({((((((...,{{.{(({..}},.)),...|{(((((((...,{.{|||||{..{((((((,,,........{{|,,|||,.,,,,(((((.{(({({..,))))))))})).}))),,,)))))))))),))))}.))))))))))}{,(((((({,.....))))))).)}.))))))}..)),}))))))))}.,,.))))))).))))))))..))))))
Back