Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_ABCC1_0014400
Sequence Length
820 nt
GC Content
0.5841
GCGAGUGUCUCCCUCAAACGCCUGAGGAUCUUUCUCUCCCAUGAGGAGCUGGAACCUGACAGCAUCGAGCGACGGCCUGUCAAAGACGGCGGGGGCACGAACAGCAUCACCGUGAGGAAUGCCACAUUCACCUGGGCCAGGAGCGACCCUCCCACACUGAAUGGCAUCACCUUCUCCAUCCCCGAAGGUGCUUUGGUGGCCGUGGUGGGCCAGGUGGGCUGCGGAAAGUCGUCCCUGCUCUCAGCCCUCUUGGCUGAGAUGGACAAAGUGGAGGGGCACGUGGCUAUCAAGGGCUCCGUGGCCUAUGUGCCACAGCAGGCCUGGAUUCAGAAUGAUUCUCUCCGAGAAAACAUCCUUUUUGGAUGUCAGCUGGAGGAACCAUAUUACAGGUCCGUGAUACAGGCCUGUGCCCUCCUCCCAGACCUGGAAAUCCUGCCCAGUGGGGAUCGGACAGAGAUUGGCGAGAAGGGCGUGAACCUGUCUGGGGGCCAGAAGCAGCGCGUGAGCCUGGCCCGGGCCGUGUACUCCAACGCUGACAUUUACCUCUUCGAUGAUCCCCUCUCAGCAGUGGAUGCCCAUGUGGGAAAACACAUCUUUGAAAAUGUGAUUGGCCCCAAGGGGAUGCUGAAGAACAAGACGCGGAUCUUGGUCACGCACAGCAUGAGCUACUUGCCGCAGGUGGACGUCAUCAUCGUCAUGAGUGGCGGCAAGAUCUCUGAGAUGGGCUCCUACCAGGAGCUGCUGGCUCGAGACGGCGCCUUCGCUGAGUUCCUGCGUACCUAUGCCAGCACAGAGCAGGAGCAGGAUGCAGAGGAGAACG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-320.20 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -333.25
Frequency: 0.0000
Diversity: 292.90
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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