Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_ABCC1_0016000
Sequence Length
656 nt
GC Content
0.5793
CGUUCUCCUCUGCAUCCUGCUCCUGCUCUGUGCUGGCAUAGGUACGCAGGAACUCAGCGAAGGCGCCGUCUCGAGCCAGCAGCUCCUGGUAGGAGCCCAUCUCAGAGAUCUUGCCGCCACUCAUGACGAUGAUGACGUCCACCUGCGGCAAGUAGCUCAUGCUGUGCGUGACCAAGAUCCGCGUCUUGUUCUUCAGCAUCCCCUUGGGGCCAAUCACAUUUUCAAAGAUGUGUUUUCCCACAUGGGCAUCCACUGCUGAGAGGGGAUCAUCGAAGAGGUAAAUGUCAGCGUUGGAGUACACGGCCCGGGCCAGGCUCACGCGCUGCUUCUGGCCCCCAGACAGGUUCACGCCCUUCUCGCCAAUCUCUGUCCGAUCCCCACUGGGCAGGAUUUCCAGGUCUGGGAGGAGGGCACAGGCCUGUAUCACGGACCUGUAAUAUGGUUCCUCCAGCUGACAUCCAAAAAGGAUGUUUUCUCGGAGAGAAUCAUUCUGAAUCCAGGCCUGCUGUGGCACAUAGGCCACGGAGCCCUUGAUAGCCACGUGCCCCUCCACUUUGUCCAUCUCAGCCAAGAGGGCUGAGAGCAGGGACGACUUUCCGCAGCCCACCUGGCCCACCACGGCCACCAAAGCACCUUCGGGGAUGGAGAAGGUGAUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-259.30 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -268.71
Frequency: 0.0000
Diversity: 189.59
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
...((.(((((.((((((..((((((...(((((......)))))))))))......((((((.((.((((((((......((((((...))))))....))).)))))((((((((.......((((.......)))).....))))))))((((....)))).((((((((..(.((((.(((.(((.(((((((...(((.(((((.....(((((((....)))))))....))).)).)))........(((((.(....(((........)))...).)))))))))))).))).))).)))))..)).))))))(((((.(((((...))))).(((..((((((((((((.(((((((..((((...(((....)))..))))....)))).)))))))))))).((((((((.....((((........(((((((((((((..(((((((.....)))))))..)).)))).)))))))))))....))))))))..(((((.((..(((......)))..))...))))))))..))).....((((((.((((((((.....))))))))....))))))......))))).....(((((......))))).....)).)))))))))))).)).))).))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
...((.(((((.((((((,.((((((,,,((({{..,,,,))}}}))))))......((((((.((.((((((((...,..((((((...))))))....))).))))}((((((((.......((((.......)))).....)))))))).,{{||,{||||.{{{||{,({{({(..,.)))))}.||{{{,|||{{(((,(((((..,{.(((((({....})))))).,.,))),,,,|||,{{{,..|{{{,{|||||||{(...,,||||||...},}||||||,,||||....(((,.{{|||{{|,},..|,||||{.{((((...})))|.,((,.,..{{{{{{{{{.{{{||||||{{{{|,,|||,..}}))}}))))...,}}},.)))))|||||||,((((((((.,,..{(((........(((((((((((((..(((((((.....)))))))..)).)))).))))))))))).,,.)))))))},,(((((.{{..((|,,,,,.)))..))...)))))}}),,}}},}...{(((((.((((((((.....))))))))....)))))}......)))))}..}}|||||}.....)))),.....)).)))))))))))).))}})).))..
Back