Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_ABCC1_0016800

Sequence Length

2250 nt

GC Content

0.4538

GGCGUGAACCUGUCUGGGGGCCAGAAGCAGCGCGUGAGCCUGGCCCGGGCCGUGUACUCCAACGCUGACAUUUACCUCUUCGAUGAUCCCCUCUCAGCAGUGGAUGCCCAUGUGGGAAAACACAUCUUUGAAAAUGUGAUUGGCCCCAAGGGGAUGCUGAAGAACAAGGUGCCUGCUGGCGGGGUGGGGCUUGGUGUUGGGCCGUCUCGCCCUUUGGUUAAGUCAGAACGUGUCCCCUUUAGGAGUCCUUUACUUUCUCUGGCUUUCUUUGUUUUUAAUUGGACUUUAAAGAACACAUUUCUCAUGCUUGUCUUGGAAGCCUUCCUAAGACAGCCGUCUUGUACUUGUCUUUAUAGGGGUAAGUCCUCCGCGCAGAGUUAAAUUCAUUGCCUCUCCAUGGCCAAGGGAGGCCUCUCUUCCUGAUUAAGUCACAGGGCUGGCUUCUUAGCGGGGAAUCCCACUCCAAGACAUUGCCUGUGACCUAGCAGGCUGCAUUUUCUUACUUGCAGAGGUGUCUGUGGGUAGAGGGGUCGGAAAAUUGCCACAACACCUUAACAUAAUAGGAAAUAGUUCCUGUGUUCUUUUUAUAGGGCAGUUGUGGUAAUGGGUACACACUGGCUCUUUUUUUUCUCCCCCUGAUUUUAUUUUUUUGAGGUGGAGUUUCGCUACUGUUGCCCAGGCUGGAGUGCAGUGGCAUGAUCUCAGCUCACUGCAACCUCCGCAUCUCGGGUUCAAGCACUUCUCCUGCUUUGGCCUCCCAAGUAGCUGGGAUUACAGGUGCCCACCACCACGCCUGGCUAAUUUUUUUUAUUUUUAGUAGAAUCGAGGUUUCACCAUGUUGGUCAGGCUGGUCUCGAACUCCUGACCUCAAGUGAUCUGCCCGCCUGGGUCUCCUGCAAUGCUGGGAUUACAGGCGUGAGCCACCACACCCGGCUGUUUCUGCUGAUUUUAAAACUAACACAUCCCCAUGGGGGGCAUAUAGAUUAAGAAAAACAUGAAAAAGAAAAAUGGAAGCAGUUACACACAUUCCACUGGUUAGAGGUUUUGUAUUUUUUUCAAGUCUUUUUGCUCUGUGUAUAAACUUUUUAAAUAGGGUUAUCUUGUUCCACGUAUAUAUACAGGAAACAUCGUGCUACAUGACCUCUUGUAAUCGUUCCCAUACAUACCACUAACAUUCUGUGUAAACAUAUUUUAAAAUAGUACAAAACAUUUUUGAAAAUUACUAAGUAAUACAUGCCCAUUGUAACAAAAUUGAAAAGUACAAGAAUAUGGAUAUCUUCUUAUAAUAUAUGUGUGUAUGCGUGUGUGUGUGUGUGUGUGUGUGUGUGCAUGUAUAUAAAGUAAAUAAAGCUGGGCACGGUGAGUAAUCCCAACACUUUUGGAGGCCUAGACCAGUGGAUCACCUGAGGUCAGGAGUUCGAGACCAGCCUGGCCAACAUGGUGAAACCCCAUCUCUACUAAAAAUACAAAAAUCAGCCGAGUGUGGUGAUGCAUGGCUGUAAUCCCAGCUACUCGGGAAGCUGAGGCCGGAGAAUGUCUUGAACCCGGGACGUGGAGGUUGCAGUGAGCUGAGAUUGCGCCACUGCACUCUAGCCUGGGUAACAGAGCGAGACUCCGUCUCAGAAAAUAUAUCUAAAUAAAGUAAAUAAAAUAGUCCCUCUUCAUCCUGCAUCCCUAAUCUUUAAUUCUUCUCUUAGAGAGCAAGGGUUAGCAAAUCUGGCCCACUGCCUGCUUUUUAUAUGGCUCUUGAGCUAAGAAUGAUGUGUGUAUUUUUAAAUAGAAGAAAUCUAAACAGGAAGAAUAUUUUAUGACAUUUGAAAAUCGUAUUAAAUUUAGAUAUCAGUGUCCAUAAAUAAAACUUUAUUGGAACAUGGCCAAUGUAUUUUUUUUCUUUUUUUUUCUGCAGACAGGGUUUUCCUCUGUUGUCCAGGCUGGAGUGCAGUGCCACAGUCAUGGCAUGGUAGCCUCCAGCUCCUCGGCUGAAUCAAUCCUCCUGCCUUCUGAGUAGCUCCUGGGACCACAGGCAUGCAGCACCAUGCCUGGCUAAUUUAUUUUUAUUUUUAUUUUGUGGAGACAGGUCUCACUAUGUUUCCCAGGCUGGUUUCAAACUCUUGGCCUCAAGGAAUCCUCCCGUUUUGGCCUCCCAAAGUGCUGGGAUUACAGGUGUGAGCCACCGCACGUGUCCUGUUCUUUAAAGCAUCGUCUACAGCUGCUUCAACUCGGCAGGGCUGAGUUGGUGCCAUGGCAACU

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-912.40 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -947.80

Frequency: 0.0000

Diversity: 379.34

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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