Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_ABCC1_0017700

Sequence Length

2581 nt

GC Content

0.5436

GCAUGGUGGCAGGCGCCUGUAGUCCCAGCUACUCGGGAGGCUGAGGCACGAGAAUCGCUUGAACCCAGGAGGUGGAGGUUGCAGUGAGCCGAGAUUGCGCCAUGGCACUCCAGCCUGGGUGACAGAGCGAGACUCCAUCUCAAAAAACAAAAACAAAACAAAACAGCAGCAGCAGCAGAAAACAGUAAAACAACAACAAAAAUUGACAAAGUCGGAGCCUAAACGUAUCAGACCGCGGAGAUCUGAGAAAGGAUCCCGGACCUGCAGUUGCUACAGGGGUCAGGAGAGAGCAAAGACCAUGCGGCAUAGCACGGUGCCUGGAACAGACAAACACUUCGUAGAUGUCGCUUUUGCCAUGGUUAUCAUCCGGACAUGGUUAUGGUCCGGAAUUGGUGGGUCUUGGUCUCACUGACUUCAAGAAUGAAGCCGCAGACCCUCACGGUGAGUGUUACAGUUCUUAAAGGUGGCACGUCUGGGGUUUGUUCCUUCUGCUGUUCGGAUGUGUUCGGAGUUUCUUCCUUCUGGUGGGUUCGUGGUCUCGCUGGCCUCAGGAGUGAAGCUGCAGACCUUCGCGGUAAGUGUUACAGCUCUUAAGGUGGCGUGUCUGGAGUCGUUCGUUCCUCCCGCUGGGUUUGUGCUCUGGCUGGCUUCAGGAGUGAAGCUGUAGACCUUGAUGGUGAGUGUUACAGCUCACAAAGGCAAUGUGGACCCAAACACUGAGCAGCAGAAAGAUUUAUCGCAAAGAGUGAAACAAUAAAGCUUCCACAGUUUGGAAGGGUACCCCAGUAGGUGGCCACUGCUGGCUCUGGCAGCCAGCUUUUAUUCUCUUAUCUGGCCCUACCCACAUCCUGCUGAUUGGUCCAUUUUACAGAGAGCCGAUUGGUCUGUUUUUACAGAGUGUUGAUUGGUCCGUUUUGACAGGGUGCUGAUUGGUGUGUUUACAACCCCUGAGCUAGAUACGUAAGUUCCCCACAUCCCCACUAGAUUAGCUAGAUAUAGAGUGUUGAUUGGUGCAUUCACAAACCCUGAGCUAGACACAGGGUGCUGAUUGGUGUGUUUACAAACCUUGAGCUAGAUACAGAGUGCUGAUUGGUGUAUUUACAAUCCCUUAGCUAGACAUAAAGGGCCUCCAAGUCAGCACCAGACUCAGGAGCCCAGCUGGCUUCACCAGGUGGAUGCCACACUGGGGCUGCAGGUGGAGCUGCCUGCCAGUCCCGUGCCGUGCGCCCUCACUCCUCAGCCCUUGGGCGGUGGAAGGGACUGGGCGCCAUGGAGCAGGGGCGGCACUCGUCCGGGAGGCUCGGGCCGCGCAGGAGCCCAUAGCGGGGAGGUGGGGAGGCUCAGGCAUGGCAGGCUGCAGGUCCCGAGCCCUGCCCCGCGGGGAGGCAGCUAAAGCCCGGUGAGAAAUCAAGUGCAGCAGCUGCUGGCCCAGGUGCUAAGCCCCUCACUACCCGGGCUGGCGGGGCUGCCCGGCAGCUCUGAGUGCGGGGUCCACCGAGCCGACGCCCACCCAGAACUAGCGCUGGCCCGCAAGCGCCCUGUGCAGCUCCGGUUCCCUCCCGUUCCUCUCCCUCCACACCUCCCCGCAAGCUGAGGGAGCCGGCUCCAGCCUUGGCCAGCCCAGAAAGGGGCUCCCACAGUGCAGCGGCGGGCUGAAGGGCUCCUCAAGCGCUGCCAGAGUGGGUGCCAAGGCCGAGGAGGCACAGAGAGCGAGCGAGGGCUGCGAGGGCUGCCAGCACGCUGUCACUUCUCAAUCUUACACAGCCUAAAUUCUAGUGGGAGACUCCAGACAGUGCAUGAGUGUAGAAGGAUGUAAGAUUUUCUGUCGAGGUGUGUGGAUGUGUGAAGUCCUAGGUCAUGAAGCAGGAAGCCCCAGCUCCCCAUUUGAAUUCUAGAUUCCAUCCAGAGUUGGUUCCAGUUGCUCCCUCUGCCACUCCCUGAAAACUCACUCUUGCUUUCAGAUUUGAGGGCCACUUCCACCUCACUAGGCCUUAACUAAAGACCUUUGCACAGAUCUCAUGGGUAAGGAAAGUUUACCCAAUCCCAGGCGCUAAUUCAAAGAGGGGAGGUGGUGGAGGUUUAUUCGGCCUUCAGGAAGUGUUUUCAGGGGACACAGUUCUGGGGGUGCAGGGAUGACUCAUAUGGGGCUCUUGACCUCAGUUAGCUUAUAAUCUUGUGCAGGAGAUAAGUGGGUAGAGGAAAGUAUAGAAAUUUCCACGGCAGUGAGCCGCAGCUGUGUUUUGCAUGGUCUCCAUAAUUUCUUUUCUUUUCUUUUCUUUUUUUUUUUUUUUUGACAUGAGUCUCCCUCUGUCGCCCAGGCUGGAGUGCAGUGUGCAGUGGCGCGAUGUCAGCCACUGAACGGAAAACUGUGGGCGACGCAAUCUGUGAUCAUCUCUGGGGGUCUGCAUAAAGCUCAUGACCACUGAUGUGCGAAAAGUGCUUUUUUUUUUUUUUUUGAGACAGGGUCUUACUCAGUCGCUGAGGCUGGAGUGCAGUGGUGCAAUCACGGCUCACUGCAAUUUCUGCCUCUGGGAUUCAAGCGAUUCUCCUGCCUCAACCUCCCAAGUAGUUGGGACUGCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-1086.70 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -1134.32

Frequency: 0.0000

Diversity: 620.29

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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