Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_ABCC1_0018600
Sequence Length
1557 nt
GC Content
0.5793
ACAGCUCAGCAGCUCCUCCUCCUAUAGUGGGGACAUCAGCAGGCACCACAACAGCACCGCAGAACUGCAGAAAGCUGAGGCCAAGAAGGAGGAGACCUGGAAGCUGAUGGAGGCUGACAAGGCGCAGACAGGGCAGGUCAAGCUUUCCGUGUACUGGGACUACAUGAAGGCCAUCGGACUCUUCAUCUCCUUCCUCAGCAUCUUCCUUUUCAUGUGUAACCAUGUGUCCGCGCUGGCUUCCAACUAUUGGCUCAGCCUCUGGACUGAUGACCCCAUCGUCAACGGGACUCAGGAGCACACGAAAGUCCGGCUGAGCGUCUAUGGAGCCCUGGGCAUUUCACAAGGGAUCGCCGUGUUUGGCUACUCCAUGGCCGUGUCCAUCGGGGGGAUCUUGGCUUCCCGCUGUCUGCACGUGGACCUGCUGCACAGCAUCCUGCGGUCACCCAUGAGCUUCUUUGAGCGGACCCCCAGUGGGAACCUGGUGAACCGCUUCUCCAAGGAGCUGGACACAGUGGACUCCAUGAUCCCGGAGGUCAUCAAGAUGUUCAUGGGCUCCCUGUUCAACGUCAUUGGUGCCUGCAUCGUUAUCCUGCUGGCCACGCCCAUCGCCGCCAUCAUCAUCCCGCCCCUUGGCCUCAUCUACUUCUUCGUCCAGAGGUUCUACGUGGCUUCCUCCCGGCAGCUGAAGCGCCUCGAGUCGGUCAGCCGCUCCCCGGUCUAUUCCCAUUUCAACGAGACCUUGCUGGGGGUCAGCGUCAUUCGAGCCUUCGAGGAGCAGGAGCGCUUCAUCCACCAGAGUGACCUGAAGGUGGACGAGAACCAGAAGGCCUAUUACCCCAGCAUCGUGGCCAACAGGUGGCUGGCCGUGCGGCUGGAGUGUGUGGGCAACUGCAUCGUUCUGUUUGCUGCCCUGUUUGCGGUGAUCUCCAGGCACAGCCUCAGUGCUGGCUUGGUGGGCCUCUCAGUGUCUUACUCAUUGCAGGUCACCACGUACUUGAACUGGCUGGUUCGGAUGUCAUCUGAAAUGGAAACCAACAUCGUGGCCGUGGAGAGGCUCAAGGAGUAUUCAGAGACUGAGAAGGAGGCGCCCUGGCAAAUCCAGGAGACAGCUCCGCCCAGCAGCUGGCCCCAGGUGGGCCGAGUGGAAUUCCGGAACUACUGCCUGCGCUACCGAGAGGACCUGGACUUCGUUCUCAGGCACAUCAAUGUCACGAUCAAUGGGGGAGAAAAGGUCGGCAUCGUGGGGCGGACGGGAGCUGGGAAGUCGUCCCUGACCCUGGGCUUAUUUCGGAUCAACGAGUCUGCCGAAGGAGAGAUCAUCAUCGAUGGCAUCAACAUCGCCAAGAUCGGCCUGCACGACCUCCGCUUCAAGAUCACCAUCAUCCCCCAGGACCCUGUUUUGUUUUCGGGUUCCCUCCGAAUGAACCUGGACCCAUUCAGCCAGUACUCGGAUGAAGAAGUCUGGACGUCCCUGGAGCUGGCCCACCUGAAGGACUUCGUGUCAGCCCUUCCUGACAAGCUAGACCAUGAAUGUGCAGAAGGCGGGGAGAACCUCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-582.70 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -609.38
Frequency: 0.0000
Diversity: 364.32
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
....((.((...((((.((.(((....((((((((((.(((((((......(((((..((((((((((((..((.((((((((((..((.((.((..(((....((((((.(((.((...(((((((((((((.((((((((.(((((.((.....((((...(((((((((...)).).)))))).......((((((.......(((((.(((((..((.((.((((.((..((((.((((...))))...))))....(((.((((....)))))))..)))))).)))).))))).)))))....))))))((.((((((((((((.(........).))))...((((....))))..)))))))).)).))))..)).))))).)))))))).)).)))))))).(((((....((((((........))))))...)))))((((((((.((((((..(.((((.(....))))).)..))))))....))))))))((.(.(((((((....(((((...(.(((.(((((((((((...(((((.....)))))))))).))))))))).))))))..))).)))))))..)))..))))).))))))))))))).)).)))))))))).)).((((((((((((((((((......))))))(((((((((((......))...(((.(((....))))))...(((((...............))))).)))))))))((((.(((((((((((((((........)))).)))).........)))))))))))...))))))).....)))))(((((((((.(((((..((((((((.(.....).))))))))..))))).))).))))))..)))))..))))))).)))))...))))))))))).)))))).(((((...(((..(((((((.(.(((((.(((((((.((((((((.(((..((((.(((((..(.(((..((((((.(((((((...))))))).)))...)))...))).)..)))))...))))))).)))))...))).))))))).((((..(((((((.....))))).).)..))))))))).))))))))..((((((((((((((((..........)))))......(((.((.((.(((((((((((((.(((...((((......))))........(((((((((...(((..(.(((.(((((((((((((..(.((((.....)))).)..))))(((....((((......))))...)))..(((...((((.....(((((.......)))))....))))..)))........))))))))).))))))).)).)))))))(((.((((.........)))).))).(((((.((...(((((....)))))....)).))))).))))))))))))..))))))))))))))))))))))..((.((...((((((......))))))....)).)).))).)))))...))).))))))...)).))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((..{((({(((,,{((,((......})))|....,||,{({,......{,||,..((((((((((((..((.((((((((((((((((((,....(((((..((((((((((((...(((.((((((.((.((((...)))).)).))).))).,.{|....,.,}))).)))).}.)))))))..)))))...,,.)))))))}..,.((((....|.|({(((((.,..((({,(((.......((((((((....(((.((((....)))))))....{|||{..||....,.}...)))))))))))))...,,))))))),})}))},..}}),.((({{.{..(((..((((..,.,.((((.((((.(((.((((((((((.(((..{,{{(((((,{.{.(((((...,((((((........)))))},..)))))((((((((.((((((..(.((((.(....))))).}..))))},....))))))))),}.)})))))}..))).))))))(.(((.((((((((((({.,{((({...,,))}})))))).))))))))).)........)))).))).)))).)))).)..)))).))}})))))....)))))))))).}}.(((((((((((((((((,{.....||||}|({{{{(((|{|,{.,},|},,,{({.{((...,))))}|,,,(((({..,............))))).}))))))))((((.((((((({{{{{{{,{{{{.{{.,,,),})))}........)))))))))))...))))))),....)))))(((((((((.(((((..((((((((.{.....,.))))))))..))))).))).))))))..)))))..))))))).)))))..))))(((.(((..((((({(((...)))}..{.(((((({{(.(((((.(((((((.((((((((.(((.,({((.(((((..(.(((..((({({,(((((((...))))))).,})...)))...))).)..))))).,,}}))))).)))))...))).))))))).((((..(((((((.....))))).).)..))))))))).)))))))),.(((((((((({{((((.....,,...}}}}}......(((.((.((.(((((((((((((.(((...((((......))))........((((((({{...(((.,{.(((.(((((((((((((.,(.((((.....)))).)..)))}(((....((((......)))),..)))..{((...((((.....(((((.......)))))....))))..))}.,....,.))))))))).))))))).)}.)))))))((({((,{.........,)))}))}.(((((.{{...((((,....,,}}),}}})}.))))).))))))))))))..)))))))))))}))))))))))..,(((....,))).({{{((,|{{(((..(........)..))).)})))))})))))..))).)))
Back