Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_ABCC1_0019200
Sequence Length
948 nt
GC Content
0.5759
GUCAAGCUUUCCGUGUACUGGGACUACAUGAAGGCCAUCGGACUCUUCAUCUCCUUCCUCAGCAUCUUCCUUUUCAUGUGUAACCAUGUGUCCGCGCUGGCUUCCAACUAUUGGCUCAGCCUCUGGACUGAUGACCCCAUCGUCAACGGGACUCAGGAGCACACGAAAGUCCGGCUGAGCGUCUAUGGAGCCCUGGGCAUUUCACAAGGGAUCGCCGUGUUUGGCUACUCCAUGGCCGUGUCCAUCGGGGGGAUCUUGGCUUCCCGCUGUCUGCACGUGGACCUGCUGCACAGCAUCCUGCGGUCACCCAUGAGCUUCUUUGAGCGGACCCCCAGUGGGAACCUGGUGAACCGCUUCUCCAAGGAGCUGGACACAGUGGACUCCAUGAUCCCGGAGGUCAUCAAGAUGUUCAUGGGCUCCCUGUUCAACGUCAUUGGUGCCUGCAUCGUUAUCCUGCUGGCCACGCCCAUCGCCGCCAUCAUCAUCCCGCCCCUUGGCCUCAUCUACUUCUUCGUCCAGAGGUUCUACGUGGCUUCCUCCCGGCAGCUGAAGCGCCUCGAGUCGGUCAGCCGCUCCCCGGUCUAUUCCCAUUUCAACGAGACCUUGCUGGGGGUCAGCGUCAUUCGAGCCUUCGAGGAGCAGGAGCGCUUCAUCCACCAGAGUGACCUGAAGGUGGACGAGAACCAGAAGGCCUAUUACCCCAGCAUCGUGGCCAACAGGUGGCUGGCCGUGCGGCUGGAGUGUGUGGGCAACUGCAUCGUUCUGUUUGCUGCCCUGUUUGCGGUGAUCUCCAGGCACAGCCUCAGUGCUGGCUUGGUGGGCCUCUCAGUGUCUUACUCAUUGCAGGUCACCACGUACUUGAACUGGCUGGUUCGGAUGUCAUCUGAAAUGGAAACCAACAUCGUGGCCGUGGAGAGGCUCAAGGAGUAUUCAGAGACUGAGAAGGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-347.00 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -364.96
Frequency: 0.0000
Diversity: 302.86
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((.(((...((((((..((............))..)).))))..))).))(((((((.((((..(((((((((((.(((((..((.((.((((.((..((((.((((...))))...))))....(((.((((....)))))))..)))))).)))).))))).))))(.((((((((((((...(((((((((((((.........(((((.(..(((..((((..(...((((.((((.(((.((((((((((.(((....(((((((.(.(.(((((....((((((........))))))...)))))((((((((.((((((..(.((((.(....))))).)..))))))....))))))))).).)))))))...))).))))))(.(((.(((((((((((...(((((.....)))))))))).))))))))).)........)))).))).)))).)))).)..)))).)))))))))(((....)))...............)))))).)))))))...((((.((....)).))))...))).))).)))))).)((((.((((.(((((.....((((((((....((((((....))))))...(.((((((((((..(.((...((((.(((..((........))((((((((..(((((..((((....((((((((((((..(((((((.((.(((....))).)).(((.((((..((((((..((((((((...(((..........)))))))).....))).....)))))))))).)))...)))))))..)))))))))).))....))))..))))).))))))))..))).))))..)).)..)))))))))).)...)))))))).............))))).)))).))))..))))......)))..)))))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((.(((...((((((..{{.....,.,....)).,)}.))))..))).))((((((,{((((..((((((({..({((((...((.((((,,,({.{.((({{(((.......((((((((....(((,((((....)))))))....(((((..{,......}...))))))))))))).....))))))).,),))....)))).)),..,||||}}..|((((.((((((((((({(((((,(((,((((,..,,,..}}|},|||.,{,{,,||{(|..{((({{{.,,,,.,,))))),,,{({{{{(((.((((,((,,,({{(.((.,.({{{.|,|||.|..||||{..{{{|,,,,,,)))).,.))))).,.))).),)))))).)))),}))}}}.))))))))}{..{{.((((((.((...(((((((((((..,......|(((((....((((((((((((.,.{{..............(((((..(((..(((,,((((((((((({{,....||||,|({{{{(((|||||..}||},,,{{{.{{{...,)))}}|,,,(((({..,............}))}}.})))))))){(((.((((((({{{{{,|{{{{{.{{.,,,),})))}........))))))))))}...))))))))))..)))))))).,.(((.(((((..((((((((.{.....}.))))))))..))))).)}),,.(((((.,.(((......,},.,)})))))}}...)))))))}..((((((.((((......)))))))))),))))...)))))}....,..,..)))))).))))).,.)))))))).))..},{((((({...))))))},||}...},,....,,})))))))))).))),}))))),.....)))..)))))))))))
Back