Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_ABCC1_0019400
Sequence Length
1421 nt
GC Content
0.5785
GUCAAGCUUUCCGUGUACUGGGACUACAUGAAGGCCAUCGGACUCUUCAUCUCCUUCCUCAGCAUCUUCCUUUUCAUGUGUAACCAUGUGUCCGCGCUGGCUUCCAACUAUUGGCUCAGCCUCUGGACUGAUGACCCCAUCGUCAACGGGACUCAGGAGCACACGAAAGUCCGGCUGAGCGUCUAUGGAGCCCUGGGCAUUUCACAAGGGAUCGCCGUGUUUGGCUACUCCAUGGCCGUGUCCAUCGGGGGGAUCUUGGCUUCCCGCUGUCUGCACGUGGACCUGCUGCACAGCAUCCUGCGGUCACCCAUGAGCUUCUUUGAGCGGACCCCCAGUGGGAACCUGGUGAACCGCUUCUCCAAGGAGCUGGACACAGUGGACUCCAUGAUCCCGGAGGUCAUCAAGAUGUUCAUGGGCUCCCUGUUCAACGUCAUUGGUGCCUGCAUCGUUAUCCUGCUGGCCACGCCCAUCGCCGCCAUCAUCAUCCCGCCCCUUGGCCUCAUCUACUUCUUCGUCCAGAGGUUCUACGUGGCUUCCUCCCGGCAGCUGAAGCGCCUCGAGUCGGUCAGCCGCUCCCCGGUCUAUUCCCAUUUCAACGAGACCUUGCUGGGGGUCAGCGUCAUUCGAGCCUUCGAGGAGCAGGAGCGCUUCAUCCACCAGAGUGACCUGAAGGUGGACGAGAACCAGAAGGCCUAUUACCCCAGCAUCGUGGCCAACAGGUGGCUGGCCGUGCGGCUGGAGUGUGUGGGCAACUGCAUCGUUCUGUUUGCUGCCCUGUUUGCGGUGAUCUCCAGGCACAGCCUCAGUGCUGGCUUGGUGGGCCUCUCAGUGUCUUACUCAUUGCAGGUCACCACGUACUUGAACUGGCUGGUUCGGAUGUCAUCUGAAAUGGAAACCAACAUCGUGGCCGUGGAGAGGCUCAAGGAGUAUUCAGAGACUGAGAAGGAGGCGCCCUGGCAAAUCCAGGAGACAGCUCCGCCCAGCAGCUGGCCCCAGGUGGGCCGAGUGGAAUUCCGGAACUACUGCCUGCGCUACCGAGAGGACCUGGACUUCGUUCUCAGGCACAUCAAUGUCACGAUCAAUGGGGGAGAAAAGGUCGGCAUCGUGGGGCGGACGGGAGCUGGGAAGUCGUCCCUGACCCUGGGCUUAUUUCGGAUCAACGAGUCUGCCGAAGGAGAGAUCAUCAUCGAUGGCAUCAACAUCGCCAAGAUCGGCCUGCACGACCUCCGCUUCAAGAUCACCAUCAUCCCCCAGGACCCUGUUUUGUUUUCGGGUUCCCUCCGAAUGAACCUGGACCCAUUCAGCCAGUACUCGGAUGAAGAAGUCUGGACGUCCCUGGAGCUGGCCCACCUGAAGGACUUCGUGUCAGCCCUUCCUGACAAGCUAGACCAUGAAUGUGCAGAAGGCGGGGAGAACCUCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-523.50 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -547.94
Frequency: 0.0000
Diversity: 342.39
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((..((((((.(((((.......))))))))))).....)))(.....(((((((((((.((((.......((((((.((...(.((((((((.(((((((..........))).))))...)))))((((((.....)))))).(((((...(((.(((((((((.(((((((.((((((((.(((((((((((((.........(((((.(..(((..((((..(...((((.((((.(((.((((((((((.(((....(((((((.(.(.(((((....((((((........))))))...)))))((((((((.((((((..(.((((.(....))))).)..))))))....))))))))).).)))))))...))).))))))(.(((.(((((((((((...(((((.....)))))))))).))))))))).)........)))).))).)))).)))).)..)))).)))))))))(((....)))...............)))))).)))))))...((((.((....)).))))...(((((((...((((((((((.((((.(((((.....((((((((....((((((....))))))...(.((((((((((..(.((...((((.(((..((........))((((((((..(((((..((((....((((((((((((..(((((((.((.(((....))).)).(((.((((..((((((..((((((((...(((..........)))))))).....))).....)))))))))).)))...)))))))..)))))))))).))....))))..))))).))))))))..))).))))..)).)..)))))))))).)...)))))))).............))))).)))).))))...............))))))....)))))))(((((.....))))))))).)))).)))(((...)))....((((((((((((((((..........)))))......(((.((.((.(((((((((((((.(((...((((......))))........(((((((((...(((..(.(((.(((((((((((((..(.((((.....)))).)..))))(((....((((......))))...)))..(((...((((.....(((((.......)))))....))))..)))........))))))))).))))))).)).)))))))(((.((((.........)))).))).(((((.((...(((((....)))))....)).))))).))))))))))))..))))))))))))))))))))))..)))))))))))..))))))))))))).)....)))))))).)))).).))).)))))))......)
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((..(((((,,(((((.......))))))))))).....))){,,...(((((((((((.((((.,.....{(((((.{{...|.{{{(((((.(((((({.{{{.....})),.))))...)))))((((((.....)))))}.(((((...(((.((((((({{{(((((((.((((((((.(((((((((((((......,,,((({,.(..(((..((((..,...((((.((((.(((.((((((((((.(((..{,(((((((.(.{.(((((...,((((((........)))))},,.)))))((((((((.((((((..{.((((.(....))))).)..)))))},...))))))))).).)))))))}..))).))))))(.(((.(((((((((((,..(((({..,,.))}})))))).))))))))).)........)))).))).)))).)))).}..)))).}},)))}})|{|,,,,)||...............)))))).))))))}..,((((.((....)).)))),..(((((((...((((((((((.((((.(((((..,,.{(((((({..{,{(({{{,,,,})))||,,|{|{{((((({{{.,|||{{{{(,{{.|{||}||.,,,,{,.|,{||{{|||..|{||||.{(({{{,{(,,{((((((((,.((((({{,({{((({.,.,,},)}}|||,|||{.}||||{|,|{||||||,.},|{{..,,,,,,,.,)}})))),,,,,))},|||,))))}}||}|,|||...|})))))..||||}}||||,}{{|{{}}}}..}))))},)))))))}|,}}.},}}|.}}}),,))))})))}),},}}))))))))...,.......},))))).)))).))))....||....,}...))))))....)))))))(((((.....))))))))).)))).))){{(,..}}},,..((((((((((({((((.....,,...}}}}}......(((.((.((.(((((((((((((.(((...((((......))))........((((((({{...(((.,{.(((.(((((((((((((.,(.((((.....)))).)..)))}(((....((((......)))),..)))..{((...((((.....(((((.......)))))....))))..))}.,....,.))))))))).))))))).)}.)))))))((({((,{.........,)))}))}.(((((.{{...((((,....,,}}),}}})}.))))).))))))))))))..)))))))))))}))))))))))..)))))))))))..))))))))))}}}.,....)}}))))).)))).),})).)))))))......)
Back