Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_ABCC1_0019500
Sequence Length
1616 nt
GC Content
0.5829
GUCAAGCUUUCCGUGUACUGGGACUACAUGAAGGCCAUCGGACUCUUCAUCUCCUUCCUCAGCAUCUUCCUUUUCAUGUGUAACCAUGUGUCCGCGCUGGCUUCCAACUAUUGGCUCAGCCUCUGGACUGAUGACCCCAUCGUCAACGGGACUCAGGAGCACACGAAAGUCCGGCUGAGCGUCUAUGGAGCCCUGGGCAUUUCACAAGGGAUCGCCGUGUUUGGCUACUCCAUGGCCGUGUCCAUCGGGGGGAUCUUGGCUUCCCGCUGUCUGCACGUGGACCUGCUGCACAGCAUCCUGCGGUCACCCAUGAGCUUCUUUGAGCGGACCCCCAGUGGGAACCUGGUGAACCGCUUCUCCAAGGAGCUGGACACAGUGGACUCCAUGAUCCCGGAGGUCAUCAAGAUGUUCAUGGGCUCCCUGUUCAACGUCAUUGGUGCCUGCAUCGUUAUCCUGCUGGCCACGCCCAUCGCCGCCAUCAUCAUCCCGCCCCUUGGCCUCAUCUACUUCUUCGUCCAGAGGUUCUACGUGGCUUCCUCCCGGCAGCUGAAGCGCCUCGAGUCGGUCAGCCGCUCCCCGGUCUAUUCCCAUUUCAACGAGACCUUGCUGGGGGUCAGCGUCAUUCGAGCCUUCGAGGAGCAGGAGCGCUUCAUCCACCAGAGUGACCUGAAGGUGGACGAGAACCAGAAGGCCUAUUACCCCAGCAUCGUGGCCAACAGGUGGCUGGCCGUGCGGCUGGAGUGUGUGGGCAACUGCAUCGUUCUGUUUGCUGCCCUGUUUGCGGUGAUCUCCAGGCACAGCCUCAGUGCUGGCUUGGUGGGCCUCUCAGUGUCUUACUCAUUGCAGGUCACCACGUACUUGAACUGGCUGGUUCGGAUGUCAUCUGAAAUGGAAACCAACAUCGUGGCCGUGGAGAGGCUCAAGGAGUAUUCAGAGACUGAGAAGGAGGCGCCCUGGCAAAUCCAGGAGACAGCUCCGCCCAGCAGCUGGCCCCAGGUGGGCCGAGUGGAAUUCCGGAACUACUGCCUGCGCUACCGAGAGGACCUGGACUUCGUUCUCAGGCACAUCAAUGUCACGAUCAAUGGGGGAGAAAAGGUCGGCAUCGUGGGGCGGACGGGAGCUGGGAAGUCGUCCCUGACCCUGGGCUUAUUUCGGAUCAACGAGUCUGCCGAAGGAGAGAUCAUCAUCGAUGGCAUCAACAUCGCCAAGAUCGGCCUGCACGACCUCCGCUUCAAGAUCACCAUCAUCCCCCAGGACCCUGUUUUGUUUUCGGGUUCCCUCCGAAUGAACCUGGACCCAUUCAGCCAGUACUCGGAUGAAGAAGUCUGGACGUCCCUGGAGCUGGCCCACCUGAAGGACUUCGUGUCAGCCCUUCCUGACAAGCUAGACCAUGAAUGUGCAGAAGGCGGGGAGAACCUCAGUGUCGGGCAGCGCCAGCUUGUGUGCCUAGCCCGGGCCCUGCUGAGGAAGACGAAGAUCCUUGUGUUGGAUGAGGCCACGGCAGCCGUGGACCUGGAAACGGACGACCUCAUCCAGUCCACCAUCCGGACACAGUUCGAGGACUGCACCGUCCUCACCAUCGCCCACCGGCUCAACACCAUCAUGGACUACACAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-612.50 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -638.56
Frequency: 0.0000
Diversity: 354.17
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((...))(((..(((((..((((....(((((((((...)).).)))))).))))..((((((.......(((((.(((((..((.((.((((.((..((((.((((...))))...))))....(((.((((....)))))))..)))))).)))).))))).)))))....)))))).((((((((((((.(((((.....(((.((.....)).)))..((((...((.(((((.((((((.((.(((((((((.((((((((((.(((((((((((.((.(((((((((.((..((((((..(((((.((((((((.((((((..(.((((.(....))))).)..))))))....))))))))((.(.(((((((....(((((...(.(((.(((((((((((...(((((.....)))))))))).))))))))).))))))..))).)))))))(((((((..(((((.((..(((..(((((..((((((.(....((((((......)))))).....((((((.((((..(((.((....)))))..))...))..)))))).....(((((...............))))).((((((((.((((.(((((((((((((((........)))).)))).........)))))))))))((((...(........)...))))....))))))))..).))))))..))))).)))..)))))))))).)))))))))..))))))..)).))))(((((((.......)))))))...((((((.((((......))))))))))(((((.(((((((.((((((((.(((..((((.(((((..(.(((..((((((.(((((((...))))))).)))...)))...))).)..)))))...))))))).)))))...))).))))))).((((..(((((((.....))))).).)..)))))))))))))).)))).((((((((((((((((..........)))))......(((.((.((.(((((((((((((.(((...((((......))))........(((((((((...(((..(.(((.(((((((((((((..(.((((.....)))).)..))))(((....((((......))))...)))..(((...((((.....(((((.......)))))....))))..)))........))))))))).))))))).)).)))))))(((.((((.........)))).))).(((((.((...(((((....)))))....)).))))).))))))))))))..))))))))))))))))))))))..((.((...((((((......))))))....)).))....))))))))).)))))))))..((((((((((((((.((((((...)).))))...))))))....))))))))....).))))))))).)).)))))).))))).)).))))((((((.((((...((....))...)))))))))).....((((...))))((((((......))))))......)))))..)))))........)))))))))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
({...})(({..(((((..((((....(((((((((...)).).)))))).))))..((((((......,{((((.(((((..((.((.((((.{(,,((((.(((,...,})),.,))))....(((.((((....)))))))..}})))).)))).))))).)))))....)))))).((((((((((((.(((((.....{{,.{(,....)),|||..((((...((.(((((.((((((.((.(((((((((.((((((((((.(((((((((((.((.(((((..,((.{{{(((((((((((((((((,((((,((,,,({((.((,,.({{{.|,|||.|..|||{{..{{{{,,,,,,)})}...}}}||...))}.|.}}}}}}.}}}}.})}})}.))))))))|{..{{.||{{{{,{|,.,||||({||{{{..|,....,,{{{({.,..((((((((((((.,.,,.......,,.....(((({..(((..((({,((((({(((((,,....,||||,|({{{{(((|{{,,..},}}},,{{{.{{{...,))))}}...(((((..,............))))).})))))))}((((.((((((({{{{{{{,{{{{.{{.,,,),})))}........)))))))))))..,))))))))))..)))}))))...,{(,(((((..{{{(((({.{....,}.))))))))..))))).)))}}.(((((.,.(((......}}}.}}}))))),,...)))))))}..((((((.((((......))))))))))|||||.,,|||||.,,,{|{,{..||}}|},|}|||,|.,|}|||}},||.,|,(((((((...))))))}.|||...))}...},)})}}))))).}}.||||,..)))),.{{||,.,))))},.((((..(((((((.....))))).).)..))))))},,))))).))}),((((((((((({((((.....,,...}}}}}......(((.((.((.(((((((((((((.(((...((((......))))........((((((({{...(((.,{.(((.(((((((((((((.,(.((((.....)))).)..)))}(((....((((......)))),..)))..{((...((((.....(((((.......)))))....))))..))}.,....,.))))))))).))))))).)}.)))))))((({((,{.........,)))}))}.(((((.{{...((((,....,,}}),}}})}.))))).))))))))))))..)))))))))))}))))))))))..((.((...((((((......))))))....)).))....))))))))).)))))))))..((((((((((((((,((((({...,}.)))).,.)))))),}...)))))))....).))))))))).)).)))))).))))).)).))))((((({,((((...((....))...)))))))))).....||||,,.))}}((((((......))))))......)))))..)))))........))))))))))))}))
Back