Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_ABCC1_0021600
Sequence Length
1024 nt
GC Content
0.4219
GUGUGAGCCACUGCGCCGGCAACGCUGUGAUUUUAUAGCACGUCCACAAAAGGGCUGCAUGUCUUGCCUAAAAGUUGCCCGGCGUUUUCUUGUUAUGUGCCGUCUGCAGUGCCCCUGAGCUUGGCCAUGUGCUCUGCAGCCUGGUUCAGCACCUGUGUGUGCCCUGGACGGGGAGGUGCAUUCCCCGAGGCUAAAACCAGUGAACCUGGCCCAGGCCAUAUCCAGCUGUGGGCCUCAGGAAAUGCUGAACUGAACUACUUUUCAAAAGGAGGGUUGUGUGUCCCUGGGCAAGUUACCGCCCCUCUCUGUGUCUCAGUCUCCUUGUGUGUAAACUGGGGAUAAUGAAAGGACCCUCCCACAUGGGGUUGCUGUGAGGAUUGGAUGAGACACUGCGAUACAGAUGCUGCUUUUAUCCUUGCCUUCCUGCCGGGGUGGGCAGCCAGGGUAACUCACUUUUAUUGUCGUGUCUGUCCAGAGAAGACCACUCAUUUCAUUGACUCCAUUUAUAAAUAUUUAUUUAAAUUUUUUUUUAUCAAAAAGUAAGUUUUAUUGGCAUCUAAAAACAAAAUUCACCCAACACUGAAACAUACUUCAAUAUUUAUGUUAUUGUUUUCUUGUUUCUUUUUUACUCACUGCAGUGUGAGGAACAAAUCACAUUUACUUUGGAGAAACAGAGACCAUAGUGUAGAUUUUACAAAAUCACUUUUUAAACUCUCUGUAUUGCGCUCCUCAAAUACCUAGAGCCAGUCUGUGCAUAACAUGGCACACUGUUGUCUAAACCGUAAAAUUUUGCAUCAGCCUAAAGAUAUGGAUAAGAUAUACCUCCACUUGCUCUUUUGAAAUACAUCUAUUACCUUAUCCAGCCUAAUGAUAGUUACCUAAAAAAUUCUUUGUUCCGUAGGAAGUCUCUGACAAGCUGUUAUUCAUUUCCUUGACGUUAAAAGAAUCUGGGGGCAACAUUUAUAUUUUAUCAGAAAAACUUUUUAAAAGUUUACCUAUCAUGUUCAUAUUGAGAACAAUGUCU

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-270.30 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -288.97
Frequency: 0.0000
Diversity: 233.40
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((((....(((((((((((((((((....))))))..((((......)))).(((.....)))......)))).))))))).........((((((((.((((((.((.(.((.((...)))).).)).)))))).).(((((((((((((.((.(((.((((((((((((.....))))))).((((....((((.....))))....))))...)))))..))).))..))))...)))))))))........((((((((((((((..(((((((...((((........)))).(((((((.((((.((((((..((......)).))))))........((((((.......))))))((.(((((...(((((.((((((.((((((.(((.(.((...((((((((((((.(((....))).)))))...)))))))..)))))))))))).)))))))))))((((.((....)).))))...((..(((...(((((.((((((((..................))))))))))))))))..))........................((((((.....(((((.......)))))......)))))).......))))).))(((((((........))))))).......)))).)))))))((((((((((((((((((................((((..(((((..........)))))..)))).((((..((((........))))))))...........)))))).)))))))...........)))))....)))))))..)).)))...))))))))).....((((((...............))))))...((((....(((((((....((((((((((...(((((...)))))...)))))))..)))...))))))).))))))).))))............((..(((((((...)))))))..)).....)))))))).((........)).
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((((((....(((((((((((((((((....))))))..((((......)))).(((.....)))......))))}}}))))).....,,,.((((((((.((((((.((.(.((.((...)))).).)).)))))).,.(((((((((((((.({.{((,((((((((((((.....))))))).((((....((((.....))))....))))...)))))..}}),)),.))))...))))))))){{{......|||,...((((((((.{.(((({{,((((........))))....(((...,,|||,...,..||,.,...}),))))))}.....,.)))))))),.|||}((((((..((((((,.((((({((((((.((((((.{(,.(.{(...((((((((((((.(((....))).)))))...)))))))..))}}},)))))).))))))|||,|((((.(,....}).)))).,,)))...,...,,{{,.....,,.||||......,,,.{{{{{((((((((...{{(((,.{{{{......................((((((.....(((((.......)))))......)))))).......({{{{....,,}|})).......,,,,,,.......(({{..(((((((...,{{.((.(((((....}))))}}.........))))))),{{,.,|||,.........,}))))))}}.(((((........))))).,|,{((((...(((((...{{{.((....))..}},..))))).,.))))).},..,,})))))).))))))....}}}}}}.}.)))))}.)))))}.||}||||...((({....(((((((....((((((((((...(((({...}))))...)))))))..)))...))))))).})))))},,)}}..,.........||,.(((((({...}))))))..,,.....)))))))).((.,....,.)).
Back