Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_AC092964.1_0000100
Sequence Length
416 nt
GC Content
0.5192
GUUGAACUAUACUAUUAACAGAGAAUGGCCAGCCCAGAAUCCUUCAGCCCAUGUCUGGAUUCAGCAGCCAUGGGCCACAAGCACGUGACAACUGAUAACCAAAUUCAUGGAACUUAUUUAGCAGACAGUCAUCAAACCUGGUAAGAGCAGCUCAGGAAGGCAGCAGGCAUGGCUGUGGAAGAAUCUGAAAGAGGCCGGGCUCAGUGGCUGACACCUGUAACCCCAGUACUUUGGGAGGCCGAGGCAGGUGGAUCACCUGAGGUCAGGAGUUUGAGACCAGCCUGACCAACAUGGUGAAACCCUGUCUCUACUAAAAAUACAAAAAUUAGCCGGGCAUGGUGGCGCACUCCUGUAAUCCCAGUUGCUUGGGAGGCUGAGGCAGGAGAAUCGCUUGAACCUGGGAGGCGGAGGUUGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-133.30 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -139.21
Frequency: 0.0001
Diversity: 76.16
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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