Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_AC144530.1_0000300
Sequence Length
390 nt
GC Content
0.5000
GUGAACUUAAUAGAGCAUUAGGUCUGUCAUCACUCUUAAGAGGCGUGAAGGCAGAAGAAUGAGGCAGGGUAGCAGCACAGCCCACUUGAUUCAACCCUGACAGCGACAUGCACAAGGCACUAUCAUCAGUGUGCUGAGACCUUCUGGAUGGGAAGGGGCACUCACCAUCUACGCCAUCUAGGAGCGGGUGCUGUUUUUGUGGACUUUGUGAUGCUUUUUGUUUGACAAAGUCCAGGACAGCAUCUCUCUGGAUCUGCUUGGUCCUUAUUUUCUCCUCCUCAUACUGCAGGGCAGCAAGCUGAGCCUCUCUCCGAGUGCGCUCUACUAACUGCUCCCUUCUCUGAUGAAGUUCCAGGUCUGUGUGUGACAGCUGAUUGUGACUUGCUGAUA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-132.80 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -138.89
Frequency: 0.0001
Diversity: 39.20
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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