Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_ACAP2_0000400
Sequence Length
871 nt
GC Content
0.3352
GUGAUCAGCCUGCUUUAGCCUCCCAGAGUGCUGGGAUUACAGGCGUGAGCCACCGCACCCAGCCUAAUUUGCCUUUUGAUUCCUUCCCAUUGUUGUCAACAAUUAAGUCUAUUCUUCUUUUAGAAAUUAUAUGUAAAUGAUAUUAUUGAUACUCUUUCUAAAUAAGAGGUUUUAAAAUAUAUAAAAACUUUAUGAUCCAAUUAUAGAUAAAUUUUCUAACAUUUCCCAGUCACUAGGGUUUUAUAAGUUGAUUAAACAUCAAAUCAGAAUCUAGCCAAGCAGGAAUUAUAUUGAAAUAAGUUCACAUUACAGAAAAGGUUCCAUAAUUUGGCCAAACUGCAUGCAUGUAAUGCUUAUUUAGUAAUGGUCACUGUAUGUUAGAUAAGGAUAAAAAUAUAUUUGUGAAUUACUUCUGAGGAAAUGCUAACUUCCACAGCAUUGUAUUUAAUUAUAACAAUAACAGGAACAUUAAAUCUUUAUCUUUGCUGUUUCACCUCAAAGUCAUAGAUCAUCUGGCUUUUUAGGCACCUUCACUAAAGGCAAAAAUCUGAUUUGUAGUUUUUAUUAGCAUGUACCUUGAAAUUAUUUGACCAAGAAGCUCAAAGAAAAGAAGUACGUUAAAGAAAAAGAAAAAACCUCACUUUUCCUUUAUAGUGUCCCUUCCUGUUUUAAUUCCUAAAGAUCCUGACUUUUAUCUGAGGAAGUCUAGGUAGUUUUCCUUUUGGAUCUGGCCAUUGGUGCGUGUUUCAUUCAGAUCACCUCUGGAAUCUCUGUGGUUGUGAAGGCAAUUCCUUAUGAGACUCUUGCCUCCUGUGGCUUACGUGAUGAAUUGUUAAUAUGGCAGUAAUUAAUUAGUAUCUACUUAAAUUUA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-173.70 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -194.07
Frequency: 0.0000
Diversity: 269.80
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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