Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_ACAP2_0002300
Sequence Length
564 nt
GC Content
0.4592
UCAGAAGUAAUGACAGUGGAAUUCAGCAGAGCUCUGAUGAUGGAAGAGAAUCUUUACCCUCCACGGUGUCAGCCAAUAGUUUAUAUGAGCCUGAAGGAGAAAGGCAAGAUUCUUCUAUGUUUCUUGACUCGAAACAUCUUAAUCCAGGACUUCAGCUUUAUAGGGCGUCAUAUGAAAAAAACCUUCCUAAAAUGGCUGAGGCUUUGGCUCAUGGUGCAGACGUGAACUGGGCCAAUUCAGAGGAAAACAAAGCGACACCACUUAUUCAGGCUGUAUUAGGGGGCUCUUUGGUGACGUGUGAGUUCCUCCUACAGAAUGGUGCUAAUGUCAACCAAAGAGAUGUCCAAGGGCGGGGACCAUUGCACCAUGCCACCGUCUUAGGGCACACAGGGCAGGUAUGUUUAUUCCUAAAACGAGGUGCCAAUCAACAUGCCACUGAUGAAGAAGGGAAAGACCCUUUGAGCAUAGCUGUGGAAGCAGCCAAUGCUGAUAUAGUCACCUUGUUACGUUUAGCAAGAAUGAAUGAAGAGAUGCGGGAAUCAGAAGGACUUUAUGGACAGCCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-157.20 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -168.84
Frequency: 0.0000
Diversity: 129.66
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((.......)))(.(((((.......(((.((((.........))))..)))......)))))((((((.((...........(((((((...(((((((........)))))))(((((((.......)))))))........(((.((((((((...(((((.(...............).)))))....))))))))))).)))))))(((.(((.......))).)))..(((....)))......))))))))..((((((((((((((((((.(..((((((((((((((...(((.((...........)).))).))))).))))))))).(((((.(((((((((..(((......))))).))))))).)))))..(((((((.((..(((....(((......)))....)))..)).)))).)))(((..((((((.....))))))...))).(((((....)))))...).)))))))))))..(((((((....)))))))..)))))))...(((......)))............(((....))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((.......)))(.,(((..,(({..((({,(((,.{{{{.{,{({,..|}}}}.,|,|||,,((((((.((.....,{{{.,{((((((,,,(((((((........}}}}))}(((((((.......)))))))........{|{.((((((((,,.(((({.,,.....,..........}))))....))))))))})},))}||}|(((.(((.......))).)))}..,{....}}}......)))))))).,(((((({((((((((({{.,..((((((((((((((...(((.((...........)).))).))))),,)))))))).(((((.(((((((((..{({......))))).))))))).))))),,(((((((,((,{{{{....(((......)))....,,..,}}.)))).))).||..((((((.....)))))).,{|||.(((((....)))))..,)})))))))))))..(((((((....)))))))..))))))),}.|,|......))))..,}}.)))}.}})}...))))
Back