Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_ACAP2_0002500

Sequence Length

911 nt

GC Content

0.4336

GAGCCUUGGGGUUCAUUUUUCAAAAGUACGAUCUUUAACUUUAGACACCUGGGAGCCAGAACUUUUAAAGCUUAUGUGUGAGUUGGGGAAUGAUGUUAUAAAUCGAGUUUAUGAAGCUAAUGUGGAAAAAAUGGGAAUAAAGAAACCCCAACCAGGACAAAGACAGGAGAAGGAGGCAUAUAUCAGAGCAAAAUAUGUGGAGAGGAAAUUUGUGGAUAAAUAUUCUAUAUCAUUAUCACCUCCUGAGCAGCAAAAAAAGUUUGUCUCUAAAAGUUCUGAAGAAAAGAGGCUGAGCAUUUCUAAAUUUGGGCCAGGGGACCAAGUCAGAGCAUCUGCCCAAAGUUCAGUCAGAAGUAAUGACAGUGGAAUUCAGCAGAGCUCUGAUGAUGGAAGAGAAUCUUUACCCUCCACGGUGUCAGCCAAUAGUUUAUAUGAGCCUGAAGGAGAAAGGCAAGAUUCUUCUAUGUUUCUUGACUCGAAACAUCUUAAUCCAGGACUUCAGCUUUAUAGGGCGUCAUAUGAAAAAAACCUUCCUAAAAUGGCUGAGGCUUUGGCUCAUGGUGCAGACGUGAACUGGGCCAAUUCAGAGGAAAACAAAGCGACACCACUUAUUCAGGCUGUAUUAGGGGGCUCUUUGGUGACGUGUGAGUUCCUCCUACAGAAUGGUGCUAAUGUCAACCAAAGAGAUGUCCAAGGGCGGGGACCAUUGCACCAUGCCACCGUCUUAGGGCACACAGGGCAGGUAUGUUUAUUCCUAAAACGAGGUGCCAAUCAACAUGCCACUGAUGAAGAAGGGAAAGACCCUUUGAGCAUAGCUGUGGAAGCAGCCAAUGCUGAUAUAGUCACCUUGUUACGUUUAGCAAGAAUGAAUGAAGAGAUGCGGGAAUCAGAAGGACUUUAUGGACAGCCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-253.70 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -269.81

Frequency: 0.0000

Diversity: 169.16

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

(((((((..(((((...((((.((((......))))..(((((((...((((...))))....)))))))(((.(((.(..(((((((.......((((...((..((((.....((....)).....))))..)))))).....)))))))..).))))))....((.((((.(((.((((((((.((......((((..((.......((((((.......))))))......)).(((((((((((((.....((((.((((.((.....(((((((.......((((.(((((.(((..(((((((((((((..(((.((((((((.(((((......((((((((.......))))..)))).....)))))))))))))..)))..(((((((((..((((((.(((..(((..............)))..)))..))))...)).)))))))))..(((((((.......)))))))............((((((((...(((((.(...............).)))))....)))))))))))))))))).)))..))).)))..)).))))..)))))))........)).))))..))))......))))).))))))))((((((((((((((...(((.((...........)).))).))))).))))))))).(((((.(((((((((..(((......))))).))))))).)))))))))..)).((((((((.((((((......)))....))).))))))))....(((..((((((.....))))))...))).(((((....))))).....))))))))))).)))).)).((((((.......))))))..)))).....)))))..)))).)))..(((....))).

Thermodynamic Ensemble Prediction

(((((((..(((((.,,({{{.{{{{.....,||||..(((((((...((((...))))....)))))))(((.(((.(..(((((((.......((((..,({..{{({.,...{(,...}}.....,}}}..},}}},.....)))))))..).))))))....((.((((.(((.((((((,,.,,,.....|||,,.,,.,,.,,.((({((.......)))))),..,,.}}.(((((((((((((...,.((((.((((.((.....(((({{{,......((((.(((((.(((..{({((((((((((..(((.((((((((.(((((......((((((((.......))))..)))).,,..)))))))))))))..))).{(((((((((..({((((.{((..(((...,,....||...))),,)))..))))...),.)))))))}},,{((((((.......))))))},,......,}}.((((((((,,.(((({.,,................}))))....)))))))))))))))))).}))..))).)))..)).))))..)))}}}),,,.....)).))))..)))).,,...))))).))))))))((((((((((((((...(((.((...........)).))).))))),,)))))))).(((((.(((((((((..{({......))))).))))))).))))){{(((((((,((,{({{....(((......)))....,,,.,}).)))).))).}}..((((((.....)))))).,{(({.(((((....)))))..}))))))))))))).)))).)).((((({.......))}})).,)))),....)))))..)))).))),.(((....))),