Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_ACAP2_0004800
Sequence Length
394 nt
GC Content
0.4569
AUGUUGUCAUUUAUGUAUGCCCAUUUGGCCUUCUUUCAUCAAGGAUAUGAUCUGUUUAGUGAACUUGGACCCUACAUGAAGGAUCUUGGUGCACAGAAGGAGAAAGGCAAGAUUCUUCUAUGUUUCUUGACUCGAAACAUCUUAAUCCAGGACUUCAGCUUUAUAGGGCGUCAUAUGAAAAAAACCUUCCUAAAAUGGCUGAGGCUUUGGCUCAUGGUGCAGACGUGAACUGGGCCAAUUCAGAGGAAAACAAAGCGACACCACUUAUUCAGGCUGUAUUAGGGGGCUCUUUGGUGACGUGUGAGUUCCUCCUACAGAAUGGUGCUAAUGUCAACCAAAGAGAUGUCCAAGGGCGGGGACCAUUGCACCAUGCCACCGUCUUAGGGCACACAGG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-107.80 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -115.68
Frequency: 0.0000
Diversity: 113.41
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((....)))(..(((.(((((......((((........))))(((((((((((..((((((((((((........(((((((((((.(...............).))))))))))).(((((((.......))))))).....))))))..)))).))..))))...))))))).........((((((((.(((((((((((((((.(((.((((.(((.......))).)))).....))).....))))))...........)))).))))).))))))))((((((((((((((...(((.((...........)).))).))))).))))))))).......(((((((((..(((......))))).))))))).))))).))).)
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((....)))(,.(((.(((((....,(((({,,{{{,{.|,||{,,,|||||,{...{({|{(({(((.,,,....{{|||{|||{|,|.,,|..,.,,,,...),)}))))}}})),(((((((.......)))))))......|||||.((((((((...(((({.{|..............|.}))))..,.)))))))),}|||}{{{.((((,(({.,.||,.}})|)))}..,,,},}},.....,{{......|.,,..,}}},))))),}}}|||,|((((((((((((((...(((.((...........)).))).))))),,)))))))).}.))).{((((((((..{{{......})))).))))))}.))))).))),)
Back