Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_ACAP2_0007000
Sequence Length
2205 nt
GC Content
0.4213
GUGUGAGCCACUACCCUUGGCCCAGUUCAGAUUCUAUGCCUUAAUUUUAAUCUUUUCUGAUUAGAUUCUUUUUAAAUAUAUAAGAGGUCUAUUGCUAUACUAAACUUCAUAAUGGAUUAGAAAAGCUUUUGACACCAUUGGGUUGUUUCAGCAUACGAUGAUUUGCAAAUUUAUAUUUGUCAGGUUAGGAGUCAUCAUACCAAGUCUUCCUUUUUUCCCUGUGUCUAAGAAUUUAUAUCUAUGAAAAUGUCAUAAAUAAUUUUAGACCACUACCGGUUUCUGAUAAGAUUUACAAAAUUCGAAAUAGUAGUAUAAUCCUUUUAAUUCCUGCCAUCUAGUUUACCAUAUUGUAGAAAAUAGAUGAGUUUAAGGGUUGGAGUAUAUGCUCAUUUGUUUCUGUCUGAAAUCCUGUGGCCGGGUGCGGUGGCUCAUGCCUGUAAUCCCAGCACUUUGGGAGGCCAAGGUGGGCAGAUCACUUGAGGUCAGGAGUUUGAAACCAGCCUCGCCAACAUGGUGAAACUGUCUCUAUUAAAAAUACAAAAAUUAGCCAGGCGUGGUGGCACACACCUGUAGUCCCAGCUACUCGAGAGGCUGAGGCAGGAGAAUUGCUUGAAUCCAGGAGGCAGAGGUUGCAGUGAGCCGAGAUCGCACCACUGCACUCCGGCCUGGGCAACAGAGGAAGACUGUGUCUCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAAAAAAGAAAAAAGAAAGACGGAAAGUAGAUACUAAUUCCCAUUCUUUUUAAAAUAGAAUGUUUUUAAUUUUUUUUGAAAUUCACUCAUUUUUAUAAGAAUAUUUUUCAAAUUUUAAUCGUAGUAUAUUGUGAAUUUAUUUAGUGUAGAGUAGAAAAUGUGUGCCUAACUCUUGAUAUUUUUUCCAAAUUCUCUCUUUUUUUUGAGAGGGAGUCUCGCUGUGUCGCCCAAGCUGGAGUGCAGUGGCGCGAUCUUGACUCACUGCAAGCUCCACCUCCUGGGUUCACACCAUUCUCCUCCCUCAGCCUCCUGAGUAUCUGAGACUACAGGUGCCCACCACCACACCCAGCUAAUUUUUUGUAUUUUUAGUAGAGAUGGAGUUUCACCGUCUUAGCCAGGUUGGUCUCGAUCUCCUGACCUCGUGAUCCACCCGCCUUGGCCUCCCAAAGUGCUGGGAUUACAGGCGUGAGCCACCGCGCCCGGCCUUUUUUUUUUUUUUGAGACGGAGUCUCACUUUGUCACCCAGGCUGGAGUGCAGUGGUGCAAUCUCGGCUCACUGCAACCUCUGUCUCCUGGGUUGGAACAAUUCUUGUGCCUCAGCCUCCCAAGUAAUUUUUUUUUUUUUUGUAUUUUUUGUAGAGACGGGGUAUUGCCAUGUUGCAAAGGCUGUUCUUGAACUCCUGGCCUCAAGUGAUCUGCCUGCCUCGGCCUCCCAAAGUGCUGGGAUUACAGGCAUGAGCCACCACACGCAGCCAGUUUUUCCAAAUCCGUAACCACCUUUCUUAGCAUCAGUAAUUGAAAAAUCCUUUCCUUUCCCAUCAUUUUCUUAUUUUUCCUUUGCCUUACAUUAAAUUUCUUGUAAAUAAGGUUGAUUUCUGUGCUACUAGUCUGAUGCAGUGAUGUCUCACAGUACCAGUGCAGAUUUUAAAGAAGACUUUAUAUAUAAUAAUUAGUAUCUUUACUUUAAAAAUGAAAAAUAUGCUGUAUAAAACUAGAAGUAAUAAUUGCUCAAAGAAGGAAUUAGCACAUUUAAGAUUUUUAAGAGGUAGCUGGGCUAUGGGAAGAGGGGAAAGAAAGUGACAGGGAGAGAUAGUAGAAACAAUAAAUGGAAGGCUGGGCGCAGUGGCUGACGCCUAUAAUCCCAGCACUUUGGGAGGCUGAGGCAGGUGGAUCACCUGAGGUCCGGAGUUCAAGACCAGCCUGACCAACAUGGAGAAACCCCAUCUCUACCAAAAAUACAAAAUUAGCCAGGCGUGGUGGUGCAUGCUUGUAAUCCCAGCUACUUGGGAGGCUGAGGCAGGAGAAUUGCUUGAACCCAGGAGGCAGAGGUUGCAGUGAGCCGAGAUUGUGCCAUUGCACUCCAGCCUGGGCAACAAGAGGGAAACUCCAUCUCAAAAAAAAAAGGAAUAAAUGGAAAUGACAGAAGAGGGAUGUCAUAGAAAUAAUGGGACCUCAAAAGGGCUCAUGAUUAAGGAAAAGGAGAGAGGCUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1086.40 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1116.55
Frequency: 0.0000
Diversity: 341.50
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((((((.......))))........((((((..((((....(((((((......)))))))..(((((((......)))))))..(((((.(((.((((((..(.((((((.((((((....))))))..)))))).)..)))).)).))))))))....((((((....)))))).))))..)))))).))))))((.(((((.(((((((.(((..(((........(((.(((((((....(((.((((....))))))).(((((..(((((.((...............))))))).)))))...((((((((...((((((((((((.(((((......)))))...)))))).))...))))...((((....)))).......((((((.....(((...((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((..((((((..(((((((((((.((((.((((((((.((.((.((((((((((((((((((((((((((((((((((((((..((.(((((((....(((((((((((.(((.((((((.((((((((((.((((((((.(..(((((((((((((..(((.((((((((((.(((((((((.(((((((((((((((.(((((.(((.((..(((((.(.((((((((((((..((((((((..(((((...........(((((((.(((((((....)))..))))...)))))))...........)))))..)))))))).((((((((......((((...((.((((...)))).))....))))......)))))))).........(((((.(((((.((((............)))).)))))...)))))...)))))))))))).).)))))..)).))).))))).))))))))))))))).))))))))).)))))))))).)))..)))))))))))))..).)))))))).)))))))))).)))))).))).)))))))))))....))))))).))..))))).))))))))))))))))))))))..))))))))))).)).)).)))))))).)))).)))))))))))))))))..))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))((((((((((((((((((.(((((.((.((((((..((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((.((.((((((((.(((((((((((((((((((...........((((((((((((.(((((((.(((((.((.((((((((...((((((.(((((((((((.(((((((.(((((((((((((((((((((((((((((((((((((((.((((.(.((((((..(.(.(((((.....(((((..............((((...((....))....)))).........(((((((.((((((((((...((((((((.(((.......((((..(((((.((((((((((..((((((((..((.(.(((.(((....))).))).).))..))))))))..))......)))))))).))))).))))((((....))))((((((((...((((.(((((.......((...(((((...)))))...)).......))))).))))...))))))))...(((((...)))))))).))))))))))))))))))..))))))).................)))))))))).).)..)))))).).)))).))))))))))))))))))))))))))))))))))))))).))))))).))))))))))).))))))...)))))))).)).))))).))))))).)))))))))))).....((((((((......))))))))..........))))))))))))))))))).)))))))).)).))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))..)).)))).)).))))).)))))))))))))))))).....)))...)))))))))))))).))))))).)))(((((.(((.....)))))))))))..))).))))))).)))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((((((((.......})))........((((({..((({....(((((((......))))))).,((({(,,......,)))))|((.{{{(,({{.((((((..{.{{((((.{||{{{....,}))))..)))))}.}.,}}}}.)),)}}))))),,..((((((....)))))}.))))..)))))).))))))(,,(((((.(((((((,((({.((((((((..{(((...(((((.....))))).)))}))))))))}(((((..(((((.((,............,,)}))))).))))).,{((((((,,{{,{{,,((((((((.(((((......)))))...)))))).))..,))))))){{{{.,,,|}}|,,{{.((((((((.....(((...((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((..((((((..(((((((((((.((((.((((((((.((.((.((((((((((((((((((((((((((((((((((((((..((.(((((((....(((((((((((.(((.((((((.((((((((((.((((((((.(..(((((((((((((..(((.((((((((((.(((((((((.(((((((((((((((.(((((.(((.((..(((((.(.((((((((((((...,,,,,,,,,{((({,.....,,,,,(((({({.(((((((....)))..))))..|))))))}.....,,,,,,}))))..)))))))).((((((((......{{{{..{{{,{,,,....,},.,}....}})}......))))))))....,{.{.(((((,({{{{.{{{|..,.....,,..)))),)))))...,}}}},..)))))))))))).).)))))..)).))).))))).))))))))))))))).))))))))).)))))))))).)))..)))))))))))))..).)))))))).)))))))))).)))))).))).)))))))))))....))))))).))..))))))))))))))))))))))))))))..))))))))))).)).)).)))))))).)))).)))))))))))))))))..))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))((((((((((((((((((.(((((.((.((((((..((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((.((.((((((((.(((((((((((((((((((...........((((((((((((.(((((((.(((((.({.((((((((...((((((.(((((((((((.(((((((.(((((((((((((((((((((((((((((((((((((((.((((.(.((((((..,.({(,,(({{{,,(((((.....,........,{{{...,,....,,....)}},.....,,,.(((((((.((((((((({.,((((((({,,(((,,,.,,,{{..,,((({{.(({{{(((((,,((((((((.,((,(.{{(,(((,,..}||,|||,}.}}..})))})))..}||,,,..||}}}}}}.},,,}.,,.,|||,||||},||{{{{{{{{...{{{{.{||||,,,...,||,}.|||{,...,}}}}...,,.,,,,,,))))}.)))),,,)}}))))),,,|||||.,})),},))),))))}}}}))))))))))..)))))))...,.....,.......))))))))))}),)..)))))).).)))).))))))))))))))))))))))))))))))))))))))).))))))).))))))))))).))))))...)))))))).}).))))).))))))).))))))))))))..,,.((((((((......))))))))..........))))))))))))))))))).)))))))).)).))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))..)))))}).)).))))).)))))))))))))))))).....)))...))))))}}},)))),,)))},,|||.(((((.(((....,))}))))).,},.})),))))))).)))))))
Back