Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_ACAP2_0008200
Sequence Length
752 nt
GC Content
0.4468
AUGUUGUCAUUUAUGUAUGCCCAUUUGGCCUUCUUUCAUCAAGGAUAUGAUCUGUUUAGUGAACUUGGACCCUACAUGAAGGAUCUUGGUGCACAGUUGGAUCGACUGGUUGUGGAUGCAGCAAAGGAGAAAAGAGAAAUGGAGCAAAAACAUUCCACCAUUCAACAAAAGGAUUUCUCCAGUGAUGAUUCUAAGUUAGAAUAUAACGUAGAUGCUGCAAAUGGCAUAGUUAUGGAAGGAUAUCUGUUCAAACGAGCCAGCAAUGCCUUCAAAACUUGGAACAGGCGCUGGUUUUCAAUACAGAAUAAUCAGUUGGUUUACCAGAAAAAAUUUAAGGAUAAUCCGACUGUGGUAGUUGAAGACCUCAGGCUUUGCACAGUGAAACAUUGUGAAGACAUAGAGCGACGAUUCUGCUUUGAGGUGGUCUCGCCAACAAAAAGUUGCAUGCUCCAGGCAGAUUCCGAAAAGCUGCGCCAGGCAUGGAUUAAGGCUGUUCAGACCAGUAUUGCUACUGCUUAUAGAGAGAAGGGUGAUGAAUCAGAGAAGCUGGAUAAGAAAUCAUCUCCAUCCACAGGAAGCCUAGAUUCUGGAAAUGAGUCCAAAGAGAAAUUAUUGAAAGGAGAAAGUGCGCUUCAGCGGGUCCAGUGUAUCCCUGGCAAUGCCAGCUGUUGUGACUGUGGCCUGGCAGAUCCACGGUGGGCCAGCAUCAACCUGGGCAUCACCUUGUGUAUCGAGUGCUCCGGAAUUCACCG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-199.90 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -216.09
Frequency: 0.0000
Diversity: 296.44
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..((..............(((.....)))..((((((((..(((.........((((((.....)))))))))..)))))))).(((((((((((((((.(((.((.....)).))).))))...(((((((.(((...(((((........)))))...)))..........)))))))((((.((.(((((((((.........((((((((((......)))))..)))))(((((((..((((((....))).)))..)).)))))..)))))))))))..))))((((((((((((........(((((((.(((((..(((...)))..)).))).)))))))..)).))))))))))....(((((((((((((...)))))))......))))))...((.(((((((.((((((.......((((.....))))))).))).))))))).)).(((.((((...(((....))).....)))).)))....(((((....)))))(((.....)))..((((((((..((((.((.(((((.............((((((....(((.(((..(((((.......)))))(((.((....)).)))..(((....(((.(((..((((.(((((((.......))))....))).))))..))))))....))))))...)))..))))))))))).))...)))).))))))))))))))))))).))..(((......)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
({(,...({{...{(,({((({{.,,|||((((((((({.,,{{,...{||{|,,,,.{{|,|{{,(((,{{|..,,..)}),}||,|||,|||,((((.{{{.((,,..,}|,|||,||||...(((((({...{...(((((........)))))...}}}.......,|,})))))),{{,.{{,(((((,((({.....}}}|,|||{{{{(||...,|||}|{{||}||{{{((,.,{((((({....|||{,}|{,||{|||||,.,,,})))),.}}})|||((((((((((((........(((((((.(((((..({,...,))..)).))).)))))))..)),,)))))))))...}||,{{,(((((((...))))))),,....{{(((((,,...{{|||||||,({{(,,..|}}|{,{.....))))),,||}}..}||||}}}},....}}))),}}||||}}||{{{,.,||||,}}},,,,|{{{{..,,}}}})|{{...,.}}}.,|((|(({{,,{({(.,..|||||,...,,.,}},))}}|,|||,,.|||,}}}}.||||||,,,...},,))}}..,,,...,,.,}}}}}}|}}..{{{.(((..((((.(((((((.|.....))))....))).))))..)))))),|||||||}|,,,}},,.}}}))))))}}.,}...})))})))))}},}))))))||,|||}..,{|....}})))
Back