Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_ACAP2_0008300
Sequence Length
1566 nt
GC Content
0.4681
ACUCCCCGGCCGUUUCCCUGCGGCCAGCGCUCUACUUGGGGCGGGAGGAAGAGGGGCGGGACUGGGGCCUGACUAGUCGUCGCCGUCUUCGCGGCUGCUAUGACCAGCGGGCGAGGCGCCCUUCGCAGCUCCGCGCAACGCUAGUCGCGGCCGUGCGCCCGCCGUAGCCGUCUGCGUCCCAGCGCGGCCGCUCCCGCGGCCCCCUCGGCUUUGCCAGCGCCGCCUGCGAGGCGGAGGCAGGAUGAAGAUGACUGUGGAUUUCGAGGAGUGUCUGAAGGACUCGCCCCGCUUCAGGGCAGCUUUGGAAGAAGUAGAAGGUGAUGUGGCAGAAUUGGAACUAAAACUUGAUAAGCUUGUGAAACUUUGUAUUGCAAUGAUUGAUACUGGAAAAGCCUUUUGUGUUGCAAAUAAACAGUUCAUGAAUGGGAUUCGAGACCUGGCUCAGUAUUCUAGUAAUGAUGCUGUCGUUGAGACAAGUUUGACCAAGUUUUCUGACAGUCUUCAAGAAAUGAUAAAUUUUCACACAAUCCUGUUUGACCAAACUCAGAGAUCAAUUAAGGCACAGCUUCAGAACUUUGUUAAAGAAGAUCUUAGAAAAUUCAAAGAUGCCAAGAAGCAAUUCGAAAAAGUCAGUGAAGAAAAAGAAAAUGCGUUAGUAAAAAAUGCCCAAGUACAAAGAAACAAACAACAUGAAGUUGAAGAAGCCACCAACAUUCUGACAGCAACAAGAAAAUGUUUCCGACACAUAGCCCUCGAUUAUGUGCUUCAGAUUAAUGUUCUUCAAUCAAAAAGGAGAUCAGAAAUCCUAAAAUCAAUGUUGUCAUUUAUGUAUGCCCAUUUGGCCUUCUUUCAUCAAGGAUAUGAUCUGUUUAGUGAACUUGGACCCUACAUGAAGGAUCUUGGUGCACAGUUGGAUCGACUGGUUGUGGAUGCAGCAAAGGAGAAAAGAGAAAUGGAGCAAAAACAUUCCACCAUUCAACAAAAGGAUUUCUCCAGUGAUGAUUCUAAGUUAGAAUAUAACGUAGAUGCUGCAAAUGGCAUAGUUAUGGAAGGAUAUCUGUUCAAACGAGCCAGCAAUGCCUUCAAAACUUGGAACAGGCGCUGGUUUUCAAUACAGAAUAAUCAGUUGGUUUACCAGAAAAAAUUUAAGGAUAAUCCGACUGUGGUAGUUGAAGACCUCAGGCUUUGCACAGUGAAACAUUGUGAAGACAUAGAGCGACGAUUCUGCUUUGAGGUGGUCUCGCCAACAAAAAGUUGCAUGCUCCAGGCAGAUUCCGAAAAGCUGCGCCAGGCAUGGAUUAAGGCUGUUCAGACCAGUAUUGCUACUGCUUAUAGAGAGAAGGGUGAUGAAUCAGAGAAGCUGGAUAAGAAAUCAUCUCCAUCCACAGGAAGCCUAGAUUCUGGAAAUGAGUCCAAAGAGAAAUUAUUGAAAGGAGAAAGUGCGCUUCAGCGGGUCCAGUGUAUCCCUGGCAAUGCCAGCUGUUGUGACUGUGGCCUGGCAGAUCCACGGUGGGCCAGCAUCAACCUGGGCAUCACCUUGUGUAUCGAGUGCUCCGGAAUUCACCG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-461.60 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -491.80
Frequency: 0.0000
Diversity: 459.46
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((((.((((((......))))))...(((((....))))))))))(((((..(((((((((((.......)))))).))))).)))))((((((((...(((.((((.(((.((.((........)).)).)))..)))).)))))))))))(((((((((((.(((.(((((.((.(((.(((((.(((..((.((((.....)))).))..))))))))))).)).)))))))).(((((.((((((.........((.((.....(((((.....((((((..((((.((((((((((....)))))..........(((((((.(((((.....(((((((.(((((((((..(((.((((.((((((((...((..((.....))..))...))))))))))))(((((((((...((((((.((((......))).).))))))...)))).))))).)))...)))))))))..)))))))((((((((((((...((((........))))..........((..(((((..(((((((...((((.....((((..(((...(((((..(((((((.((((......((((..(((.....(((....)))......)))..))))....))))....(((((.......)))))....(((((.(((.....(((((((((.((((((((........(((((((((.(((((((......))))......(((((((....).))))))))))))))...)))))))))))).....((((.........))))....)).)))))))..))).)))))(((.....))))))))))...)))))...))).))))...(((.(((.(((.(((......))).))).))).))).((((.(((.((.....)).))).))))...(((((((.(((...(((((........)))))...)))..........)))))))((((.((.(((((((((.........((((((((((......)))))..)))))(((((((..((((((....))).)))..)).)))))..)))))))))))..))))((((((((((((........(((((((.(((((..(((...)))..)).))).)))))))..)).))))))))))....(((((((((((((...)))))))......))))))...))))...))))))).)))))..))((((.....))))((((((....((((...........))))....))))))....))))))).)))))))))).))))))))))))...)).))..))))))....)))))....)).)).......)))))).)))))...(((.(((..(((((.......)))))(((.((....)).)))..(((....(((.(((..((((.(((((((.......))))....))).))))..))))))....))))))...))))))))))))..))........(((((....((((.....)))))))))(((......)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
.{{{{{.((((((......)))))).{{(((({....|}||||||}}(((((.,(((((((((((.......)))))).))))).)))))((((((((...(((.((((.(((.((.((........)).)).)))..)))).))))))))))){|{||||||{|,{,,.{{{((|{,.,,|}||((((((....)))))),{{{{,{((((,({{{,{{,||{{,.||{||||,|||{({,(,.((((,({(.{.,...,|.,|.}}|}|||,,.,..}|,||||}}|||}.}}}}.||,||}}..))))).,,,}}....(((((((.(((((.....(((((((.(((((((((..(((.{(((.((((((({...{{..{{.....}}..,,...))))))))))}}(((((((((...((((((.{(((......))).).))))))...)))).))))).)))...)))))))))..))))))){(((((((((((...((((........))))....{,,,,||{,{({,,,..,|||({({{{{.{{,,{(({((({{(((...(((({,.,{{{{||{((((.({....}).})))}{{,,,{{,||..|||......,||..,}},,.....,.....(((((.......))))),,,,((,({...{{{{,.,(({({{{,.|||(((((({,{,.,,{{({,,((({((((,{,.,,...,}}}.,.,.(((((((,....}.)))))))},}},||{{..{|,|||||,.......,|||}}.}}..}})),,........))))))}}.,.}))),}},.....))))))))))}.|,}}}}}...))).}))),,.{||.|||,||{.(((......))).))),))).}}}.((((.(((.((.,...)).)}},||||...(((((({...,...(((((........))))).,.||}.......}}.))))))){(({.{{.(((((((((.....,|||(,{{,{((((,.....))))}.})))))(((((,,.,((((((....)))},))..}},)))))..}))))))))}},.))))((((((((((((........(((((((.(((((..({,...,))..)).))).)))))))..)),,)))))))))....{{(({{(((((((...)))))))......}||||},..,,.,,}})))))}|,}}}}},}},{{{{.....))))|{{{||,..,{|||,,|,.....,,)))),,,.))))}),,,,)))))))}})))}))))).))))))),}|||...,,,,,.,|{{|{{{{..{{{{.{{.{||{|,.......,}}}}|{|||||,,.(({.{{{,.{{((({,.....}}}))|,..,,....}}.}},..{{{....{{{.(((..((((,(((((((.,.....))))....))).))))..)))))),.,,)))))),,,)}}}}}))))))}})).}}...}}||,||}}}}}}},.....}))))))).(((......)))
Back