Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_ACAP2_0016500

Sequence Length

1651 nt

GC Content

0.3525

GUGGAGGUUGCAGUGAGCUGAGAUCGCGCCAUCGCACUCCAGCCUGGGCAACAAGAGUGAAACUCAAAAAAAAAAAAAGUACAUGAUUUUUGUGACUUACGAGUAUUUUGUGUCACCUCACAUUUUCUUUGUGAAAUAAAAUAGAACUAGAAAUUUUAAAAAUCAGAGAUUUCCAUAUUAGGAAAGUUUUUCUUUUUCACAUUAAUAAUACAGGUUUUUCUCUUUUGAUUCCUGGCUGGGAAUAUAUAAAAUUAAAGUUUAUUAUAAUAGAGCUGUACAGUGGUGUUAGAUCUCAUUAAGAUAGUACACUGUUUUAAUAGGUUAGAAUUUGUUGUUCUGGAGGUUAUGUAUUACAGUUUCUUUUCUUUUGUUUUUUUCUUUUUUAAAUAUAGAGACAGGGUCUGACUCUGUUACCCAGGCUGGAGUACAGUGGCUUGAUAAUAACUCACUGUAACCUCGAAUUCCUGGGCUGAAGUGAUCCUCCCACCUCAGCCUCCUGAGUAGUUAGGACUACAGGCGUGGACCACCACUUCUGGCUAAUUUAUCUUUUAUUUUUUAUUAUUUGUAGAGGCAAGUCUCACUAUGUUGCUGAGGCUAGUCUCAAACUCCUGGCCUCAAAGCAGUUUUCUUACCUUAACCUCCCAAAGCACUGGGAUUACAGGCACCCAACCAAAUUCUUUAUAAAUUACUUUGUGAUGAACACUCAGAAUGUCUUCAUAGAAUGCACACAUAACAGUUUAUGGCAUCUUUCAAGGAGUUGAAUGUCUUUCUUACAUAUACUUUAUUAUGGUUUUUAUAAAAUCAUUUGUCUUCAAGUUAUUUUACCUAGCUCCCUAGUAGAAAAAUAAAAGCAAAGGGAUGUUAUGUGACUAAGAUCAUUAAUGAACCAAGUGUUUCAGAUUUUCAGACUAUUAAAAGGGAUACUGUUAUUCAUUGCUGAUGUAACGAUUCUUUCAGAAAUUGAUGUGUUCCAGCCUGGGCAAUAAUGUGAGACCACAGAAAUAAAAAAUAAAAAUUAGCCUUGUGUGGUGGCAUGUGCCUGUCGUCCCAGCUGCUUGAAAGGCAUGAGGUGUGAGGAUCGCUUGAGCCCAGGACUUUAAGGCUGCAGUGAGCUAUGAUCAUGCCACAGCAUGAGAAAUCAAUGUUGUUUCUUAGAGUGUGAUCUGUAGACCACCCAUGGUAGUAAAAUCAAGGACGUGUCUUAAAAAAUACUCCUCAGAUUUCUAGGAUUUUUCUCGAGGGCUAAAGAAUCAUAAUCUCUCGGAAAGGGCUCUGGAAUUUGCAUUUUUAACCAGUGCCCUGUAGAGAUUCUUAUGUAUACUACCGUUUAAAAAUCGUUUGGUUAAAUAAUGGUACAUGUCCCUGAAUUUGUCUUUAGAAAAACAAUUAACUUUAUGUUUCUGUAAUGUUAAUUAGAUAAUUUAUUGUCAUCUCAAGUUAUGUAGAUUUAAAUAAUGAAAUUUUAGCUGACUUUAUCAGGAUUUAUACAAAAUUGAGAAACAAUACAUAUUUUAGUUUGAAGAGUGAAUGUGUUUCAAUGUGAGGUGAAACAAAAAAUGGAGGAACAUAGGAAUUCAAUUCUAAAUGUUAUUUUGCUAAUUUUUUUUUUUUUUUGAGUCGGAGUCUUGCUCUGUCACCAGGCUGGAGUAUA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-490.20 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -521.28

Frequency: 0.0000

Diversity: 318.60

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

((((.(((....((((.......))))))).))))(((((((((((((((.(((((.(...((((((((((((((((((.....((((((((((.(((.(.(...((((((.((((((((((((.((((((.....((((((..........)))))).....))))))(((((......)))))((((((((...............((((((((...((((..(((((((.(.(((((..(((((......((((......((((.((((..(.((.((((((...((((((((((((((((....))))))))))....((((((.....))))))))))))...)))))).))..)..)))).))))......)))).....)))))..((((((((...)))))))).))))).).))))).))(((((.((((.(((.(((((((((.(((.(((.(((((((((.(((((((((((.(((((((((((..(((((((((.((((.(((((((((..(((((((....(((((((((.....((((((((((((.(((((.(......(((((((..(((((((((((((((..........)))))))).......................(((((......)))))...(((((...............(((((((....))))))).((((((((((....(((....(((((...(((((((((......(((((...((((....))))))))).......((((........))))(((....((((((.(((((....))))).))))))...)))(((((...................))))))))))))))....(.((((.(((((((...((((((((....................))))))))....))))))).)))).)....)))))...)))..)))).))))))..))))))))))))..))))))))))))))))))))))))))))))))))....)))))))..))))))))).)))).)))))))))..)))).))))))).))))))))))).))))))))).))).))).))))))))).))).)))).))))).....(((((((.......)))))))))))...)))))))).((((....))))((((((.(((.((((((((............((((((((.............))).)))))....((.(((((((..((((....(((((.((((...............)))).)))))...))))...))))).)).))((((((....((((....))))....)))))))))))))).))).)))).))..))))))))(((((((.((((......)))).)))))))........((((((..((((((....(((((((((..((((.................))))..))))))))).....)))))).))))))(((((((.............)))))))....)))))))))))).))))))..).))))..))))))))))...........((......))....))))))))))))))))))...).)))))...)))..))))))))))))...

Thermodynamic Ensemble Prediction

((((.(((,,(,({...,,,..})}}}})),)}}}(((((((((((((((.(((((.(...(((((((((((((((((({,{{,{{,,,{||||.{{|.,.,,,.((((((.((((((((((((.((((((.....((((((..........)))))).....)))))){((((......)))))((((((((.....,.........((((((((...((({..{((((((.(.(((((..{{{{{{{{,..,{{{...,..{{{{.(((({{{,({.{{{{{{,..((((((((((((((((....))))))))))....((((((.....)))))))))))).,.})))))})).,}..}}||.}|||.,,...}},,..,},)}),}},((((((((...)))))))).))))).).))))).)}(((((.((((.(((.(((((((((.(((.(((.(((((((((.(((((((((((.(((((((((((..{((((((((.((((.(((((((,,,.(((((((....((((((({,...,{((((((((((((.(((((.,......(((((((..(((((((((((((((..........)))))))),.,,..{,...............(((((......)))))...(((((...............{((((({....})))))).((((((((({....(((....(((((,,.{((((({((,,..,,(((({,,{({{{..,,|||||}|||,.....,((({...,,,,,||||((({,..{{((((.(((((....))))).}))|||,.{{{|{((({.||............}}..)))))}))))))))...,|,||||.{||||||...{||||{{{,,,|.},,,..,,.......)))))}}),,,,)}})))).)))),)....)))))...)))..)))).))))))..)))))}))))))..)))))))}))))))))))))))))))))))))))....))))))),.,,))))))).)))).)))))))))..)))).))))))).))))))))))).))))))))).))).))).))))))))).))).)))).))))),,,,{(({{{{||,.,,,)))}}}},))))...)))))))).((((....}))),{,,((.(((.((((((({............{(((((((...,...,,....))).))))}....,{.,,{{{{{,{((({....(((((.((((...............)))).)))))..})))),..})))).,,.,|((((((....((((....))))....)))))))))))))).))).)))}.},..))))))))(((((((.((((......)))).))))))).{{{{,...,||||}.((((((.,{.(((((((((..(({{.,...........,,..}}}),,))))))))).,,..)))))).}}}}}{((((((({{.{{....)).)))))))))...)))))))))))).))))))..},|||,{{|||||{|||...,}})}..})))}.,},,......,)))))))))))))))))...).)))))...))},.))))))))))))...