Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_ACAP2_0017100

Sequence Length

1358 nt

GC Content

0.4138

GUGGAGCUUGCAGUGAGCUGACAUCACGCCACUGCACUCCAGGGUGACAGAGCAAGACUCCGUCACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACGAAAAAGAAAAAAUAUGGAUUUAUUGGCCUGGCGUGGUGACUCACGCCUGUAAUCCCAGCCCUUUGGAAGGCUGAGGCGGGCGGAUCACUUGAGGUCAGGAGUUCAUGACCAUCCUGGGCAACAUGGCGAAACUCUGUCUCUACUAAAAGUACAAAAAUUAACUGGCGUGGUGGCAUGCCCCUGUAAUCCCAGCUGCUUGGGAGGCUGAGGCAGGAGAAUCACUUGAACCUGGGAGGCGGAGGUUGCAGUGAGCCGAGAUCACACCACUGCACUCCAGCCUGGGCGACAGAGCAAGACCCUGUCCCCCGCCCAAAAAAAAAAAAGGAUUUAUCUUCAUAUUUACUGAGUUGUUAUAUGUUUUGCAGAUAUUUUCUUCCAUGCUUUGGCUUGCCUUUUUCAUUUUUGUAGCAGUGUUUUUUAAAGAUCAAACUUUUUUUUUAUGAAGUCAGUUUAUUGAUUUUGUUCUUUUGUAGUUUUCUUUUGUGUUCUGUUAGGAAAUGUUUGCUUAACCCUAUUCAGUAAGAUUUUUUUCAAUGUUUUCUUGUGGAAGUUUAGGUCUAUGAUCUAUUUCAAGUUAAAUUUUAUAAAUGUUCUGUGGUAACGGUUGAAGUUCUUUUUCCUCUCUAUUAUUAUUAAAUUCUUUGCAUGUGGCUCUCCAGCUUGCUCUGUACAUUUUCCCAUCUUUAUUGGCACCUUUUGUAAAAAAAAUAAAUGAAUAAAAGCUGACCAUAUGCGUGGGUAAUUUCUGCUUUAUUGAUCUUUUUGCUUGUCUUUUUUCUUUUUUUUUUUUUCCUGAGACAGUCUUGCUUUGUUUUCUGGGCUAGAGUGCAGUGAAAUGAAAAUGACUCACUGCAGCCUCCACCUCCUGGGCUCAAGUAAUCCUCCUGCCUUAGCCUCCUGAGUAGCUGGGACCACAGGCACAUGCUACACCCCUGGCUAAUUUUUUGAAUUUUUGUCGAGAUUGGGGGGUCUCACUUUGUUGCCAAGGCUGGUCUCCAACUCCUGGGCUCAAGUGAUCCUCUCAAACUGUUGGGAUUACAGACGUGAGCCACUGUACCCAGACUUUACCUGUCUUUAUACAGUACCAUACUUCAUUGAUUACUGUAGCUUUCAUAGUAAGUCUUGAAAUCAGGUAGUAUGAGUAUUCUAACUCUUUUCCUCUUUUUCAAAGUUAUUUUGGCUAUUCUAGGUCCUUUAUGUUUUCAUAUAACUUUUAGAAUCAACUUUUCAGUUUCUACUGAGAUUUGGA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-484.30 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -508.21

Frequency: 0.0000

Diversity: 230.25

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.(((((..(((((((.((((....)).))))))))))))))..(((((.(((.....))).)))))..........................................((((((((...((((......))))((.((((.((((((.((((((.(((((((((((((((((.(.....).)))).(((.((((((((((((.(((((((((...(((((.(((.(((((((.((.((.((((((((((.((.((((((.(((((((((.((((.(((.(((((((..(((((..((((((((((((((((((((((((((((((.((.((((((.(((((((((.(((((((((((((((.((...(((...((((((((((.((((((((.(((((((((((((..((((...((...(((((((((((((((.............(((((((((........(((..((((((((((((...((.((....)).))...............((((((........(((((..(((((........(((((((((......)))))))))........))))))))))......))))))))))))))))))..)))...)))))))))........((((((.......(((((((((((((((...))))))...........................(((((((.((..((((.....))))..))...))))))).....(((.(((((((((.....((((((......((((.....(((.......))).......))))..................)))))).))))))))).))).)))))))))..))))))..................)))))))))))))))...)).))))))))))))))))).)))))))).))))))))))...)))...)).))))))))))))))).))))))))).)))))).)).))))))))))))))))))))))))))))))..)))))..)))))))))).)).)).))).)))))).)))))))).)))))...))))).)).)).))))))).))).)))))...))))))))).)))))))))))).))).....))))))))))))).)))))).))))..)))))).))(((((((..(((((((((((.((........))..)))))))((((.......))))..))))..)))))))...((((......))))......))))))))..(((((...)))))((((((((.....((((....)))).....))))))))(((..(((((((....))))))).)))..

Thermodynamic Ensemble Prediction

.(((((..(((((((.((((....)).)))))))))))))},,(((((.(((.....))).))))).,........................................((((((((.,,,{{{.{{{{.||.,((,((((.((((((.((((((.(((((((((((((,{(({({...,|{,,,,.{||,((((((((((((.(((((((((...(((((.(((.(((((((.((.((.((((((((((.((.((((((.(((((((((.((((.({{((((((((..(((((..((((((((((((((((((((((((((((((.((.((((((.(((((((((.(((((((((((((((.({...(((...((((((((((.((((((((.(((((((((((({.,((((...,{...(((((((((((((((.............(((((((((.,......(((..((((((((((((,..((.((...,)}.,}...............,(((((........(((((..(((((........(((((((((,....,)))))))))........))))))))))......))))))))))))))))))..)))...)))))))))|{......,|,,.,....,,,|,|||||,,((((((...))))))...|{{{{.||{..,,,,|{,.,,...(((({{{.((..((((.....))))..},.,.}}}}}}}..,,,.,,.{((((((((.....{(((((.....{(.(({{{..{{{....,..}}}.....,,|}},........}}}}).},,.)))))),))))))))|,|||.,,..},}}).,}},.}}....,..}}}}}......,))))))))))))))....).))))))))))))))))).)))))))).))))))))))...)))...)).))))))))))))))).))))))))).)))))).)).))))))))))))))))))))))))))))))..)))))..)))))))))),)),)).)))))))))).)))))))).)))))...))))).)).)).))))))).))).)))))...))))))))).)))))))))))).))),,,..))))))))))))).)))))).)))}..)))))|,||,,,,,{||,|.,,{{{((((,({...,.,..}|.,||||||},.,...},})}))}}}.}}}},.,})}}}}...((((......))))...,,,))))))))..{({{,...,))))|{((((({.....((((....)))).....})))))}}{{{..(((((((....))))))).)))},