Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_ACAP2_0020300
Sequence Length
1221 nt
GC Content
0.3620
GAGAAUCGCUUGAGCUGGGGAAGUGGAGGUUGCUGUGAGCUGAGAUCGUGCCAUUGCACUCCAGCCUGGGCAACAAGAGUGAAACUCCAUCUCAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAGAGAAGCUUUUUCUGUAUUUUCUACCAAAAAGAUUGCAUCUUUCUUUUUUGUUGCUUAAUGGAUUUCAUAUAUAACCUGACCAUUGUAUAAAUUUGGGUCUGGCCACGUUCAAAUGUAAAUACAAUUUAAAAUAUUAAUUCCAUUUUUAAGCUAAUACCAGAAAUACUUAUAGAUACUCAGUAAUCUGUAUGGUCAUAUUUUAUGGAAGGGUAAAUGUACAUUGAUUCCCUCCAUCUAUAUUAUUGAUGAUUUUUUUGGUGUCUGUCCAAGAAACACUGUUUGCUAUAUAGUAGGCAGAAGCAGUAGAAUGAGUAAGACAGCUUCCGAUCCAUUUGUUUAGAUACUUCUGAAACCACUGCUCAUUUACAUGUUUCUCUUUAAAUUUCUGGAGAUAAAUCAGAUGUAUAUAUUUGAAAUACCUUUUCUGAAAAUAAUUUUCUAGUUUAAUAAUUAUAAUUAUAAAUGGCAUUGCUGUGUAACGUAGUGCUCCUGAGACCUUAACUUUGCUUAGGAACCCCUGGGGGAUCUUCCCUGGGGAUCCCAUCUUGUGAAAAAACAGAUUCUGAUUCAGUAGCUGGAGACACCUGAGAUUUUGUGUUUGUAACCGGAUUCCAGGUGACGCCCGUGCUGUUGGCCCAUGGACCACGCUUUUGAGUAGCAAGGAUAUAAAAUAUAUUAAGCUGAAGGUUUUCAAAUGUUUUGAAACCAUGAAACACACAUCUUUAUAUAAUAUAAAUAGUCUAGAAACUAUAUUUAGUUCUAUAUGUAAACAAAUUACAUCAAAAUUUUAGAAGAUGUUUAGAGAUAAGUUAUUUUUGUAUAGUACUGUAUAAUUUUUAAAGCCCUGUAAUAUAUAGUAGUAUCCUUUUAAUUUUUACAAUAAUCCUGUAGGGUUAGAUAGGACAAGUGUUAUUACUCCCGUUUUAUAGCUGAGGAUACCAAAGCCCAAGGAAGUGAUGAGGACUUGCUUCAAAUCACAAAGUAGAAGAGGCACAACCAGGGCUAGAACCCCUUUUCUUUUUUUUUUGAGACAGAGUCUUGCUCAGGCACCCAGGCUGGAGUGCAGUGGCGCGAUCUCGGCUCACUUGCAACCUCCGCCUCCCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-362.70 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -390.98
Frequency: 0.0000
Diversity: 304.77
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..............((((((..(((((((((((.((((((((((((((((((((((((((((((((((((...(..((((((.((((..((((((((((((((..((((((((((((..((((((((..(((.....))).)))))).))...))))))))))))...((((((((((.((.((((....((.((((...((....))...)))).))..((((....))))..............)))).)).)))))...)))))......(((((((((((((......((((.(((((((....((((((((((.(((((((((.(((((((((((((.....((((.........))))..((((((((.......))))))))...((((((((....))))))))(((((((((((.((((((..........(((.....)))((((((....)))))).....))))))))))).))))))((((((......))))))..))))).))))))))........))))))))))))))((((((...(((((....))))).)))))).....(((((((........)))))))(((((((............)))))))..(((((((((....))))))))).........)))))....)))))))))))..(((((.(.((.(.((((((.((.((((.(((...))))))).)))))))).).)).)))))).(((((...)).))).(((.......)))...((((((...))))))...(((((.((((((.((.(((((((..................((((((...)))))).....(((((.(((....))))))))..(((((.....)))))))))))).)).)))))).)))))..))))).))))))))..((.(((((((((..................))))))))).))(((((((((((((.(((.......)))))))))))).))))......((((((((.((........(((..((...))..)))....)).))))))))((...((((((...((........)).))))))...))((((.......))))....))))))))))))))..)))).))))))..)..))))))))))))))))))))))))))))))))))))..))))))))))).))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
,.,......}}...((((((,.(((((((((((.((((((((((((((((((((((((((((((((((((...(..((((((.((((..((((((((((((((..((((((((((((,.,,((((((..(((.....))).)))))).,,.,.)))))))))))},,,(({(((((({.,{.{{{{....,,.|||||}|||,...|,..{||||{||,,.,,{{{{{||{{..,{|||.,||,..|}}}.},.}}}},,.})))}}..,,,{(((((({,{,((({{{{..,,,{.{||||||},,{((((({,,({,((((((({{,(({{{{{{{{{{{,,|||{{||.,,,..,..}}}},.{(((((((.......)))))))}..,{(((((((....)))))))}(((((((({(((((((((.{........,,,.....}}}{(((((....)))))}.....))))))))))).))))))},.....,,,,,)))}}...,}}}}}}))))))),}},,,..,}|||||||{{|||{{{{{{,,,{{(((,.,,|||,,..}}})}....,(((((((........)))))))|((((((...........,))))))}..(((((((({....})))))))).....,{,,|||}}....))))))}}}}},{((((((({((.{.((((((.((.((((.(({...})))))).)))))))).}.,)|}|)))}.{{{{{..,)).))}.{{{.,,,,,,|||...{(((({...}}))))..}}}||,{(((((((({...|}}))}}))..,......{{{{{(((,{,...,,,,,,.....((({{{(((....)))))))).{(((((.....))))))....,,.,,.)))))))),}}},,}}}}},)))))))}.|((.(((((((((.,..............,,))))))))).))|((((((((((((((((.......)))))))))))).)))}{((((.((((((((.((........(((..((...))..)))....)).)))))))).,})))|{{{{...,,.......,))})))),.....,,||}}}}},.}))...,,.))))))))))))))..)))).))))))..}..))))))))))))))))))))))))))))))))))))..))))))))))).))))))
Back