Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_ACAP2_0021300
Sequence Length
1643 nt
GC Content
0.3877
GUUGCAGUGAGCCAUUGCAGCACUGCACUUCCAGCCUGGCAACAGAGCAAGACUCCAUCUCAAAAAAAAAAAAAAAGACUUUUUUAGAGCUGCUUUAGUUUCACAGCAAAAUUGAGCAGAAAGUACAGAGAAUUAUUAUAUUCUCUGCUCUGACACAUAGAACCUUCCCCACUAUCAACAUCCUGUACCAGAAUGAUACAUUUGUUACAAGCAUUGAGCCUACAUUGAUACAUUAUUAUCACCCAAAGUCCAUGGUUUCCAUUAACGUUCAUUCUUGAUGUUUAGAUAAAUGUAUAAUGACAUGUAGCUACCAUUAUAGGAUCAUGCAGUUAGUUUCGCUGCCUUAAAAUUCUCUGGGCUUUACUGAUUCAUCCCUCCCUUUACCCCAACUCCCAGCAGCUACUGAUAUUUUUACUGUCUCCAUAGUUUUUGUCUUUUUUUAGAAUGUCAUGUUGUUGAAAUACAGUGUAUAGCUUUUAAAGAUUGGCGUCUUUUACUUAGUACAGGUUAAGUAUCCUUUAUCUGAAAUGCUUGGGAGCACAGGUGUUUUGGGUUUCAGAUUUUUUUGAUUCUGGAAUAUUUGGAUUAUACUGGUUAAGCAUCUCUAAUCCAUGAAUUCAAAAUCUGAAAUACUCUAGUGAUCAUUUUCUUUGAGUGUCAUGUGGUUGCUCAAAAAGUCUCAGAUUUUGUAGCAUUUUGUGUUUUCUAUUUUUGAUUUAGGGAUGCUCAACCUGUAAUGUAAGGUUUUUCCAUUUCUUUUUAGUGCUGAAUGAUACUCUGUUGUCUGGAUGUACACACCUUAUCCAUUCACCUAGUGAAAGACAUCUUGGUUGCUUCCAAAGCUGGUGUAACAUCCCUGUACAGGUUUUUGUGUGGAUAUGUUUUCAGCUUAUUUGGGUGAAUACCAAGGAGAGUGAUUGCUGGAUAGUGUGGCAAGAAUGUAUUUCGUAGGCUGGGUAUGGCAGCUCAUACCUAUAAUCCCAGCACUUUGGGAGGCUGAGGCAGGAGGAUCACAUUAACUCAGGAGUUCGAGACCAUCCUGCACAACAUAGUAAGAUCCCAUCUCUUUAGAAAAUAAAAAGUAUGUAUUUCUUUUUUAAAGAAACUGCUUAACUGUCUUCCAAAAUGGCUGUGCAAUUUUUCUUUCCCAUCAGCAAAGAAUGAGAGUUCCUUUUGCUGAACAUCCUCACCAGUAUUUGGUGUUGUCCAUGUUCUAGAUUUUGAUCAUUCUAAUAGGUGUGUAGUGGUUUCUCCUUGUUUAAUCUGCAAUUCUCUAACGACAUAUUAUGUGGAGUAUCUUUUCACCUAUUUAUUUGCCAUCUGUGUUUCUCCUCCUCUUUUCUUUCUUUUUUUCUUUUUCUUUCUUUUUUUUUCUUUUUUUAAAGAGACAGGGUCUCAUUCUGUUGCCCAGGCUGCAGCGUAGUGAUACAGUCAUAGCUCAUUGCAGCCUCAAACUCCUGGGCUCAAGUUAUCUUCUUGCCUCAGCUUCCAGAGUAGCUGGGACUACAGGCGUGCACCAUCACGCCUGGCUUGUCUGUGUAUUUUCUUUACUAAGGUGUCUGCUCAGGUCUUUUGCCCAGUGGGUUUCUUUGUUUGUUUUUGUUUUGAGAGACAGAGAGCCUCACUCUGUUGCCCAGGCUGGA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-485.00 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -517.45
Frequency: 0.0000
Diversity: 329.77
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(.(((((((.((....))..))))))).)(((((((((((((((((((((((..((.(((.((((((............)))))))))((((...........)))).....(((((((..((..((((((((......))))))))..))..........................(((((..(((..((((.(((((((.....((((((....(((((((...((((((((.((.((((.(...((((((((...))))...((.((((((((((((..(((....((((......))))....))).))))...(((..(((.(((((((......((((...........))))...))))))))))...)))...............(((((((...(((((((((.........((.......)).........))))))))).)))))))....((((.(((((((((..(((((.(((....((((((....((((((((.(((((((((.(((.((((((...(((((((((((((((((((((((((((.((....)).))))((((...(((((((...((......))....)))))))...)))).))))))))))))))(..((((.(((((.....)))))))))..)..((((...((((((...))))))..))))...))))))))))))))).)))..))))))))).))))))))..)))))).....)))..)))))..)).))).....)))).))))((((((((((.........))))).(((((...)))))))))).((((((....(((((((((((...(((((..((((((((....))))))))..))))).))))))...))))).....)))))))))))))).))..)))).).)))).)).))))))))..)))))))(((((((......)))))))....((((((((((((((.((((((((((((((((((.((.....((((((((((.(((......(((..(((((.(((.((((((..(((((((((((((..(((((................(((((((.(((...((.(((.........))).)))))...)))))))....((((((((((((....))))..))))))))(((((..(((((.....)))))..)...))))..((((..........))))(((((((.(((((.(((.....((((.......))))......))).)).......((((((.....)))))).........))))))))))............................................)))))..)))))))))))))..)))))).))).)))))..)))(((((((.((.(((((...))))).))...)))))))))).)))))))))).....)).))))))))))))))))))))))))).)))))))...((((((((......))))))))))))))..))))))))))).)))...))))))))))))))..))))))...(((((.((((((((((.((........)).)))))))))).)))))))))))).))))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(.(((((((.((....))..))))))).)(((((((((((((((((({{(((,,{{.,{(,,{{{{{{,,.........)))))).}}|{((.....,.....}}}},....(((((((,.{(..((((((((......))))))))..))......,{{...........,,....,((,({{({{..((((.(((((((.....((((((....(((((((...((((((((.,{.((((.{...((((({((...}}},.,,{{.((((((({{{{{..{((.,..((((......))))....))}.))))}.||||..{{(,((((({(......((((...........))))...}})))}}}}}...},,...............(((((((...(((((((({.{{{{{....|}}},...,|.........})))))))).)))))))....((((.(((((((,{..(((((.(((....((((((....((((((((.(((((((((.(((.((((((...(((((((((((((({,,,,((((((((.({....}}.}))}||}|...(((((((...{{.....,}}....))))))).,.,,,||||||||||}}}||{{.,((((,((({{.....}}}})}}}},,)),||||,,.,,|||,,}}))))))).)))),,}))))))))))))))).)))..))))))))).))))))))..)))))).....)))..)))))..}}.))),....}))).)))){({{((((((.........))))),{((((...)))))))))).((((((....(((((((((((...(((((..({,(((({....})))),))..))))).)))))),..})))).,...)))))))))))))),))}})))).},)))).}}.))))))))..)))))))((((((({....,)))))))....(((((((((((((((((((((((((((((((((.((.....((((((((((.(((......(((..(((((.(((.((((((..(((((((((((((..(((((,,.({{{((((({...})))))).}))...,,.{{,........,}||.|,|}|..............,{((((((((({.,..}}}}..})))))||((((,..(((((,...,)))))..)...))))}},{{{....{,.|,.,,.{(((((((...{{.(({..((((,{({.......}}},.........,|||,...},}})))).}}),.,.)))))))}....}),,)}},,.,...........................................,})))..)))))))))))))..)))))).))).)))))..)))(((((((.((.(((((...))))).))...)))))))))).)))))))))).....)).))))))))))))))))))))))))).)))))))...((((((((......))))))))))))))..))))))))))).}}}..,))))))))))))))..))))))..,(((((.{(((((((((.((........)).)))))))))),)}))))))))))))}))))))))
Back