Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_ACTN4_0001100
Sequence Length
2274 nt
GC Content
0.4472
GCGUGAGCCACUGUGCCCUGCCUUGUUUUUCUUGAAGUAGAUCUUUUUUUCUUUUUAAAGGCUGAUAAUGGAGGCCCCAAAGUAGCCAUCUGUUACUUUGUUCCAUUACUCUAAUUGCUUGCCUCUUAGGAUCUGGCUAGGACUAACAGUUUUCAAAAUUGAGUAACACACUUGACAAAAAAAAAGGAACCAAACUCAAACUCAACUGUUAUCUAGAAAAAAGACUGUGUAAAUAUGUGUGAGAGGCAAGUAUACUCUGUUUGCCCUCUUGUAAGAGGGAUAGGGGAGGCCACUCAGCUGCUAGCACUCUGUUCUCUCCCCUCAUCCUCUCCAGAAUGUAUUUUAGAACUUGACUCUUCUAAUGACUGAAGAAAAGGUGGGGUAUGGGAAGAUGGCCUGGGACUGCAGGGUCACUUACACUCACCUGGCUAAGAGUUGAGAUCUGGCUGGUGCCCUGGAGUGGCACCUGCCACUCACCUAAUCCUAAACAAUCCAGGGUGUGGGCCCAGGAUUGCCCUCUGCCUUUUGAAACACCCUCCCUGGUUCCGGCUUCUAAGACCAACAGGGAGGCUACUUUGGUGGCAGGGAGCUGACUCACCCUCCAGUUGGAACUGGUGCUAAAAGCCUCCAUUUAACGGCAGCCGACUGCUUGGCCCCAAGUGGGCUGCCUUGUGGGGGGGAAAGUUCAGUGGAAAGUGUUGGAGGAAGCAGGGUGGUGUGUGAAUAUCCAAGUAGUGCUGGUGCUAUUAAGCUCUGACACAGUCAGGGAGGUCAGUUAAAAUGUGGUCUUAUGGCCGGGCGCAGUGGCUCGCGCCUGUAAUCCCAGCACUUUGGGAGGCUGAGGUGGGCAGAUCACCUGAGGUCAGGAGUUCGAGACCAGCCUGGCCAACAUGGUGAAACCCCGUCUCUACCAAUAAUACAAAAAUUAACUGGGCAUGGUGGCAGGUGCCUGUAAUCCCAGCUACUUGGGAGGCUGAGGCAGGAGAAUCGCUUGAACCUGAGAGGUGGAGGUUGCAGUGAGCCAAGAUCGCGCUACUGCACUCCAGCCUGAGUGACAGAACAAGACUCCAUCUCAAAAAAAAAAAAAAAAAUCAGAUGACAGAGGGGAGCGGGGACAAGUUUUAAGUCUAAGCCUCCUGGGUGGGGAGUUCUGCUGUUUCAACAUAUGCUCCAGUCAUGGCAGACUUUGGCCAGACAGCGCCCUUUUUCAGAGUGAACUGAGUGUAGCACAAGUUAUCUGCCAGUGCUAGUUAGCAAACAGAAUGGAGCCAAAAAAGAAUUGAUUUGGGAAGGCCCAAGGAAUUUGAAACCGUUGAGAUGAACACUUUCCGUUUUUGCUACACUGAUUUAUGUUGUGCUGGGAAUUGUACAAGCCUUUGACCAGACCUUAGGGUUGUUCUUUAAAAAAAAAAAAAAAAGAUUCCCUUGCUGCUGCUUUUACUUUUUUGAAGGGCAGAAGGGAAGGGCAAAUAUAAUUAGUGAACAGCUGUUUGCUCUAGUAUCACUUGCUCGUUCAGGUUUUCUGAAUAGCUGAAAUAUCAACAUGUUUAUCUCUUCCCUUGCCUUAGUAUAUCCUAGAGCAGUGUUUUCCCCGGCUUUAUCUUUAUUCCUUCAUUUAAUGAACUCCGUGUUUUCAUCACUCACAUUUUGUUCCCUUCCCUCAGUUUCCUUCCUUUGCCUUCAUUUAUGUAUUUAGUUUACAGAAUAACAAAAGCACUCGUGUUACUUUUAAACAAGGUAAAACUUAAACAGUUUUUUCCUCCGUUUCUUUUUUUAUGGAAAUAAGAGGCAAGUGAUAGCAAGUGGGUAAUUCAAUGGCAGUGGUAACUGAAGCACUGACCUGUUACAAGAGAGACGGAAGCUUCUACUUGAGCAGAUACAAAUACUGUCAUCCGUGGAGAUUUGAAAGAAGUCUUUCUAUCACUGGGUAGUUUGAGAGCUCAUUAGUCUUCUUUAGAAUGGGUUUAAACUUGGAAACAUCAAAGCAAGUUACAAGGAAACUUAGUUUUACAGUGUUGGCAGCCUAGGCGCCAGAAUUUGUUAUAAAGUGUCUGAAAGUGGCCCAGGUAUCACUUAACUUUUCUUCAAGAAGGUCUAUGAGUUACAUUUUACUCGGUAUCCCAGGCAUCAAGGAGUGUAACUUUCAAUGAAUCAAAGAGAAACAGAAUCAUUUUAAAUUCCAGCCUCUGUUUAAAGAAGGAUCUUAUGAAGGGGAGAAAUUAACCACCUGACCCAGGGAAGGAUCCCGCCUCCUCCAGAAAGUGAAAUCGCCGG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-717.90 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -757.83
Frequency: 0.0000
Diversity: 476.23
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((((((((((((((.(((..((((((...((((.(((......)))))))..)))))).((((((((((....(((((((((.....))))))))))))))))).))....(((((((((((((((.(((..(((((..((((((((.......((((((......(((..........))).......))))))....))))))))))))).....))))).............)))))))))))))..((((((...((((((....))))))))))))((((((((......(((.((.((((.(((((...(((((((.(((.(((........((((((........))))))...))).)))...)))))))...)))))((((((((((.(((((..((....((((((((((((.(((..((((((((...((((.(((((((....).)))))).))))))).............((((((.((((....)))).))))))..(((((((..(((((....((((((((.....((((....)).))..))))))))....))))).)))))))....)))))..(((((((((...(((((.(((.....(((((((.....(((((((.(((...........))).)))))))..)))))))....))))))))...))...))))))).))).)))))).))))))....))..))))).)))).)))))).....(((((...))))))))))).)))......))))))))..))).))))))))))))))))))(((.........((((((.(((((...(((((((....(..((((.(((((((............(((((((((((((.(((((((.((((((((....................(((((.((...(((....)))....)))))))((((((((((((((((((.(((.((((..(((......)))((((((((..((((((.((((......).)))))))))))))).)))((((((.((((((.(....(((((....................)))))....(((((.((..((((.........))))..)))))))((.(((((((....(((((((....(((((((...(((.((((........)))))))...(((((((...((((((((...((((((((((((..((.....(((((.....((((((...((((((((........(((((..((((((....)))))).)))))......(((......)))...)))))))))))))))))))...))..)))))))(((((((..((((.(((..(.......)..))).)))).....................)))))))..)).)))...))))))))...)))))))..((((((((((.((((((....((((((((((.....)))...)).))))).(((.((((((.....)))))))))(((....)))..))))))..)))))))))).....)))))))....)))))))...))))))).)).............(((((...)))))...).))))))..)))))).......)))))))..))))))))))).((.((((((((..............(((((.(((.(((((..........))))).)))))))).(((.((((((.....))))))..)))..((((((........))))))..)))))))).))...)))))))(((((.....(((((((.(......).))))).)).)))))...))))))))..((((......)))).((((.......))))((((((((((((((.....))))))).....))).)))).......((((((((...(((.....))))))))))).((((((............))))))..(((....))).))))))).))))))))....)))))..((((((((......)))).)))).((((((........))))))..((((((((((..(((((((..((((((((((((.....((.......)).....))))))))))))................(((((((...................)))))))......))))))).))))))))))..........)))))))))))..)....))))))))))))..)))))).......)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((((((((((((((((.(((..{{{{,{,,,((((.(((......,.)))})},}))))}.({((((((((....(((((((((.....))))))))))))))))).}}....(((((((((((((,{.(((..(((((..((((((((.......((((((......(((..........))).......))))))....))))))))))))).....))}}|...........,.)))))))))))))..((((((...((((((....))))))))))))((((((((..,{{{(((.((.{{{{.{((((...(((((((.(((.(((........{(((((........))))))...))).)))...)))))))...))))}((((((((((.(((((..((,.,.((((((((((((.(((..{((,((((...((((.(((((({....}.)))))).)))))))}.},.........((((((.((((....)))).)))))},,(((((((..{{{({....((((((((.,,..((({....}).))..))))))))....})}}}.))))))).||.|}}}}..((((((({{...(((({.(((.....(((((({..,{.(((((((.(((,........,,))).))))))),,)))))))....))))))))...,}...))))))).))).)))))).))))))....))..))))).)))).))))))...{{(((((...)))))))}))}}))),.....))))))))..))).))))))))))))))))))(((.........((((((.(((((..,(((((((....(,.((((.(((((((.{{,........(((((((((((((.(((((((.((((((((.....,{{,........,,.(((((.,{...(((....)))....,,))))),{{,{,((((((((((((.(((.((({..{,{,....,}}}((((((((..((((((,{(((......).)))))))))))))}.)))((((((.{(((({.,.,,,(((((....................)))))...,(((((,((..((((.........))))..))))))){(.(((((((..,.(((((((....(((((((...(((.((((........)))))))...(((((((...((((((({..,((((((((((((,.,{,,,.,(((((,,,,,((((({...((((((({........{{(({..((((((....)))))).}}}}}......(({......}})...})))))))))))))}))))....,..}}))))}{{{{{{{..((((.(((..(.......)..))).)))).,..................,)))}})).,}}}))}}},))))))))...)))))))..((((((((((.((((((....((((((((((.....)))...)).))))).(((.((((((,...,))))))))){{{....}}}..))))))..)))))))))).....)))))))....))))))),..))))))).)).............{((({...))))}.....}))))}..)))))).......))))))),.)))))))))))},({{((((,,({{{{{.,{{,....{{{||.|{{.{{{{{...,......}))}},}}}}}}}}.|||.{(((((.....))))))..|||,.((((((..,,,...}))))}.,))))})))}))..})))),)){{,,,.....(((((((.(......).))))).))}))))}...))))))))..({{({,.,.,|}}|,({{,......})))}|{{{||{{{((({{,,,,,}}}})))}|,|||,}.})))||,.,,.{(((((((,..{{{.....}}))))))))).{(((((............)))))}..{{{....))).))))))).)))))))).,,,|}|)},,((((((((......)))).)))).{{{{{||..,,}}.,}}))}..((((((((((..(((((((..(((((((((((,.{{.{({......}},,,,..}))))))))))}....{{{.{,......,,,,,||.|,,,.....,,,,....,}}}}}}}...,,.))))))).))))))))))......,,..))))))))))),.,....))))))))))))..)))))).......)))
Back