Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_ACTN4_0001400
Sequence Length
1515 nt
GC Content
0.4488
GCUGAGGCAGGAGAAUCCCUUGAACCAGGGCGUCGGAGGUUGCAGUGAGCUGAGAUGUCGCCAUUGCACUCCAGCCUGGUGACAGAGCAAUACUCCAACUUAAAAAAAAAAAAAAAAACCUGCAGGCCAUACAAAAUAGGGCCUAUUGGGUGUGAAGAGCUACCCAUUUGUGACCCCUAACCUUGCAUGGUCUUGACCCUGUCUCUGCCUCUCCUCUAGUCUCCCCUUUCCUCUUGUCUGAAUUGCUGCUGCUUAAUCCUCUCACUAGGAGCGAGAAAAUUGUACUUUGCCCCUUAGUGACAGCUCUGAUAAAAGGUGGUUGAAGUGGAUGGUAGUAAAAAGGGUUUGCUUUAGCUGUGGUUUUCCAGCCUCCGGACUCCUCCCCCUUUCCCAUCACCAUAGAUAAUUAAGAGUUGACUCCUCAAAAUUCCUCCCACCAUAUUGCAUAUUUUUAGGCUUCAGGUUUUUGUGAACCAAAAUAGUGGAAAGUUUUUUUGUUUGUUUGUUUUGGGUAGCCCAAAGCAACACUUUUCUACAGAGGCAGCCAUUCUGCACGCACAAUAACCUGGUGAACAAUGCCAGCUUUCUAUUAAUAAAUGAACUGCCAGUUCAGAAUUUGUACCCAUGUGGCAGAUGGACAGAAAUAGUUUCUUUAGGAUUGAUCUCUUAAAUUUGACUUUGGGAAGAUACUGGCAGUCCAGGUUUUGUGACAGAGAUCCAUCCUGAGAUCUUUGUAAAUGGAAAAGCCUGAAUGCAGCGUUUCUUAUUGAUAGGAGAGUUGAUGGAUUUCAGGAAAAUGGGAUAUAGUAGAUGUGCAAUGAAUUUGUUGACUUGGAAACAAAUUUGGACACUUAUCCCUGAAAACUUCAGGCCAUUUUUUCCUAAACUCUAAUUGAGUCCCUGUGAUUGGAGUACUAGCCCCACAGUCCUUAUCAAACUUCGCAUUUGGAGCAGGCAGUCUGUCUGGGAAAAGCCAGGAAGCUCGCCAUGAAGGCAUCGCCCUCUGCUUUUAACUUUUUUAGGCUCUGUUACCUCUGCACUGGCUUGAGUAUUUCCUGGCUCAAUUGUUUCUCAGGCUGGCCUUGAGUCCUUAGAUGUUAUUUGUGUGCCUAGAAAUAGCUGGAAGAAAAAUGGUUGUAAUGCUUUGCAUUGCUCACUGCUCUCCAUGGAUGGAAAUUCUGUGAGGGAAAGAGGGCUUUCCACCCAGAAAAAGAGCUGGGCAGCGUAGACUUCAUUGUCCUGCUGGCCUGUCAUGUUAUUCUGCUAUACUACAGCGAUUAGGAUGAGAGAGUUUCUCGCUCUCCCUGGGUGUGCCACCUAAGGUACAUUAGGGUAGGGACGAACAUGGCGGGAGUUCUCAUAGUGGGCUUUCCUGCCAGACGUAUGGCCCACACAGCAGUAUUUCUUACAUGUGGUUCUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUGAGACGGAGUCUUUCUCUGUCGCCUAGGCUGGAGUACAGUGGCGUGAUAUCGGCUUACUGCAACCUCCACCUCCCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-518.70 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -546.58
Frequency: 0.0000
Diversity: 303.26
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(.(.(((..(((...)))))).).)(.(((.(..(((((((((((((((((((.....((((((((.((((((((((((((((((((.((.(((((..((((((((((((((((((((......((((((((....(((((..((((((((((.....)).)))))...)))..)))))(((......)))...((((((....(((((..(((.((..((.(((((((.....((((.((...((((.............((((((((.(((((..........))))).)).)))))))))))).))))))))).))..)))).))).))))).....)))))).......((((........))))....(((.....(((.(((((((.((((............((((((..((((......................((.(((((((((((.(((((((.(((((..........((((((((...........((((((((((((...)))))))))).))))))))))....((((.....))))...))))).)))))))....((.(((((......(((.(((...((((((...))))))..))).)))......)))))..)).(((.((((((..(((..((((((..............((((.((((.((.((((..(((((((((.......(((((((((((...)).)))))))))....(((((((((((((..((((.(((((((....))))))))))).....(((((.......((((((....((.(((.(((...(((((((........)))))))))).))))))))))))))))..)))))))....))))))...((((.....)))).)))).))))).))))))...)))).)))).........((((......))))((((..(((.(((((((((((((((((((((((((((((((((((........))))))))........(((........)))......))))..))))..)))))))))......)))))))))).))))))))))))).)))..)))))).))))))))))))))))((((.((..(.(((..(((((((...)))))))))).)..)))))).))).)..))))))))))))))))).)))...))).(((((........)))))(((((..(((......))).)))))((((.((((.(((.((.(((.......))))).))).)))).)).))...(((((((((((((.((((((......)))))))))))).)))).)))...(((((((((..((((...))))..)))))))))...))))))))..((((...(((.....))).)))).......))))))))))))))))))))..))))).)).)))))))))).)))))))))).)))))))).....)))))))))))))))))))..).))).)
Thermodynamic Ensemble Prediction
(.(.(((..(({...}))))).}.)(.(((.(,.(((((((((((((((((((.,{..((((((((.((((((((((((((((((((.((.(((((..((((((((((((((((((((...,..((((((((....(((((.,,{,(((((({.....}},)))))...),)..)))))(((......)))...((((((....(((((..(((.((..((.{((({{,,,,.{((((.((...((((.............((((((((.(((((..........))))).))}}))))))))))).)))))}))).))..)))).))).))))).....)))))).,.....((((.(,....}})))....(((.....(((.(((((((.((((...{{{.......(((,,.....,}}....{{{{..({{,,.....((.(((((((((((.,{{(((((,,..}}}}}......((((((((,.........,({((((((((((...))))))))))))}})))))))...,((((.....)))).,.(((({.{((((((...,,..(((((((((((((........((((((...}))))}...{{{{{..((((.,...,.))))|||}|,,.{({{,,{((((((......})))))}...}}}}.)))))))...))))))}|))))))}}))))((((((((((,...,}.)))))))))....|{|||||||||||..|{{{.{{{{{{,.,.,||||}||}|||.,{{,,{{,((({{{{{((({{{..{,{{.(((.({..,{(((((((........)))))))))).))))))))}((((({...}))))))}}},}}})))}..((((|,,,,}}}}..|||||}}}||}||.,,.,,})))}))}},,.,,||,.,...(({({{(((.(((({.{{{.(((((((((((((((((((((((((((((((((((........)))))))}........||{,...,...,,,..}}..))))..))))..)))))))))......)))))))))).}))))))..)))..}))))).,,,},}}.))))))))))))){(({{((....{((,.(((((((...))))))),}),}..))))))}))..)))}..}))))))))))))).)))...))).(((((........)))))(((((..(((......))).))))){{((.((((.(((.((.(((.......))))).))).)))).)).}}...((((((((((({{{((((((......)))))))))))).)))).)))...(((((((((..(((,...})))..}))))))))...))))))))..{{{{,,,(((.....))).))))},.....})))))))))))))))))))..))))).)).)))))))))).)))))))))).))))))))..},.))))))))))))))))))),,}.))).)
Back