Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_ACTN4_0003100
Sequence Length
489 nt
GC Content
0.5419
ACCUUCACGGCAUGGUGCAACUCCCACCUGCGGAAGGCAGGCACACAGAUCGAGAACAUUGAUGAGGACUUCCGAGACGGGCUCAAGCUCAUGCUGCUCCUGGAGGUCAUAUCAGGGGAGCGGUUACCUAAGCCGGAGCGGGGGAAGAUGAGAGUGCACAAAAUCAACAAUGUGAACAAAGCGCUGGACUUUAUUGCCAGCAAAGGCGUCAAGCUGGUCUCCAUCGGGGCAGAAGAGAUUGUGGACGGCAACGCAAAGAUGACCCUGGGAAUGAUCUGGACCAUCAUCCUUAGGUUCGCCAUCCAGGACAUCUCCGUGGAAGAGACCUCGGCCAAGGAAGGGCUCCUUCUCUGGUGCCAGAGAAAGACAGCCCCGUAUAAGAACGUCAAUGUGCAGAACUUCCACAUCAGCUGGAAGGAUGGUCUUGCCUUCAAUGCCCUGAUCCACCGGCACAGACCAGAGCUGAUUGAGUAUGACAAGCUGAGGAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-152.30 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -162.73
Frequency: 0.0000
Diversity: 130.75
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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