Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_ACTN4_0004300
Sequence Length
1526 nt
GC Content
0.5950
AGACCUCGGCCAAGGAAGGGCUCCUUCUCUGGUGCCAGAGAAAGACAGCCCCGUAUAAGAACGUCAAUGUGCAGAACUUCCACAUCAGCUGGAAGGAUGGUCUUGCCUUCAAUGCCCUGAUCCACCGGCACAGACCAGAGCUGAUUGAGUAUGACAAGCUGAGGAAGGACGACCCUGUCACCAACCUGAACAAUGCCUUCGAAGUGGCUGAGAAAUACCUCGACAUCCCCAAGAUGCUGGAUGCAGAGGACAUCGUGAACACGGCCCGGCCCGACGAGAAGGCCAUAAUGACCUAUGUGUCCAGCUUCUACCAUGCCUUUUCAGGAGCGCAGAAGGCUGAAACUGCCGCCAACCGGAUCUGUAAGGUGCUGGCUGUCAACCAAGAGAACGAGCACCUGAUGGAGGACUACGAGAAGCUGGCCAGCGACCUCCUGGAGUGGAUCCGGCGCACCAUCCCCUGGCUGGAGGACCGUGUGCCCCAAAAGACUAUCCAGGAGAUGCAGCAGAAGCUGGAGGACUUCCGCGACUACCGGCGUGUGCACAAGCCGCCCAAGGUGCAGGAGAAGUGCCAGCUGGAGAUCAACUUCAACACGCUGCAGACCAAGCUGCGCCUCAGCAACCGGCCCGCCUUCAUGCCCUCCGAGGGCAAGAUGGUCUCGGACAUCAACAAUGGCUGGCAGCACUUGGAGCAGGCUGAGAAGGGCUACGAGGAGUGGCUGCUGAAUGAGAUCCGCAGGCUGGAGCGGCUCGACCACCUGGCAGAGAAGUUCCGGCAGAAGGCCUCCAUCCACGAGGCCUGGACUGACGGGAAGGAAGCCAUGCUGAAGCACCGGGACUACGAGACGGCCACACUAUCGGACAUCAAAGCCCUCAUUCGCAAGCACGAGGCCUUCGAGAGCGACCUGGCUGCGCACCAGGACCGCGUGGAGCAGAUCGCCGCCAUUGCCCAGGAGCUCAACGAGCUGGAUUACUACGACUCCCACAAUGUCAACACCCGGUGCCAGAAGAUCUGUGACCAGUGGGACGCCCUCGGCUCUCUGACACAUAGUCGCAGGGAAGCCCUGGAGAAAACAGAGAAGCAGCUGGAGGCCAUCGACCAGCUGCACCUGGAAUACGCCAAGCGCGCGGCCCCCUUCAACAACUGGAUGGAGAGCGCCAUGGAGGACCUCCAGGACAUGUUCAUCGUCCAUACCAUCGAGGAGAUUGAGGGCCUGAUCUCAGCCCAUGACCAGUUCAAGUCCACCCUGCCGGACGCCGAUAGGGAGCGCGAGGCCAUCCUGGCCAUCCACAAGGAGGCCCAGAGGAUCGCUGAGAGCAACCACAUCAAGCUGUCGGGCAGCAACCCCUACACCACCGUCACCCCGCAAAUCAUCAACUCCAAGUGGGAGAAGGUGCAGCAGCUGGUGCCAAAACGGGACCAUGCCCUCCUGGAGGAGCAGAGCAAGCAGCAGUCCAACGAGCACCUGCGCCGCCAGUUCGCCAGCCAGGCCAAUGUUGUGGGGCCCUGGAUCCAGACCAAGAUGGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-556.30 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -580.95
Frequency: 0.0000
Diversity: 383.15
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((..((((((((..(((((..((.(((((((....))))))).))((((..(((((.......(((((..((....(((((((....).))))))..((((((((((...................)))).))))))..))..))))))))))....))))(((..((..(((...))).))..)))........)))))....))))))))......))(..((((.........((((((.(((.((...((((....)))).))(((((.((((.(.((((............((((((((.....(((((((((((...((((.(((((((((.(.....((((((....)).(((((.(((((((.(.(.((......)).).).))))))).)))))............((((((((((...((((((((..(..(..(((((((..(((((.....)).)))..))))))).....)..)..)))))))).((((((...((((((...(((((..(...((((((((.((......))))))...))))..)..))))).))))))((((.....)))).....))))))......)))).)))..)))...))))).)))))).))).)))))))))))...)))))).))))))......((((((((..(((((((((..((.(((...(((....((.(.((((((((.((......)).))))((((((((..(((..((....))..)))..))))))))...(((((((.......)))))))(((((((((((((((..(((...(((...((((((..((....(.((((((.....(((....((.(((.((((............)))).))).))...)))..))))))).....))..))).)))...)))...(((((....((((((((((((...)))))(((..........)))......(((..(((..(((..((((...))))..))).))).)))(((...)))((((((........((.(((((...))))))).....)))))).((((((((..(....)..)))))))).))))).....))...))).)))))..)))))......(((((((.(((((((.(((((...)))))))...))))).))))))).....((((.....))))((((.((....))))))....)).)))..)))))...(((((.(((((.(((.((..((.(..(((.(((((((((.(((....)))))))...))))).)))..).))..))..)))..)).))).)))))...........))))).))..))).....)))))..)))))))))(((...(((((((..((((((.((.....)).))).(((((((...)))).)))..((.....)).........)))..))))))).....)))))))))))))))..).)))).)))))))).)))))).....))))..)
Thermodynamic Ensemble Prediction
((..((((((((..({{(((((,,(((((((....))))))).)..})))}{((......}}}.{,.{||,{,{..((((({..,,,|,|}}}}}..((((((((((...........,,......)))).)))))).,{|{..,,.,,,......})))}|||}||({{{....})))..,...))}.,},.,}}})))....))))))))......))(..((((........,((((((,(({,((...((((....)))}.|}(((((.((((.,.((((...........,(((((({(,.,{{{,{,(((((((...((((.(((((((((.{.....(((({{...,)).(((((.(((((((.(.(.((......)).).).))))))).))))),.....,.....((((((((((...((((((((.,(,.{..(((((((..(((((.....)).)))..))))))).......,),.)))))))).((((((...{(((((...,(((({{(..((,,,((((.((......))))))...))))}.)},),}}}.)))))}((((.....)))).....))))))......)))).)))..)))...))))}.)))))).))).))))))))))).,,}))}}}.)))))}......((((((((..(((((((((..((,(((...(((,,,{(,,(.((({((((,({......}}.}}}}((((((((..(((..((....))..)))..))))))))...(((((((.......)))))))((((({{{{({{{((..(({.{(({,..((((((((.,,.,{{{.{(({{......|||{.,.{{.,,(,((((..,(,...,..,)}}),}}}|},|.{||,,{|({{{{{{{.{,||{.,,||||||.||||.,|||,{{,...||{||||{((({...})))){,........{{{||,......}}}....}}}})}}},,,....|||||..||||}||,..,(({,,|||({({((.......,||,{||||...)))))),....,))))},.((((((((.,{....)..)))))))).}}|||.....,}},.},))),)))..}||}}......(((((((.(((((((.(((((...)))))))...))))).))))))).....{{||}}.},}})}||||,{{.,.,)))))).,,.)).}}}}.}))))...(((((.(((((.(((.((..((.(..(((.(((((((((.(((....)))))))...))))).)))..).))..))..)))..)).))).))))).........,.}},})}),..})|.,...}}}}}..}}}}}})))||,,..|||||{{,.{{((((.((.....)).))),(((((((...)))).)))..{{..,,,))..}},....})).,))))})),,,.,)))))))))))))))..,.)))).)))))))).)))))).....))))..)
Back