Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_ACTN4_0006000
Sequence Length
720 nt
GC Content
0.6250
CUCCUGGAGUGGAUCCGGCGCACCAUCCCCUGGCUGGAGGACCGUGUGCCCCAAAAGACUAUCCAGGAGAUGCAGCAGAAGCUGGAGGACUUCCGCGACUACCGGCGUGUGCACAAGCCGCCCAAGGUGCAGGAGAAGUGCCAGCUGGAGAUCAACUUCAACACGCUGCAGACCAAGCUGCGCCUCAGCAACCGGCCCGCCUUCAUGCCCUCCGAGGGCAAGAUGGUCUCGGACAUCAACAAUGGCUGGCAGCACUUGGAGCAGGCUGAGAAGGGCUACGAGGAGUGGCUGCUGAAUGAGAUCCGCAGGCUGGAGCGGCUCGACCACCUGGCAGAGAAGUUCCGGCAGAAGGCCUCCAUCCACGAGGCCUGGACUGACGGGAAGGAAGCCAUGCUGAAGCACCGGGACUACGAGACGGCCACACUAUCGGACAUCAAAGCCCUCAUUCGCAAGCACGAGGCCUUCGAGAGCGACCUGGCUGCGCACCAGGACCGCGUGGAGCAGAUCGCCGCCAUUGCCCAGGAGCUCAAGUACGUGCGGGCUCAGGACACUAUCAUCACCUGGCUCUCACCACAGCCUGCCCAGACUGGUGGCGGCAGCACGCCGAGGCCCAGCCUGCCUCAAGGCCUGGAAUAGGGUCCCCAGUGCCCCAACUGCACCUCCUUCCAGAAGCCAGGGAAGGGCCUUAUGGGAUGAGGCCUUUUGCCCAUCCUGUCUCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-284.50 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -297.23
Frequency: 0.0000
Diversity: 238.60
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((((..(..(..(((((((..(((((.....)).)))..))))))).....)..)..)))))))).((..((((..(((((((...........)).)))))((((((....((((((..((((((((......(((.(((((..((......))..)).)))))).......))))))))..((..((((((.(((.((.((((((...)))))).)).)))................))))))..))..((((.((((((((.(((((.((.(.....(((..(((.(((((((..((((((((((((((..(((..((....))..)))..))))))))...(((((((.......)))))))...))).)))...((.....(((((((((..(((...........))).....)).)))).))).....))))))))))))..)))))).)))))..((((..(((((((((...(((.(....).))).))))......((....))))))).))))......(((.((((.((((............)))))))).)))..))))))))))))...))))))....)))))).(((((.......)))))..(((((((((..((((...((((......)))).))))..))))))..))).((((((((((((((...)))))))))))..)))...))))..)).
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((((((.,(,.,..(((((((..(((((.....)).)))..))))))).......,),.)))))))).(({(((,,..({|((,{..,,||}||..,,..{((((((({{.,..((((((..{(((((((......((||(((((,,({....,,))..}}.)))))).......)))))))}..((..((((((.{{{.({.(({{{(,,,||}}|}.}}.)}),}}}},},,.......))))))..))..{(((.((((((((.{,,(((((.(..{{,((({({((.{{.,.,,.||{|||,((((((((..(((..((....))..)))..)))))))).,,(((((((..,,,..|||||||{,.{{,.|,|{,.|{.,||}.{(({{..|||{|({|,{{..,,{.|{{{{|.....|||....||.,||}||||..,|,...}...}}})}))),}}|.{||,,{|||||||.,.|||}|.,}|||))}.||,,.,|||,||||}|,}}|,}|.)))}......(((.((((.((((............)))))))).)))..))))))))))))..,))))))))).,))))))|((((,,..,,,}}|}}..|||((((({..((((...((((......)))).))))..))))))..)}),|||.,}}}))}|{{{|||||}|||}}},,)))),,))))),,)).
Back