Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_ACTN4_0007000
Sequence Length
597 nt
GC Content
0.6047
CAGAUCGCCGCCAUUGCCCAGGAGCUCAACGAGCUGGAUUACUACGACUCCCACAAUGUCAACACCCGGUGCCAGAAGAUCUGUGACCAGUGGGACGCCCUCGGCUCUCUGACACAUAGUCGCAGGGAAGCCCUGGAGAAAACAGAGAAGCAGCUGGAGGCCAUCGACCAGCUGCACCUGGAAUACGCCAAGCGCGCGGCCCCCUUCAACAACUGGAUGGAGAGCGCCAUGGAGGACCUCCAGGACAUGUUCAUCGUCCAUACCAUCGAGGAGAUUGAGGGCCUGAUCUCAGCCCAUGACCAGUUCAAGUCCACCCUGCCGGACGCCGAUAGGGAGCGCGAGGCCAUCCUGGCCAUCCACAAGGAGGCCCAGAGGAUCGCUGAGAGCAACCACAUCAAGCUGUCGGGCAGCAACCCCUACACCACCGUCACCCCGCAAAUCAUCAACUCCAAGUGGGAGAAGGUGCAGCAGCUGGUGCCAAAACGGGACCAUGCCCUCCUGGAGGAGCAGAGCAAGCAGCAGUCCAACGAGCACCUGCGCCGCCAGUUCGCCAGCCAGGCCAAUGUUGUGGGGCCCUGGAUCCAGACCAAGAUGGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-210.90 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -217.71
Frequency: 0.0000
Diversity: 112.31
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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